RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295987.12

SYN1-201, Transcript of synapsin I, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene SYN1, Length 3,299 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYN1-201ENST00000295987 TMEM9Q9P0T7 183 aa14.96□□□□□ -0.02
SYN1-201ENST00000295987 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa14.96□□□□□ -0.02
SYN1-201ENST00000295987 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa14.96□□□□□ -0.02
SYN1-201ENST00000295987 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
SYN1-201ENST00000295987 TRIM64A6NGJ6 449 aa14.95□□□□□ -0.02
SYN1-201ENST00000295987 LEFTY1O75610 366 aa14.95□□□□□ -0.02
SYN1-201ENST00000295987 PFN3P60673 137 aa14.95□□□□□ -0.02
SYN1-201ENST00000295987 DAB2P98082 770 aa14.95□□□□□ -0.02
SYN1-201ENST00000295987 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP14.95□□□□□ -0.02
SYN1-201ENST00000295987 NPRL3Q12980 569 aa14.95□□□□□ -0.02
SYN1-201ENST00000295987 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
SYN1-201ENST00000295987 ZNF846Q147U1 533 aa14.95□□□□□ -0.02
SYN1-201ENST00000295987 MED22Q15528 200 aa14.95□□□□□ -0.02
SYN1-201ENST00000295987 DGUOKQ16854 277 aa14.95□□□□□ -0.02
SYN1-201ENST00000295987 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa14.95□□□□□ -0.02
SYN1-201ENST00000295987 TMEM220Q6QAJ8 160 aa14.95□□□□□ -0.02
SYN1-201ENST00000295987 HEATR4Q86WZ0 1026 aa14.95□□□□□ -0.02
SYN1-201ENST00000295987 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
SYN1-201ENST00000295987 STX19Q8N4C7 294 aa14.95□□□□□ -0.02
SYN1-201ENST00000295987 POC5Q8NA72 575 aa14.95□□□□□ -0.02
SYN1-201ENST00000295987 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
SYN1-201ENST00000295987 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
SYN1-201ENST00000295987 ASB11Q8WXH4 323 aa14.95□□□□□ -0.02
SYN1-201ENST00000295987 SCRN2Q96FV2 425 aa14.95□□□□□ -0.02
SYN1-201ENST00000295987 CCDC115Q96NT0 180 aa14.95□□□□□ -0.02
SYN1-201ENST00000295987 PKP4Q99569 1192 aa14.95□□□□□ -0.02
SYN1-201ENST00000295987 TUBA1CQ9BQE3 449 aa14.95□□□□□ -0.02
SYN1-201ENST00000295987 OR51E2Q9H255 320 aa14.95□□□□□ -0.02
SYN1-201ENST00000295987 C11orf49Q9H6J7 331 aa14.95□□□□□ -0.02
SYN1-201ENST00000295987 IL1RAPQ9NPH3 570 aa14.95□□□□□ -0.02
SYN1-201ENST00000295987 IMPAD1Q9NX62 359 aa14.95□□□□□ -0.02
SYN1-201ENST00000295987 SH2B3Q9UQQ2 575 aa14.95□□□□□ -0.02
SYN1-201ENST00000295987 WNT6Q9Y6F9 365 aa14.95□□□□□ -0.02
SYN1-201ENST00000295987 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
SYN1-201ENST00000295987 LEFTY2O00292 366 aa14.95□□□□□ -0.02
SYN1-201ENST00000295987 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
SYN1-201ENST00000295987 PTPN6P29350 595 aa14.95□□□□□ -0.02
SYN1-201ENST00000295987 HOXA9P31269 272 aa14.95□□□□□ -0.02
SYN1-201ENST00000295987 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
SYN1-201ENST00000295987 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
SYN1-201ENST00000295987 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
SYN1-201ENST00000295987 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
SYN1-201ENST00000295987 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa14.95□□□□□ -0.02
SYN1-201ENST00000295987 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
SYN1-201ENST00000295987 DCSTAMPQ9H295 470 aa14.95□□□□□ -0.02
SYN1-201ENST00000295987 C8orf4Q9NR00 106 aa14.95□□□□□ -0.02
SYN1-201ENST00000295987 USE1Q9NZ43 259 aa14.95□□□□□ -0.02
SYN1-201ENST00000295987 WNT9AO14904 365 aa14.95□□□□□ -0.02
SYN1-201ENST00000295987 RETP07949 1114 aa14.95□□□□□ -0.02
SYN1-201ENST00000295987 PRPS2P11908 318 aa14.95□□□□□ -0.02
SYN1-201ENST00000295987 ZNF12P17014 697 aa14.95□□□□□ -0.02
SYN1-201ENST00000295987 SPINT3P49223 89 aa14.95□□□□□ -0.02
SYN1-201ENST00000295987 GRIN2CQ14957 1233 aa14.95□□□□□ -0.02
SYN1-201ENST00000295987 INAVAQ3KP66 663 aa14.95□□□□□ -0.02
SYN1-201ENST00000295987 LEXMQ3ZCV2 418 aa14.95□□□□□ -0.02
SYN1-201ENST00000295987 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
SYN1-201ENST00000295987 HUS1BQ8NHY5 278 aa14.95□□□□□ -0.02
SYN1-201ENST00000295987 CMTM7Q96FZ5 175 aa14.95□□□□□ -0.02
SYN1-201ENST00000295987 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa14.95□□□□□ -0.02
SYN1-201ENST00000295987 SLC46A2Q9BY10 475 aa14.95□□□□□ -0.02
SYN1-201ENST00000295987 CWH43Q9H720 699 aa14.95□□□□□ -0.02
SYN1-201ENST00000295987 C11orf16Q9NQ32 467 aa14.95□□□□□ -0.02
SYN1-201ENST00000295987 RGS5O15539 181 aa14.94□□□□□ -0.02
SYN1-201ENST00000295987 AIREO43918 545 aa14.94□□□□□ -0.02
SYN1-201ENST00000295987 UGT2B11O75310 529 aa14.94□□□□□ -0.02
SYN1-201ENST00000295987 NME6O75414 186 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
SYN1-201ENST00000295987 HPRP00739 348 aa14.94□□□□□ -0.02
SYN1-201ENST00000295987 TPTEP56180 551 aa14.94□□□□□ -0.02
SYN1-201ENST00000295987 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
SYN1-201ENST00000295987 CDKN3Q16667 212 aa14.94□□□□□ -0.02
SYN1-201ENST00000295987 SPATC1Q76KD6 591 aa14.94□□□□□ -0.02
SYN1-201ENST00000295987 UBE2J2Q8N2K1 259 aa14.94□□□□□ -0.02
SYN1-201ENST00000295987 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
SYN1-201ENST00000295987 SETD9Q8NE22 299 aa14.94□□□□□ -0.02
SYN1-201ENST00000295987 WDR48Q8TAF3 677 aa14.94□□□□□ -0.02
SYN1-201ENST00000295987 LZICQ8WZA0 190 aa14.94□□□□□ -0.02
SYN1-201ENST00000295987 RAB8BQ92930 207 aa14.94□□□□□ -0.02
SYN1-201ENST00000295987 DUSP12Q9UNI6 340 aa14.94□□□□□ -0.02
SYN1-201ENST00000295987 PRR23AA6NEV1 266 aa14.94□□□□□ -0.02
SYN1-201ENST00000295987 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
SYN1-201ENST00000295987 KLK1P06870 262 aa14.94□□□□□ -0.02
SYN1-201ENST00000295987 HLA-EP13747 358 aa14.94□□□□□ -0.02
SYN1-201ENST00000295987 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
SYN1-201ENST00000295987 GZMMP51124 257 aa14.94□□□□□ -0.02
SYN1-201ENST00000295987 C2orf80Q0P641 193 aa14.94□□□□□ -0.02
SYN1-201ENST00000295987 GPR33Q49SQ1 333 aa14.94□□□□□ -0.02
SYN1-201ENST00000295987 ZNF385BQ569K4 471 aa14.94□□□□□ -0.02
SYN1-201ENST00000295987 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
SYN1-201ENST00000295987 CHPFQ8IZ52 775 aa14.94□□□□□ -0.02
SYN1-201ENST00000295987 NEIL2Q969S2 332 aa14.94□□□□□ -0.02
SYN1-201ENST00000295987 ZNF347Q96SE7 839 aa14.94□□□□□ -0.02
SYN1-201ENST00000295987 HEPHQ9BQS7 1158 aa14.94□□□□□ -0.02
SYN1-201ENST00000295987 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
SYN1-201ENST00000295987 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
SYN1-201ENST00000295987 ACOT13Q9NPJ3 140 aa14.94□□□□□ -0.02
SYN1-201ENST00000295987 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa14.93□□□□□ -0.02
SYN1-201ENST00000295987 SULT1C4O75897 302 aa14.93□□□□□ -0.02
SYN1-201ENST00000295987 ALPPL2P10696 532 aa14.93□□□□□ -0.02
SYN1-201ENST00000295987 CKMT1AP12532 417 aa14.93□□□□□ -0.02
SYN1-201ENST00000295987 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.3 ms