RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000265339.6

UBE2B-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE2B, Length 2,515 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-201ENST00000265339 TM7SF3Q9NS93 570 aa19.6■□□□□ 0.73
UBE2B-201ENST00000265339 GPR89AB7ZAQ6 455 aa19.59■□□□□ 0.73
UBE2B-201ENST00000265339 SNPHO15079 494 aa19.59■□□□□ 0.73
UBE2B-201ENST00000265339 AXIN1O15169 862 aa19.59■□□□□ 0.73
UBE2B-201ENST00000265339 GPR89BP0CG08 455 aa19.59■□□□□ 0.73
UBE2B-201ENST00000265339 GSTM2P28161 218 aa19.59■□□□□ 0.73
UBE2B-201ENST00000265339 SOX11P35716 441 aa19.59■□□□□ 0.73
UBE2B-201ENST00000265339 COPZ1P61923 177 aa19.59■□□□□ 0.73
UBE2B-201ENST00000265339 PIGFQ07326 219 aa19.59■□□□□ 0.73
UBE2B-201ENST00000265339 CYP51A1Q16850 503 aa19.59■□□□□ 0.73
UBE2B-201ENST00000265339 TPRG1LQ5T0D9 272 aa19.59■□□□□ 0.73
UBE2B-201ENST00000265339 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP19.59■□□□□ 0.73
UBE2B-201ENST00000265339 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP19.59■□□□□ 0.73
UBE2B-201ENST00000265339 MAMSTRQ6ZN01 415 aa19.59■□□□□ 0.73
UBE2B-201ENST00000265339 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa19.59■□□□□ 0.73
UBE2B-201ENST00000265339 GALNT13Q8IUC8 556 aa19.59■□□□□ 0.73
UBE2B-201ENST00000265339 FUNDC1Q8IVP5 155 aa19.59■□□□□ 0.73
UBE2B-201ENST00000265339 IQCF2Q8IXL9 164 aa19.59■□□□□ 0.73
UBE2B-201ENST00000265339 TRPV3Q8NET8 790 aa19.59■□□□□ 0.73
UBE2B-201ENST00000265339 TMEM159Q96B96 161 aa19.59■□□□□ 0.73
UBE2B-201ENST00000265339 TXNDC15Q96J42 360 aa19.59■□□□□ 0.73
UBE2B-201ENST00000265339 C3orf30Q96M34 536 aa19.59■□□□□ 0.73
UBE2B-201ENST00000265339 NEK6Q9HC98 313 aa19.59■□□□□ 0.73
UBE2B-201ENST00000265339 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP19.59■□□□□ 0.73
UBE2B-201ENST00000265339 SUPT3HB4E1H0 165 aa19.59■□□□□ 0.73
UBE2B-201ENST00000265339 UGT2B11O75310 529 aa19.59■□□□□ 0.73
UBE2B-201ENST00000265339 HK3P52790 923 aa19.59■□□□□ 0.73
UBE2B-201ENST00000265339 KIAA1024LP59773 190 aa19.59■□□□□ 0.73
UBE2B-201ENST00000265339 DEFB119Q8N690 84 aa19.59■□□□□ 0.73
UBE2B-201ENST00000265339 OR2L2Q8NH16 312 aa19.59■□□□□ 0.73
UBE2B-201ENST00000265339 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP19.59■□□□□ 0.73
UBE2B-201ENST00000265339 GLMNQ92990 594 aa19.59■□□□□ 0.73
UBE2B-201ENST00000265339 CCDC126Q96EE4 140 aa19.59■□□□□ 0.73
UBE2B-201ENST00000265339 VMP1Q96GC9 406 aa19.59■□□□□ 0.73
UBE2B-201ENST00000265339 ORAI3Q9BRQ5 295 aa19.59■□□□□ 0.73
UBE2B-201ENST00000265339 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP19.59■□□□□ 0.73
UBE2B-201ENST00000265339 GSTO2Q9H4Y5 243 aa19.59■□□□□ 0.73
UBE2B-201ENST00000265339 SLC23A2Q9UGH3 650 aa19.59■□□□□ 0.73
UBE2B-201ENST00000265339 ENPP5Q9UJA9 477 aa19.59■□□□□ 0.73
UBE2B-201ENST00000265339 BAG5Q9UL15 447 aa19.59■□□□□ 0.73
UBE2B-201ENST00000265339 C9JVG2 144 aa19.58■□□□□ 0.73
UBE2B-201ENST00000265339 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa19.58■□□□□ 0.73
UBE2B-201ENST00000265339 NDUFS2O75306 463 aa19.58■□□□□ 0.73
UBE2B-201ENST00000265339 SUPT7LO94864 414 aa19.58■□□□□ 0.73
UBE2B-201ENST00000265339 NADKO95544 446 aaPredicted RBP19.58■□□□□ 0.73
UBE2B-201ENST00000265339 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP19.58■□□□□ 0.73
UBE2B-201ENST00000265339 IL7RP16871 459 aa19.58■□□□□ 0.73
UBE2B-201ENST00000265339 PDHA2P29803 388 aa19.58■□□□□ 0.73
UBE2B-201ENST00000265339 NFE2L1Q14494 772 aa19.58■□□□□ 0.73
UBE2B-201ENST00000265339 NFATC4Q14934 902 aa19.58■□□□□ 0.73
UBE2B-201ENST00000265339 GPSM1Q86YR5 675 aa19.58■□□□□ 0.73
UBE2B-201ENST00000265339 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP19.58■□□□□ 0.73
UBE2B-201ENST00000265339 FGF22Q9HCT0 170 aa19.58■□□□□ 0.73
UBE2B-201ENST00000265339 C8orf4Q9NR00 106 aa19.58■□□□□ 0.73
UBE2B-201ENST00000265339 MRGBPQ9NV56 204 aa19.58■□□□□ 0.73
UBE2B-201ENST00000265339 GIMAP2Q9UG22 337 aa19.58■□□□□ 0.73
UBE2B-201ENST00000265339 ANKRD12Q6UB98 2062 aa19.58■□□□□ 0.73
UBE2B-201ENST00000265339 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa19.58■□□□□ 0.72
UBE2B-201ENST00000265339 MGAT4DA6NG13 374 aa19.58■□□□□ 0.72
UBE2B-201ENST00000265339 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP19.58■□□□□ 0.72
UBE2B-201ENST00000265339 MPC1LP0DKB6 136 aa19.58■□□□□ 0.72
UBE2B-201ENST00000265339 CXCR2P25025 360 aa19.58■□□□□ 0.72
UBE2B-201ENST00000265339 NFKB2Q00653 900 aa19.58■□□□□ 0.72
UBE2B-201ENST00000265339 TSSK4Q6SA08 328 aa19.58■□□□□ 0.72
UBE2B-201ENST00000265339 TBPL2Q6SJ96 375 aa19.58■□□□□ 0.72
UBE2B-201ENST00000265339 PRR23BQ6ZRT6 265 aa19.58■□□□□ 0.72
UBE2B-201ENST00000265339 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP19.58■□□□□ 0.72
UBE2B-201ENST00000265339 CFAP206Q8IYR0 622 aa19.58■□□□□ 0.72
UBE2B-201ENST00000265339 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa19.58■□□□□ 0.72
UBE2B-201ENST00000265339 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa19.58■□□□□ 0.72
UBE2B-201ENST00000265339 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa19.58■□□□□ 0.72
UBE2B-201ENST00000265339 A0A1W2PPC4 97 aa19.57■□□□□ 0.72
UBE2B-201ENST00000265339 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP19.57■□□□□ 0.72
UBE2B-201ENST00000265339 SYCE1LA8MT33 242 aa19.57■□□□□ 0.72
UBE2B-201ENST00000265339 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP19.57■□□□□ 0.72
UBE2B-201ENST00000265339 M0R3G1 203 aa19.57■□□□□ 0.72
UBE2B-201ENST00000265339 NR5A2O00482 541 aa19.57■□□□□ 0.72
UBE2B-201ENST00000265339 GSTM1P09488 218 aa19.57■□□□□ 0.72
UBE2B-201ENST00000265339 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP19.57■□□□□ 0.72
UBE2B-201ENST00000265339 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP19.57■□□□□ 0.72
UBE2B-201ENST00000265339 PHC1P78364 1004 aa19.57■□□□□ 0.72
UBE2B-201ENST00000265339 CTF1Q16619 201 aa19.57■□□□□ 0.72
UBE2B-201ENST00000265339 IMPG1Q17R60 797 aa19.57■□□□□ 0.72
UBE2B-201ENST00000265339 KIF19Q2TAC6 998 aa19.57■□□□□ 0.72
UBE2B-201ENST00000265339 UBE2UQ5VVX9 321 aa19.57■□□□□ 0.72
UBE2B-201ENST00000265339 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP19.57■□□□□ 0.72
UBE2B-201ENST00000265339 NEK10Q6ZWH5 1172 aa19.57■□□□□ 0.72
UBE2B-201ENST00000265339 SLC22A15Q8IZD6 547 aa19.57■□□□□ 0.72
UBE2B-201ENST00000265339 OXR1Q8N573 874 aa19.57■□□□□ 0.72
UBE2B-201ENST00000265339 PSMA8Q8TAA3 256 aa19.57■□□□□ 0.72
UBE2B-201ENST00000265339 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa19.57■□□□□ 0.72
UBE2B-201ENST00000265339 KMOO15229 486 aa19.57■□□□□ 0.72
UBE2B-201ENST00000265339 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP19.57■□□□□ 0.72
UBE2B-201ENST00000265339 FCGR1AP12314 374 aa19.57■□□□□ 0.72
UBE2B-201ENST00000265339 ALDH4A1P30038 563 aa19.57■□□□□ 0.72
UBE2B-201ENST00000265339 CDH13P55290 713 aa19.57■□□□□ 0.72
UBE2B-201ENST00000265339 STX1BP61266 288 aa19.57■□□□□ 0.72
UBE2B-201ENST00000265339 LSM3P62310 102 aaKnown RBP19.57■□□□□ 0.72
UBE2B-201ENST00000265339 PFKFB4Q16877 469 aa19.57■□□□□ 0.72
UBE2B-201ENST00000265339 HACD2Q6Y1H2 254 aa19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.6 ms