RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000285896.10

CNOT8-201, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 8, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNOT8, Length 2,528 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT8-201ENST00000285896 METRNLQ641Q3 311 aa14.92□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 TMEM92Q6UXU6 159 aa14.92□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 ZFAND4Q86XD8 727 aa14.92□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 SNX29P2Q8IUI4 249 aa14.92□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 ABHD11Q8NFV4 315 aa14.92□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 LRCH3Q96II8 777 aa14.92□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 SIAEQ9HAT2 523 aa14.92□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 FZD3Q9NPG1 666 aa14.92□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 ITM2CQ9NQX7 267 aa14.92□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 PSME2Q9UL46 239 aa14.92□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 SEC14L2O76054 403 aa14.91□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 GSSP48637 474 aa14.91□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 CCT8P50990 548 aa14.91□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 TBPL1P62380 186 aa14.91□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 PPP2CBP62714 309 aa14.91□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 PPP2CAP67775 309 aa14.91□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 IFITM3Q01628 133 aa14.91□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 PCDH1Q08174 1060 aa14.91□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 CCINQ13939 588 aa14.91□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 DOC2AQ14183 400 aa14.91□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 CACHD1Q5VU97 1274 aa14.91□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 SPRED1Q7Z699 444 aa14.91□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 SPPL2CQ8IUH8 684 aa14.91□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 FAM3CQ92520 227 aa14.91□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 ZNF347Q96SE7 839 aa14.91□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 ACTL8Q9H568 366 aa14.91□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 IL1RL2Q9HB29 575 aa14.91□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 POU2F3Q9UKI9 436 aa14.91□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 NOX1Q9Y5S8 564 aa14.91□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 KCNE2Q9Y6J6 123 aa14.91□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 SHISA7A6NL88 538 aa14.91□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 EI24O14681 340 aa14.91□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 ANKRD28O15084 1053 aa14.91□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 SLC31A1O15431 190 aa14.91□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 C7P10643 843 aa14.91□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 NDUFV2P19404 249 aa14.91□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 CD72P21854 359 aa14.91□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 HPCAL1P37235 193 aa14.91□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP14.91□□□□□ -0.028e-11■□□□□ 8.7
CNOT8-201ENST00000285896 TIGD2Q4W5G0 525 aa14.91□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 CD320Q9NPF0 282 aa14.91□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 ASIC5Q9NY37 505 aa14.91□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 ASPDHA6ND91 283 aa14.9□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 EEDO75530 441 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 RASAL1O95294 804 aa14.9□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 OXTRP30559 389 aa14.9□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 CAPGP40121 348 aa14.9□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 HNF4AP41235 474 aa14.9□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa14.9□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 GRHL2Q6ISB3 625 aa14.9□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 PIWIL3Q7Z3Z3 882 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa14.9□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa14.9□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 DHRSXQ8N5I4 330 aa14.9□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 OR5AR1Q8NGP9 310 aa14.9□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 MSANTD3Q96H12 275 aa14.9□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 CTRCQ99895 268 aa14.9□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 MYOCQ99972 504 aa14.9□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 C9orf16Q9BUW7 83 aa14.9□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 LHPPQ9H008 270 aa14.9□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 GPRC5BQ9NZH0 403 aa14.9□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 DOCK9Q9BZ29 2069 aa14.9□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa14.9□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 DHRS12A0PJE2 317 aa14.9□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 SERTM1A2A2V5 107 aa14.9□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 DYTNA2CJ06 578 aa14.9□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 A8MU76 341 aa14.9□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 NDUFB5O43674 189 aa14.9□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 PNLIPRP1P54315 467 aa14.9□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 PTGR1Q14914 329 aa14.9□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 XAF1Q6GPH4 301 aa14.9□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 LIX1Q8N485 282 aa14.9□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 NEIL2Q969S2 332 aa14.9□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 ZUFSPQ96AP4 578 aa14.9□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 RAD51AP1Q96B01 352 aa14.9□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 APOOQ9BUR5 198 aa14.9□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 SGPP1Q9BX95 441 aa14.9□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 EHD1Q9H4M9 534 aa14.9□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 CD93Q9NPY3 652 aa14.9□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 EGFL7Q9UHF1 273 aa14.9□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 MMP17Q9ULZ9 603 aa14.9□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa14.9□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 A0A1W2PPC1 479 aa14.89□□□□□ -0.03
CNOT8-201ENST00000285896 SNAP29O95721 258 aa14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.1 ms