RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000271628.8

SF3B4-201, Transcript of splicing factor 3b subunit 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SF3B4, Length 2,085 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B4-201ENST00000271628 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa14.72□□□□□ -0.05
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SF3B4-201ENST00000271628 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
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SF3B4-201ENST00000271628 ANAPC2Q9UJX6 822 aa14.71□□□□□ -0.05
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SF3B4-201ENST00000271628 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
SF3B4-201ENST00000271628 NT5DC2Q9H857 520 aa14.7□□□□□ -0.06
SF3B4-201ENST00000271628 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
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SF3B4-201ENST00000271628 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa14.7□□□□□ -0.06
SF3B4-201ENST00000271628 BRWD1Q9NSI6 2320 aa14.7□□□□□ -0.06
SF3B4-201ENST00000271628 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa14.7□□□□□ -0.06
SF3B4-201ENST00000271628 POM121BA6NF01 834 aa14.7□□□□□ -0.06
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