RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 RHDQ02161 417 aa21.19■□□□□ 0.98
SYF2-201ENST00000236273 HYAL2Q12891 473 aa21.19■□□□□ 0.98
SYF2-201ENST00000236273 FAM53BQ14153 422 aa21.19■□□□□ 0.98
SYF2-201ENST00000236273 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP21.19■□□□□ 0.98
SYF2-201ENST00000236273 PDK4Q16654 411 aa21.19■□□□□ 0.98
SYF2-201ENST00000236273 PRMT9Q6P2P2 845 aa21.19■□□□□ 0.98
SYF2-201ENST00000236273 PRSS41Q7RTY9 318 aa21.19■□□□□ 0.98
SYF2-201ENST00000236273 AMER3Q8N944 861 aa21.19■□□□□ 0.98
SYF2-201ENST00000236273 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP21.19■□□□□ 0.98
SYF2-201ENST00000236273 AIF1LQ9BQI0 150 aa21.19■□□□□ 0.98
SYF2-201ENST00000236273 AICDAQ9GZX7 198 aa21.19■□□□□ 0.98
SYF2-201ENST00000236273 EHD1Q9H4M9 534 aa21.19■□□□□ 0.98
SYF2-201ENST00000236273 ZNF304Q9HCX3 659 aa21.19■□□□□ 0.98
SYF2-201ENST00000236273 TMEM216Q9P0N5 145 aa21.19■□□□□ 0.98
SYF2-201ENST00000236273 ZFP69BQ9UJL9 534 aa21.19■□□□□ 0.98
SYF2-201ENST00000236273 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP21.19■□□□□ 0.98
SYF2-201ENST00000236273 VSTM2BA6NLU5 285 aa21.18■□□□□ 0.98
SYF2-201ENST00000236273 C9J4A7 227 aa21.18■□□□□ 0.98
SYF2-201ENST00000236273 GOLGA8RI6L899 631 aa21.18■□□□□ 0.98
SYF2-201ENST00000236273 K7EPI3 171 aa21.18■□□□□ 0.98
SYF2-201ENST00000236273 TK2O00142 265 aa21.18■□□□□ 0.98
SYF2-201ENST00000236273 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP21.18■□□□□ 0.98
SYF2-201ENST00000236273 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP21.18■□□□□ 0.98
SYF2-201ENST00000236273 ALBP02768 609 aa21.18■□□□□ 0.98
SYF2-201ENST00000236273 ITGB2P05107 769 aa21.18■□□□□ 0.98
SYF2-201ENST00000236273 CASP2P42575 452 aa21.18■□□□□ 0.98
SYF2-201ENST00000236273 DOC2AQ14183 400 aa21.18■□□□□ 0.98
SYF2-201ENST00000236273 NKG7Q16617 165 aa21.18■□□□□ 0.98
SYF2-201ENST00000236273 UGT8Q16880 541 aa21.18■□□□□ 0.98
SYF2-201ENST00000236273 MREGQ8N565 214 aa21.18■□□□□ 0.98
SYF2-201ENST00000236273 SNX31Q8N9S9 440 aa21.18■□□□□ 0.98
SYF2-201ENST00000236273 CAMKVQ8NCB2 501 aa21.18■□□□□ 0.98
SYF2-201ENST00000236273 NT5CQ8TCD5 201 aa21.18■□□□□ 0.98
SYF2-201ENST00000236273 ACMSDQ8TDX5 336 aa21.18■□□□□ 0.98
SYF2-201ENST00000236273 CREB3L4Q8TEY5 395 aa21.18■□□□□ 0.98
SYF2-201ENST00000236273 EXTL1Q92935 676 aa21.18■□□□□ 0.98
SYF2-201ENST00000236273 FKBP10Q96AY3 582 aa21.18■□□□□ 0.98
SYF2-201ENST00000236273 MVB12AQ96EY5 273 aa21.18■□□□□ 0.98
SYF2-201ENST00000236273 SPSB2Q99619 263 aa21.18■□□□□ 0.98
SYF2-201ENST00000236273 C17orf62Q9BQA9 187 aa21.18■□□□□ 0.98
SYF2-201ENST00000236273 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP21.18■□□□□ 0.98
SYF2-201ENST00000236273 NT5DC2Q9H857 520 aa21.18■□□□□ 0.98
SYF2-201ENST00000236273 PPCSQ9HAB8 311 aa21.18■□□□□ 0.98
SYF2-201ENST00000236273 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP21.18■□□□□ 0.98
SYF2-201ENST00000236273 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa21.17■□□□□ 0.98
SYF2-201ENST00000236273 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP21.17■□□□□ 0.98
SYF2-201ENST00000236273 I3L1I5 382 aaPredicted RBP21.17■□□□□ 0.98
SYF2-201ENST00000236273 UMODP07911 640 aa21.17■□□□□ 0.98
SYF2-201ENST00000236273 PYGBP11216 843 aa21.17■□□□□ 0.98
SYF2-201ENST00000236273 GFAPP14136 432 aa21.17■□□□□ 0.98
SYF2-201ENST00000236273 PWP1Q13610 501 aa21.17■□□□□ 0.98
SYF2-201ENST00000236273 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP21.17■□□□□ 0.98
SYF2-201ENST00000236273 VN1R5Q7Z5H4 357 aa21.17■□□□□ 0.98
SYF2-201ENST00000236273 PDSS2Q86YH6 399 aa21.17■□□□□ 0.98
SYF2-201ENST00000236273 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa21.17■□□□□ 0.98
SYF2-201ENST00000236273 OR2Y1Q8NGV0 311 aa21.17■□□□□ 0.98
SYF2-201ENST00000236273 SCYL1Q96KG9 808 aa21.17■□□□□ 0.98
SYF2-201ENST00000236273 DRC3Q9H069 523 aa21.17■□□□□ 0.98
SYF2-201ENST00000236273 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP21.17■□□□□ 0.98
SYF2-201ENST00000236273 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP21.17■□□□□ 0.98
SYF2-201ENST00000236273 CTSFQ9UBX1 484 aa21.17■□□□□ 0.98
SYF2-201ENST00000236273 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa21.16■□□□□ 0.98
SYF2-201ENST00000236273 CDC14CA4D256 554 aa21.16■□□□□ 0.98
SYF2-201ENST00000236273 E2F3O00716 465 aa21.16■□□□□ 0.98
SYF2-201ENST00000236273 CLGNO14967 610 aa21.16■□□□□ 0.98
SYF2-201ENST00000236273 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP21.16■□□□□ 0.98
SYF2-201ENST00000236273 TBCCQ15814 346 aa21.16■□□□□ 0.98
SYF2-201ENST00000236273 DEFB109BQ30KR1 87 aa21.16■□□□□ 0.98
SYF2-201ENST00000236273 ADNP2Q6IQ32 1131 aa21.16■□□□□ 0.98
SYF2-201ENST00000236273 TEX9Q8N6V9 391 aa21.16■□□□□ 0.98
SYF2-201ENST00000236273 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP21.16■□□□□ 0.98
SYF2-201ENST00000236273 OR9A4Q8NGU2 314 aa21.16■□□□□ 0.98
SYF2-201ENST00000236273 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP21.16■□□□□ 0.98
SYF2-201ENST00000236273 CATSPER2Q96P56 530 aa21.16■□□□□ 0.98
SYF2-201ENST00000236273 SLC6A16Q9GZN6 736 aa21.16■□□□□ 0.98
SYF2-201ENST00000236273 OPTCQ9UBM4 332 aa21.16■□□□□ 0.98
SYF2-201ENST00000236273 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP21.16■□□□□ 0.98
SYF2-201ENST00000236273 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP21.16■□□□□ 0.98
SYF2-201ENST00000236273 SLC22A7Q9Y694 548 aa21.16■□□□□ 0.98
SYF2-201ENST00000236273 MED13Q9UHV7 2174 aa21.16■□□□□ 0.98
SYF2-201ENST00000236273 ATRXP46100 2492 aa21.16■□□□□ 0.98
SYF2-201ENST00000236273 SMIM23A6NLE4 172 aa21.15■□□□□ 0.98
SYF2-201ENST00000236273 ERVH48-1M5A8F1 160 aa21.15■□□□□ 0.98
SYF2-201ENST00000236273 NDUFS4O43181 175 aa21.15■□□□□ 0.98
SYF2-201ENST00000236273 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP21.15■□□□□ 0.98
SYF2-201ENST00000236273 SMIM10L1P0DMW3 83 aa21.15■□□□□ 0.98
SYF2-201ENST00000236273 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP21.15■□□□□ 0.98
SYF2-201ENST00000236273 CXCR2P25025 360 aa21.15■□□□□ 0.98
SYF2-201ENST00000236273 CHIT1Q13231 466 aa21.15■□□□□ 0.98
SYF2-201ENST00000236273 DSG2Q14126 1118 aa21.15■□□□□ 0.98
SYF2-201ENST00000236273 NDUFA9Q16795 377 aa21.15■□□□□ 0.98
SYF2-201ENST00000236273 SYT16Q17RD7 645 aa21.15■□□□□ 0.98
SYF2-201ENST00000236273 XKR6Q5GH73 641 aa21.15■□□□□ 0.98
SYF2-201ENST00000236273 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa21.15■□□□□ 0.98
SYF2-201ENST00000236273 LCA5Q86VQ0 697 aa21.15■□□□□ 0.98
SYF2-201ENST00000236273 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP21.15■□□□□ 0.98
SYF2-201ENST00000236273 CNPY4Q8N129 248 aa21.15■□□□□ 0.98
SYF2-201ENST00000236273 EXD3Q8N9H8 876 aa21.15■□□□□ 0.98
SYF2-201ENST00000236273 COL26A1Q96A83 441 aa21.15■□□□□ 0.98
SYF2-201ENST00000236273 PHF21BQ96EK2 531 aa21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 83.3 ms