RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000315965.6

CCDC71L-201, Transcript of coiled-coil domain containing 71 like, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CCDC71L, Length 1,575 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC71L-201ENST00000315965 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
CCDC71L-201ENST00000315965 TRPV3Q8NET8 790 aa23■■□□□ 1.27
CCDC71L-201ENST00000315965 TCTN2Q96GX1 697 aa23■■□□□ 1.27
CCDC71L-201ENST00000315965 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa23■■□□□ 1.27
CCDC71L-201ENST00000315965 NUDT22Q9BRQ3 303 aa23■■□□□ 1.27
CCDC71L-201ENST00000315965 VPS29Q9UBQ0 182 aa23■■□□□ 1.27
CCDC71L-201ENST00000315965 PILRAQ9UKJ1 303 aa23■■□□□ 1.27
CCDC71L-201ENST00000315965 SLC12A4Q9UP95 1085 aa23■■□□□ 1.27
CCDC71L-201ENST00000315965 A0A1W2PQM1 296 aa22.99■■□□□ 1.27
CCDC71L-201ENST00000315965 NPIPB8E9PQR5 432 aa22.99■■□□□ 1.27
CCDC71L-201ENST00000315965 MAP3K7O43318 606 aa22.99■■□□□ 1.27
CCDC71L-201ENST00000315965 CLEC3AO75596 197 aa22.99■■□□□ 1.27
CCDC71L-201ENST00000315965 PRPH2P23942 346 aa22.99■■□□□ 1.27
CCDC71L-201ENST00000315965 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
CCDC71L-201ENST00000315965 CYP4F2P78329 520 aa22.99■■□□□ 1.27
CCDC71L-201ENST00000315965 GALNTL6Q49A17 601 aa22.99■■□□□ 1.27
CCDC71L-201ENST00000315965 SPDYAQ5MJ70 313 aa22.99■■□□□ 1.27
CCDC71L-201ENST00000315965 RNF44Q7L0R7 432 aa22.99■■□□□ 1.27
CCDC71L-201ENST00000315965 CMTM7Q96FZ5 175 aa22.99■■□□□ 1.27
CCDC71L-201ENST00000315965 SERPINI1Q99574 410 aa22.99■■□□□ 1.27
CCDC71L-201ENST00000315965 LRTM1Q9HBL6 345 aa22.99■■□□□ 1.27
CCDC71L-201ENST00000315965 GIMAP2Q9UG22 337 aa22.99■■□□□ 1.27
CCDC71L-201ENST00000315965 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
CCDC71L-201ENST00000315965 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa22.98■■□□□ 1.27
CCDC71L-201ENST00000315965 A0A0J9YVX5 310 aa22.98■■□□□ 1.27
CCDC71L-201ENST00000315965 DCTN3O75935 186 aa22.98■■□□□ 1.27
CCDC71L-201ENST00000315965 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
CCDC71L-201ENST00000315965 TGFB1P01137 390 aa22.98■■□□□ 1.27
CCDC71L-201ENST00000315965 AP5B1Q2VPB7 878 aa22.98■■□□□ 1.27
CCDC71L-201ENST00000315965 C6orf136Q5SQH8 315 aa22.98■■□□□ 1.27
CCDC71L-201ENST00000315965 OGFOD2Q6N063 350 aa22.98■■□□□ 1.27
CCDC71L-201ENST00000315965 OR2A5Q96R48 311 aa22.98■■□□□ 1.27
CCDC71L-201ENST00000315965 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa22.98■■□□□ 1.27
CCDC71L-201ENST00000315965 C1orf109Q9NX04 203 aa22.98■■□□□ 1.27
CCDC71L-201ENST00000315965 TMEM9Q9P0T7 183 aa22.98■■□□□ 1.27
CCDC71L-201ENST00000315965 SEMA5BQ9P283 1151 aa22.98■■□□□ 1.27
CCDC71L-201ENST00000315965 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
CCDC71L-201ENST00000315965 PRAMEF10O60809 474 aa22.97■■□□□ 1.27
CCDC71L-201ENST00000315965 CCDC22O60826 627 aa22.97■■□□□ 1.27
CCDC71L-201ENST00000315965 SERPINA6P08185 405 aa22.97■■□□□ 1.27
CCDC71L-201ENST00000315965 SMU1Q2TAY7 513 aa22.97■■□□□ 1.27
CCDC71L-201ENST00000315965 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
CCDC71L-201ENST00000315965 PRSS42Q7Z5A4 293 aa22.97■■□□□ 1.27
CCDC71L-201ENST00000315965 FNDC5Q8NAU1 212 aa22.97■■□□□ 1.27
CCDC71L-201ENST00000315965 CREB3L4Q8TEY5 395 aa22.97■■□□□ 1.27
CCDC71L-201ENST00000315965 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
CCDC71L-201ENST00000315965 FCRL4Q96PJ5 515 aa22.97■■□□□ 1.27
CCDC71L-201ENST00000315965 CDC6Q99741 560 aa22.97■■□□□ 1.27
CCDC71L-201ENST00000315965 MS4A8Q9BY19 250 aa22.97■■□□□ 1.27
CCDC71L-201ENST00000315965 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa22.97■■□□□ 1.27
CCDC71L-201ENST00000315965 SOHLH2Q9NX45 425 aa22.97■■□□□ 1.27
CCDC71L-201ENST00000315965 UBDO15205 165 aa22.97■■□□□ 1.27
CCDC71L-201ENST00000315965 CASC3O15234 703 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
CCDC71L-201ENST00000315965 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
CCDC71L-201ENST00000315965 CBFA2T3O75081 653 aa22.97■■□□□ 1.27
CCDC71L-201ENST00000315965 SEC22BO75396 215 aa22.97■■□□□ 1.27
CCDC71L-201ENST00000315965 ETHE1O95571 254 aa22.97■■□□□ 1.27
CCDC71L-201ENST00000315965 SERPIND1P05546 499 aa22.97■■□□□ 1.27
CCDC71L-201ENST00000315965 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
CCDC71L-201ENST00000315965 ERVK-8P63133 956 aa22.97■■□□□ 1.27
CCDC71L-201ENST00000315965 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
CCDC71L-201ENST00000315965 CUL3Q13618 768 aa22.97■■□□□ 1.27
CCDC71L-201ENST00000315965 CHSY3Q70JA7 882 aa22.97■■□□□ 1.27
CCDC71L-201ENST00000315965 SPATA19Q7Z5L4 167 aa22.97■■□□□ 1.27
CCDC71L-201ENST00000315965 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
CCDC71L-201ENST00000315965 ZFAND4Q86XD8 727 aa22.97■■□□□ 1.27
CCDC71L-201ENST00000315965 KMT5CQ86Y97 462 aa22.97■■□□□ 1.27
CCDC71L-201ENST00000315965 OR4D9Q8NGE8 314 aa22.97■■□□□ 1.27
CCDC71L-201ENST00000315965 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
CCDC71L-201ENST00000315965 OR51B5Q9H339 312 aa22.97■■□□□ 1.27
CCDC71L-201ENST00000315965 PDE7BQ9NP56 450 aa22.97■■□□□ 1.27
CCDC71L-201ENST00000315965 NDUFS4O43181 175 aa22.96■■□□□ 1.27
CCDC71L-201ENST00000315965 GDF9O60383 454 aa22.96■■□□□ 1.27
CCDC71L-201ENST00000315965 SH3BGRLO75368 114 aa22.96■■□□□ 1.27
CCDC71L-201ENST00000315965 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
CCDC71L-201ENST00000315965 EMX2Q04743 252 aa22.96■■□□□ 1.27
CCDC71L-201ENST00000315965 SNAP47Q5SQN1 464 aa22.96■■□□□ 1.27
CCDC71L-201ENST00000315965 STPG1Q5TH74 334 aa22.96■■□□□ 1.27
CCDC71L-201ENST00000315965 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
CCDC71L-201ENST00000315965 TMEM198Q66K66 360 aa22.96■■□□□ 1.27
CCDC71L-201ENST00000315965 ASPGQ86U10 573 aa22.96■■□□□ 1.27
CCDC71L-201ENST00000315965 SLC13A3Q8WWT9 602 aa22.96■■□□□ 1.27
CCDC71L-201ENST00000315965 LRRC37BQ96QE4 947 aa22.96■■□□□ 1.27
CCDC71L-201ENST00000315965 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
CCDC71L-201ENST00000315965 CENPKQ9BS16 269 aa22.96■■□□□ 1.27
CCDC71L-201ENST00000315965 FAM60AQ9NP50 221 aa22.96■■□□□ 1.27
CCDC71L-201ENST00000315965 TMED5Q9Y3A6 229 aa22.96■■□□□ 1.27
CCDC71L-201ENST00000315965 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
CCDC71L-201ENST00000315965 ARL4DP49703 201 aa22.95■■□□□ 1.26
CCDC71L-201ENST00000315965 RPL38P63173 70 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
CCDC71L-201ENST00000315965 PWP1Q13610 501 aa22.95■■□□□ 1.26
CCDC71L-201ENST00000315965 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
CCDC71L-201ENST00000315965 SPIN4Q56A73 249 aa22.95■■□□□ 1.26
CCDC71L-201ENST00000315965 DEPDC1Q5TB30 811 aa22.95■■□□□ 1.26
CCDC71L-201ENST00000315965 VN1R4Q7Z5H5 301 aa22.95■■□□□ 1.26
CCDC71L-201ENST00000315965 DNAJC22Q8N4W6 341 aa22.95■■□□□ 1.26
CCDC71L-201ENST00000315965 WDR48Q8TAF3 677 aa22.95■■□□□ 1.26
CCDC71L-201ENST00000315965 APIPQ96GX9 242 aa22.95■■□□□ 1.26
CCDC71L-201ENST00000315965 SYNPO2LQ9H987 977 aa22.95■■□□□ 1.26
CCDC71L-201ENST00000315965 PDP2Q9P2J9 529 aa22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.8 ms