RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296642.4

PGGT1B-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 552 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-201ENST00000296642 PRSS21Q9Y6M0 314 aa7.39□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 SCN2AQ99250 2005 aa7.39□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 A0A1B0GTH6 734 aa7.38□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 MAGEB17A8MXT2 336 aa7.38□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 AKR1B10O60218 316 aa7.38□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 MED26O95402 600 aa7.38□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 C1orf105O95561 183 aa7.38□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 IFNA2P01563 188 aa7.38□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 PTMAP06454 111 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 TPM3P06753 285 aa7.38□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 PSMB5P28074 263 aa7.38□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 HOXC12P31275 282 aa7.38□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 GRK3P35626 688 aa7.38□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 TTPAP49638 278 aa7.38□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC26A5P58743 744 aa7.38□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 DCAF7P61962 342 aa7.38□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 GRB7Q14451 532 aa7.38□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 USP10Q14694 798 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 POU6F1Q14863 301 aa7.38□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP7.38□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 PHKG1Q16816 387 aa7.38□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 SYT16Q17RD7 645 aa7.38□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 CMPK2Q5EBM0 449 aa7.38□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa7.38□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa7.38□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 ICE2Q659A1 982 aa7.38□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 CAPN12Q6ZSI9 719 aa7.38□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 CHSY3Q70JA7 882 aa7.38□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 FGD2Q7Z6J4 655 aa7.38□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 LRRC6Q86X45 466 aa7.38□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 CPNE8Q86YQ8 564 aa7.38□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa7.38□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 CAMKVQ8NCB2 501 aa7.38□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 OR6P1Q8NGX9 317 aa7.38□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 OR4L1Q8NH43 312 aa7.38□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 THAP11Q96EK4 314 aa7.38□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 OR2A5Q96R48 311 aa7.38□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 SMC6Q96SB8 1091 aa7.38□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 CCDC77Q9BR77 488 aa7.38□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 YIPF4Q9BSR8 244 aa7.38□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 LIME1Q9H400 295 aa7.38□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 EXO5Q9H790 373 aa7.38□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 CRIM1Q9NZV1 1036 aa7.38□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 CIDEBQ9UHD4 219 aa7.38□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 PCYOX1Q9UHG3 505 aa7.38□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 ACAD8Q9UKU7 415 aa7.38□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa7.37□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 TUBAL3A6NHL2 446 aa7.37□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 SYT5O00445 386 aa7.37□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNHIT1O43257 154 aa7.37□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 FOXS1O43638 330 aa7.37□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 PDE9AO76083 593 aa7.37□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 ATE1O95260 518 aa7.37□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 CATP04040 527 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 TPM1P09493 284 aa7.37□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC35G6P0C7Q6 338 aa7.37□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 PRSS56P0CW18 603 aa7.37□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 RBP3P10745 1247 aa7.37□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 EPXP11678 715 aa7.37□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 AOAHP28039 575 aa7.37□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 FOXN2P32314 431 aa7.37□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 BCL6P41182 706 aa7.37□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 ASCL1P50553 236 aa7.37□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 CLCN2P51788 898 aa7.37□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 MLF1P58340 268 aa7.37□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 COPS2P61201 443 aa7.37□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 PPIAP62937 165 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 TYRO3Q06418 890 aa7.37□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 PARP6Q2NL67 630 aa7.37□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 RNFT1Q5M7Z0 435 aa7.37□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa7.37□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 GK5Q6ZS86 529 aa7.37□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 BBS12Q6ZW61 710 aa7.37□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 PRIMA1Q86XR5 153 aa7.37□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa7.37□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 TBC1D19Q8N5T2 526 aa7.37□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 OR9A1PQ8NGU1 263 aa7.37□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 OR9A4Q8NGU2 314 aa7.37□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 ELP5Q8TE02 316 aa7.37□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 PIGTQ969N2 578 aa7.37□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 SMR3AQ99954 134 aa7.37□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 BPIFA3Q9BQP9 254 aa7.37□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 ATG10Q9H0Y0 220 aa7.37□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 DEFB127Q9H1M4 99 aa7.37□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 LDAHQ9H6V9 325 aa7.37□□□□□ -1.23
PGGT1B-201ENST00000296642 DMRT3Q9NQL9 472 aa7.37□□□□□ -1.23
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