RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000259365.8

TMOD1-201, Transcript of tropomodulin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMOD1, Length 3,343 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1-201ENST00000259365 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP12.93□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP12.93□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP12.93□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa12.93□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 CENPOQ9BU64 300 aa12.93□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP12.93□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP12.93□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 TRPS1Q9UHF7 1281 aa12.93□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 MYO16Q9Y6X6 1858 aa12.93□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 PRR23AA6NEV1 266 aa12.93□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 UNCXA6NJT0 531 aa12.93□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 FAM220BPB1ANY3 271 aa12.93□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 CTDSP2O14595 271 aa12.93□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP12.93□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 CCDC159P0C7I6 412 aa12.93□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 TNNI3P19429 210 aa12.93□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP12.93□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP12.93□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa12.93□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 PLEKHG6Q3KR16 790 aa12.93□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 SPDYE7PQ495Y7 208 aa12.93□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 TPRG1LQ5T0D9 272 aa12.93□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP12.93□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 SLC34A3Q8N130 599 aa12.93□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 IL17FQ96PD4 163 aa12.93□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 NTMT1Q9BV86 223 aa12.93□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 PRRG3Q9BZD7 231 aa12.93□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 FAM83DQ9H4H8 585 aa12.93□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 RIMKLBQ9ULI2 386 aa12.93□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 DOCK4Q8N1I0 1966 aa12.93□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 ZNF197O14709 1029 aa12.93□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 WNT9AO14904 365 aa12.93□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 PCDH17O14917 1159 aa12.93□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 KLK1P06870 262 aa12.93□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP12.93□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 PRPS1L1P21108 318 aa12.93□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 CD6P30203 668 aa12.93□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 COPZ1P61923 177 aa12.93□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 SLC35A2P78381 396 aa12.93□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP12.93□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 TSTQ16762 297 aaKnown RBP12.93□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 ZNF404Q494X3 552 aa12.93□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP12.93□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 PTCHD4Q6ZW05 846 aa12.93□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 TRIM46Q7Z4K8 759 aa12.93□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 RNF130Q86XS8 419 aa12.93□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 TMEM25Q86YD3 366 aa12.93□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 ENTHD1Q8IYW4 607 aa12.93□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP12.93□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP12.93□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 CKAP5Q14008 2032 aa12.92□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 VCANP13611 3396 aa12.92□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 AQP9O43315 295 aa12.92□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP12.92□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 URODP06132 367 aa12.92□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa12.92□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 ALPPL2P10696 532 aa12.92□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 CSNK1DP48730 415 aa12.92□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 KCNJ8Q15842 424 aa12.92□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP12.92□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 FAM214AQ32MH5 1076 aa12.92□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 SPATS1Q496A3 300 aa12.92□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 ARSIQ5FYB1 569 aa12.92□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 DEPDC1Q5TB30 811 aa12.92□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 AGTRAPQ6RW13 159 aa12.92□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 DEF8Q6ZN54 512 aa12.92□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 ZZZ3Q8IYH5 903 aa12.92□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP12.92□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 ZNF740Q8NDX6 193 aa12.92□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa12.92□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 S100ZQ8WXG8 99 aa12.92□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 SAMD11Q96NU1 681 aa12.92□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 CEP44Q9C0F1 390 aa12.92□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 MIEF1Q9NQG6 463 aa12.92□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 SNTG1Q9NSN8 517 aa12.92□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa12.92□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 CEP290O15078 2479 aa12.92□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 WWP2O00308 870 aa12.92□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 CCL16O15467 120 aa12.92□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 SPNP16150 400 aa12.92□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 CTSCP53634 463 aa12.92□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 GAB1Q13480 694 aa12.92□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP12.92□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 SPANXN2Q5MJ10 180 aa12.92□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 TMEM220Q6QAJ8 160 aa12.92□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa12.92□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 FATE1Q969F0 183 aa12.92□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 CMTM7Q96FZ5 175 aa12.92□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 SLC35A5Q9BS91 424 aa12.92□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 ITPAQ9BY32 194 aa12.92□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 LINC00597Q9H2U6 94 aa12.92□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 ABCB9Q9NP78 766 aa12.92□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 CCL26Q9Y258 94 aa12.92□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 CCDC88CQ9P219 2028 aa12.92□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa12.92□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 C5orf58C9J3I9 102 aa12.91□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 SSX4O60224 188 aa12.91□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 JRKO75564 520 aa12.91□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 PTHP01270 115 aa12.91□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 CD22P20273 847 aa12.91□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47 ms