RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000255641.12

CSNK1G2-201, Transcript of casein kinase 1 gamma 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CSNK1G2, Length 2,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1G2-201ENST00000255641 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 ZNF605Q86T29 641 aa20.49■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 LAX1Q8IWV1 398 aa20.49■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 C8orf48Q96LL4 319 aa20.49■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 TAS2R9Q9NYW1 312 aa20.49■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 CRLS1Q9UJA2 301 aa20.49■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 DUSP12Q9UNI6 340 aa20.49■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa20.49■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 TMEM229AB2RXF0 380 aa20.48■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 GPX5O75715 221 aa20.48■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 GBAP04062 536 aa20.48■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 SSTR4P31391 388 aa20.48■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 GGT2P36268 569 aa20.48■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 RFX2P48378 723 aa20.48■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 GAB1Q13480 694 aa20.48■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 VRK3Q8IV63 474 aa20.48■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 TRIM48Q8IWZ4 208 aa20.48■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 KBTBD8Q8NFY9 601 aa20.48■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 IL4I1Q96RQ9 567 aa20.48■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 FZD4Q9ULV1 537 aa20.48■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 RGS13O14921 159 aa20.48■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 MTX2O75431 263 aa20.48■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 DGKAP23743 735 aa20.48■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 SPIBQ01892 262 aa20.48■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 DUOXA1Q1HG43 343 aa20.48■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa20.48■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 NLRP8Q86W28 1048 aa20.48■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 UBQLNLQ8IYU4 475 aa20.48■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 NAGSQ8N159 534 aa20.48■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa20.48■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 OR10G2Q8NGC3 310 aa20.48■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 MYDGFQ969H8 173 aa20.48■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 YME1L1Q96TA2 773 aa20.48■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 NTMT1Q9BV86 223 aa20.48■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 GPR62Q9BZJ7 368 aa20.48■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 TPT1P8Q9HAU6 139 aa20.48■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 TRPS1Q9UHF7 1281 aa20.48■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 PRAMEF25A6NGN4 478 aa20.47■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 RFXAPO00287 272 aa20.47■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 TYMPP19971 482 aa20.47■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 DEFA1P59665 94 aa20.47■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 DEFA3P59666 94 aa20.47■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 RHOAP61586 193 aa20.47■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP20.47■□□□□ 0.872e-7■■□□□ 11.5
CSNK1G2-201ENST00000255641 COX20Q5RI15 118 aa20.47■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 ZSWIM9Q86XI8 627 aa20.47■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 BARHL1Q9BZE3 327 aa20.47■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 SNTG1Q9NSN8 517 aa20.47■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 RPS6KA6Q9UK32 745 aa20.47■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa20.47■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 A0A0C4DFX4 3053 aa20.47■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 VNN2O95498 520 aa20.47■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 GATMP50440 423 aa20.47■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 HTRA3P83110 453 aa20.47■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 NFATC2Q13469 925 aa20.47■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 CARNMT1Q8N4J0 409 aa20.47■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 GPR156Q8NFN8 814 aa20.47■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 CD99L2Q8TCZ2 262 aa20.47■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 IMPAD1Q9NX62 359 aa20.47■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 CLEC2DQ9UHP7 191 aa20.47■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 ACSL6Q9UKU0 697 aa20.47■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 ARHGAP33O14559 1287 aa20.47■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 PCDH17O14917 1159 aa20.47■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 HLA-EP13747 358 aa20.47■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 RPS19P39019 145 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 CD83Q01151 205 aa20.47■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 FAM209AQ5JX71 171 aa20.47■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 GPRC6AQ5T6X5 926 aa20.47■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa20.47■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 SERPINA11Q86U17 422 aa20.47■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 GLCCI1Q86VQ1 547 aa20.47■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 SUV39H1O43463 412 aa20.46■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 PRKCAP17252 672 aa20.46■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 RPL17P18621 184 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 SSX1Q16384 188 aa20.46■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 LEXMQ3ZCV2 418 aa20.46■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 SMUG1Q53HV7 270 aa20.46■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 CLLU1OSQ5K130 101 aa20.46■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 ANKS3Q6ZW76 656 aa20.46■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 CCDC190Q86UF4 302 aa20.46■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 LGI4Q8N135 537 aa20.46■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 CADM2Q8N3J6 435 aa20.46■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 MGLLQ99685 303 aa20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.5 ms