RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000292535.11

CUX1-201, Transcript of cut like homeobox 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CUX1, Length 13,747 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUX1-201ENST00000292535 CLIC1O00299 241 aa9.07□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 OR2B6P58173 313 aa9.07□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP9.07□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 ZNF550Q7Z398 422 aa9.07□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 LRTOMTQ8WZ04 291 aa9.07□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 PYURFQ96I23 114 aa9.07□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 SLC29A3Q9BZD2 475 aa9.07□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa9.07□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 OR4Q2P0C623 313 aa9.07□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP9.07□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP9.07□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP9.07□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 HMGB4Q8WW32 186 aa9.07□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 PSMG2Q969U7 264 aa9.07□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 ARMC5Q96C12 935 aa9.07□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 CAPNS2Q96L46 248 aa9.07□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 ZNF285Q96NJ3 590 aa9.07□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 FNIP2Q9P278 1114 aa9.07□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 FBP2O00757 339 aa9.07□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 RAD51DO75771 328 aa9.07□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 SASH3O75995 380 aa9.07□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 H6PDO95479 791 aa9.07□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 MON1BQ7L1V2 547 aa9.07□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 FTMTQ8N4E7 242 aa9.07□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 C1orf127Q8N9H9 656 aa9.07□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 TNFRSF25Q93038 417 aa9.07□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 POU2F3Q9UKI9 436 aa9.07□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 SOX30O94993 753 aa9.07□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 OAS1P00973 400 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 ERP29P30040 261 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 CSKP41240 450 aa9.07□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 TAS2R43P59537 309 aa9.07□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 KCNC3Q14003 757 aa9.07□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP9.07□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 GANABQ14697 944 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 OTOP2Q7RTS6 562 aa9.07□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 OSBPL2Q9H1P3 480 aa9.07□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 INSL6Q9Y581 213 aa9.07□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa9.06□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 BCL9O00512 1426 aa9.06□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 HRH2P25021 359 aa9.06□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 ADAM17P78536 824 aa9.06□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 GALK2Q01415 458 aa9.06□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 ECH1Q13011 328 aa9.06□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 GID4Q8IVV7 300 aa9.06□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 NLGN2Q8NFZ4 835 aa9.06□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 POC1BQ8TC44 478 aa9.06□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa9.06□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 NOBOXO60393 691 aa9.06□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 OR5B12Q96R08 314 aa9.06□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 RIMKLBQ9ULI2 386 aa9.06□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa9.06□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 SMPD1P17405 629 aa9.06□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 CFL1P23528 166 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 SLC3A1Q07837 685 aa9.06□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 LRRN4CLQ8ND94 238 aa9.06□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 ABHD5Q8WTS1 349 aa9.06□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa9.06□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 RBP7Q96R05 134 aa9.06□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa9.06□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 PRLP01236 227 aa9.06□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 ST3GAL3Q11203 375 aa9.06□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 TBX5Q99593 518 aa9.06□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 RMI1Q9H9A7 625 aa9.06□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 ASB6Q9NWX5 421 aa9.06□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 MKS1Q9NXB0 559 aa9.06□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 CD36P16671 472 aa9.06□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 CCNOP22674 350 aa9.06□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 BEND4Q6ZU67 534 aa9.06□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 GPRC5BQ9NZH0 403 aa9.06□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 AQP12BA6NM10 295 aa9.06□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 PEX2P28328 305 aa9.06□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 LCN1P31025 176 aa9.06□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 DGKEP52429 567 aa9.06□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 CDH11P55287 796 aa9.06□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 DPYSL2Q16555 572 aa9.06□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 AQP12AQ8IXF9 295 aa9.06□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 OR6N1Q8NGY5 312 aa9.06□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP9.06□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP9.06□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 SPRYD7Q5W111 196 aa9.06□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 SHKBP1Q8TBC3 707 aa9.06□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 BORCS7Q96B45 105 aa9.06□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 SIPA1Q96FS4 1042 aa9.06□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 FUZQ9BT04 418 aa9.06□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 PDE7BQ9NP56 450 aa9.06□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 RNF19AQ9NV58 838 aa9.06□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 TAC3Q9UHF0 121 aa9.06□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 FZD4Q9ULV1 537 aa9.06□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 DEPDC5O75140 1603 aa9.06□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 H7C417 338 aa9.06□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 AOC2O75106 756 aa9.06□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.6 ms