RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000290921.10

CTBP1-201, Transcript of C-terminal binding protein 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CTBP1, Length 2,297 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP1-201ENST00000290921 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa24.37■■□□□ 1.49
CTBP1-201ENST00000290921 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
CTBP1-201ENST00000290921 YIPF2Q9BWQ6 316 aa24.37■■□□□ 1.49
CTBP1-201ENST00000290921 BTBD3Q9Y2F9 522 aa24.37■■□□□ 1.49
CTBP1-201ENST00000290921 PTTG1O95997 202 aa24.36■■□□□ 1.49
CTBP1-201ENST00000290921 JUPP14923 745 aa24.36■■□□□ 1.49
CTBP1-201ENST00000290921 PRKCDQ05655 676 aa24.36■■□□□ 1.49
CTBP1-201ENST00000290921 LRIT3Q3SXY7 679 aa24.36■■□□□ 1.49
CTBP1-201ENST00000290921 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
CTBP1-201ENST00000290921 LRRC66Q68CR7 880 aa24.36■■□□□ 1.49
CTBP1-201ENST00000290921 VRK3Q8IV63 474 aa24.36■■□□□ 1.49
CTBP1-201ENST00000290921 KBTBD8Q8NFY9 601 aa24.36■■□□□ 1.49
CTBP1-201ENST00000290921 MAL2Q969L2 176 aa24.36■■□□□ 1.49
CTBP1-201ENST00000290921 ATG10Q9H0Y0 220 aa24.36■■□□□ 1.49
CTBP1-201ENST00000290921 OR51E2Q9H255 320 aa24.36■■□□□ 1.49
CTBP1-201ENST00000290921 RAD18Q9NS91 495 aa24.36■■□□□ 1.49
CTBP1-201ENST00000290921 GPR83Q9NYM4 423 aa24.36■■□□□ 1.49
CTBP1-201ENST00000290921 PADI2Q9Y2J8 665 aa24.36■■□□□ 1.49
CTBP1-201ENST00000290921 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa24.36■■□□□ 1.49
CTBP1-201ENST00000290921 TNFRSF11BO00300 401 aa24.36■■□□□ 1.49
CTBP1-201ENST00000290921 ASNA1O43681 348 aa24.36■■□□□ 1.49
CTBP1-201ENST00000290921 TLL1O43897 1013 aa24.36■■□□□ 1.49
CTBP1-201ENST00000290921 STSP08842 583 aa24.36■■□□□ 1.49
CTBP1-201ENST00000290921 DGKKQ5KSL6 1271 aa24.36■■□□□ 1.49
CTBP1-201ENST00000290921 DESI1Q6ICB0 168 aa24.36■■□□□ 1.49
CTBP1-201ENST00000290921 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
CTBP1-201ENST00000290921 P2RY13Q9BPV8 354 aa24.36■■□□□ 1.49
CTBP1-201ENST00000290921 DOHHQ9BU89 302 aa24.36■■□□□ 1.49
CTBP1-201ENST00000290921 DUSP26Q9BV47 211 aa24.36■■□□□ 1.49
CTBP1-201ENST00000290921 BBS2Q9BXC9 721 aa24.36■■□□□ 1.49
CTBP1-201ENST00000290921 CEP44Q9C0F1 390 aa24.36■■□□□ 1.49
CTBP1-201ENST00000290921 CHST8Q9H2A9 424 aa24.36■■□□□ 1.49
CTBP1-201ENST00000290921 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
CTBP1-201ENST00000290921 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa24.36■■□□□ 1.49
CTBP1-201ENST00000290921 ALOX12P18054 663 aa24.35■■□□□ 1.49
CTBP1-201ENST00000290921 RCVRNP35243 200 aa24.35■■□□□ 1.49
CTBP1-201ENST00000290921 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP24.35■■□□□ 1.496e-7■■■□□ 15.2
CTBP1-201ENST00000290921 TPGS2Q68CL5 300 aa24.35■■□□□ 1.49
CTBP1-201ENST00000290921 TPRG1Q6ZUI0 275 aa24.35■■□□□ 1.49
CTBP1-201ENST00000290921 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
CTBP1-201ENST00000290921 FAM217AQ8IXS0 508 aa24.35■■□□□ 1.49
CTBP1-201ENST00000290921 OR2AP1Q8NGE2 309 aa24.35■■□□□ 1.49
CTBP1-201ENST00000290921 SPPL2AQ8TCT8 520 aa24.35■■□□□ 1.49
CTBP1-201ENST00000290921 ASIC4Q96FT7 647 aa24.35■■□□□ 1.49
CTBP1-201ENST00000290921 HOXD1Q9GZZ0 328 aa24.35■■□□□ 1.49
CTBP1-201ENST00000290921 EHD1Q9H4M9 534 aa24.35■■□□□ 1.49
CTBP1-201ENST00000290921 QPCTLQ9NXS2 382 aa24.35■■□□□ 1.49
CTBP1-201ENST00000290921 VPS29Q9UBQ0 182 aa24.35■■□□□ 1.49
CTBP1-201ENST00000290921 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
CTBP1-201ENST00000290921 CLEC4EQ9ULY5 219 aa24.35■■□□□ 1.49
CTBP1-201ENST00000290921 TMEM229AB2RXF0 380 aa24.35■■□□□ 1.49
CTBP1-201ENST00000290921 OR56A5P0C7T3 313 aa24.35■■□□□ 1.49
CTBP1-201ENST00000290921 IDH2P48735 452 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
CTBP1-201ENST00000290921 HEATR4Q86WZ0 1026 aa24.35■■□□□ 1.49
CTBP1-201ENST00000290921 METTL4Q8N3J2 472 aa24.35■■□□□ 1.49
CTBP1-201ENST00000290921 SLC5A8Q8N695 610 aa24.35■■□□□ 1.49
CTBP1-201ENST00000290921 TET1Q8NFU7 2136 aa24.35■■□□□ 1.49
CTBP1-201ENST00000290921 SPATA9Q9BWV2 254 aa24.35■■□□□ 1.49
CTBP1-201ENST00000290921 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa24.35■■□□□ 1.49
CTBP1-201ENST00000290921 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa24.34■■□□□ 1.49
CTBP1-201ENST00000290921 HAT1O14929 419 aa24.34■■□□□ 1.49
CTBP1-201ENST00000290921 ADORA3P0DMS8 318 aa24.34■■□□□ 1.49
CTBP1-201ENST00000290921 LMAN2Q12907 356 aa24.34■■□□□ 1.49
CTBP1-201ENST00000290921 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
CTBP1-201ENST00000290921 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP24.34■■□□□ 1.497e-8■■□□□ 12
CTBP1-201ENST00000290921 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
CTBP1-201ENST00000290921 TXNDC8Q6A555 127 aa24.34■■□□□ 1.49
CTBP1-201ENST00000290921 RFLNAQ6ZTI6 216 aa24.34■■□□□ 1.49
CTBP1-201ENST00000290921 STX19Q8N4C7 294 aa24.34■■□□□ 1.49
CTBP1-201ENST00000290921 VOPP1Q96AW1 172 aa24.34■■□□□ 1.49
CTBP1-201ENST00000290921 SCRN2Q96FV2 425 aa24.34■■□□□ 1.49
CTBP1-201ENST00000290921 IGSF21Q96ID5 467 aa24.34■■□□□ 1.49
CTBP1-201ENST00000290921 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
CTBP1-201ENST00000290921 KLHL3Q9UH77 587 aa24.34■■□□□ 1.49
CTBP1-201ENST00000290921 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
CTBP1-201ENST00000290921 PXNP49023 591 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
CTBP1-201ENST00000290921 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
CTBP1-201ENST00000290921 IRF8Q02556 426 aa24.33■■□□□ 1.49
CTBP1-201ENST00000290921 RGNQ15493 299 aa24.33■■□□□ 1.49
CTBP1-201ENST00000290921 FBXO43Q4G163 708 aa24.33■■□□□ 1.49
CTBP1-201ENST00000290921 ARMCX4Q5H9R4 360 aa24.33■■□□□ 1.49
CTBP1-201ENST00000290921 ZNF605Q86T29 641 aa24.33■■□□□ 1.49
CTBP1-201ENST00000290921 OR10G2Q8NGC3 310 aa24.33■■□□□ 1.49
CTBP1-201ENST00000290921 COL21A1Q96P44 957 aa24.33■■□□□ 1.49
CTBP1-201ENST00000290921 CENPOQ9BU64 300 aa24.33■■□□□ 1.49
CTBP1-201ENST00000290921 ABCB8Q9NUT2 735 aa24.33■■□□□ 1.49
CTBP1-201ENST00000290921 RLIMQ9NVW2 624 aa24.33■■□□□ 1.49
CTBP1-201ENST00000290921 ZNF226Q9NYT6 803 aa24.33■■□□□ 1.49
CTBP1-201ENST00000290921 NDUFAF4Q9P032 175 aa24.33■■□□□ 1.49
CTBP1-201ENST00000290921 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
CTBP1-201ENST00000290921 PSMD11O00231 422 aa24.33■■□□□ 1.49
CTBP1-201ENST00000290921 PTHP01270 115 aa24.33■■□□□ 1.49
CTBP1-201ENST00000290921 CD22P20273 847 aa24.33■■□□□ 1.49
CTBP1-201ENST00000290921 PFN3P60673 137 aa24.33■■□□□ 1.49
CTBP1-201ENST00000290921 PTSQ03393 145 aa24.33■■□□□ 1.49
CTBP1-201ENST00000290921 RAD9AQ99638 391 aa24.33■■□□□ 1.49
CTBP1-201ENST00000290921 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa24.33■■□□□ 1.49
CTBP1-201ENST00000290921 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
CTBP1-201ENST00000290921 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa24.33■■□□□ 1.49
CTBP1-201ENST00000290921 ADAMDEC1O15204 470 aa24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.4 ms