RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636228.1

CLN3-246, Transcript of CLN3, battenin, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CLN3, Length 1,224 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3-246ENST00000636228 OR51Q1Q8NH59 317 aa15.27■□□□□ 0.04
CLN3-246ENST00000636228 SUN3Q8TAQ9 357 aa15.27■□□□□ 0.04
CLN3-246ENST00000636228 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa15.27■□□□□ 0.04
CLN3-246ENST00000636228 METTL21AQ8WXB1 218 aa15.27■□□□□ 0.04
CLN3-246ENST00000636228 KCNJ9Q92806 393 aa15.27■□□□□ 0.04
CLN3-246ENST00000636228 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP15.27■□□□□ 0.04
CLN3-246ENST00000636228 SERPINB12Q96P63 405 aa15.27■□□□□ 0.04
CLN3-246ENST00000636228 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP15.27■□□□□ 0.04
CLN3-246ENST00000636228 HOMER3Q9NSC5 361 aa15.27■□□□□ 0.04
CLN3-246ENST00000636228 TMEM184CQ9NVA4 438 aa15.27■□□□□ 0.04
CLN3-246ENST00000636228 ANKRD10Q9NXR5 420 aa15.27■□□□□ 0.04
CLN3-246ENST00000636228 SEC14L3Q9UDX4 400 aa15.27■□□□□ 0.04
CLN3-246ENST00000636228 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa15.27■□□□□ 0.04
CLN3-246ENST00000636228 MAGEB16A2A368 324 aa15.26■□□□□ 0.03
CLN3-246ENST00000636228 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa15.26■□□□□ 0.03
CLN3-246ENST00000636228 H0YIG0 161 aa15.26■□□□□ 0.03
CLN3-246ENST00000636228 CCL21O00585 134 aa15.26■□□□□ 0.03
CLN3-246ENST00000636228 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP15.26■□□□□ 0.03
CLN3-246ENST00000636228 COILP38432 576 aaPredicted RBP15.26■□□□□ 0.03
CLN3-246ENST00000636228 XCR1P46094 333 aa15.26■□□□□ 0.03
CLN3-246ENST00000636228 TBPL1P62380 186 aa15.26■□□□□ 0.03
CLN3-246ENST00000636228 RELAQ04206 551 aa15.26■□□□□ 0.03
CLN3-246ENST00000636228 INAQ16352 499 aa15.26■□□□□ 0.03
CLN3-246ENST00000636228 ANKRD37Q7Z713 158 aa15.26■□□□□ 0.03
CLN3-246ENST00000636228 PDSS2Q86YH6 399 aa15.26■□□□□ 0.03
CLN3-246ENST00000636228 KCT2Q8NC54 265 aa15.26■□□□□ 0.03
CLN3-246ENST00000636228 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa15.26■□□□□ 0.03
CLN3-246ENST00000636228 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP15.26■□□□□ 0.03
CLN3-246ENST00000636228 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP15.26■□□□□ 0.03
CLN3-246ENST00000636228 NDNQ99608 321 aa15.26■□□□□ 0.03
CLN3-246ENST00000636228 HES7Q9BYE0 225 aa15.26■□□□□ 0.03
CLN3-246ENST00000636228 RBCK1Q9BYM8 510 aa15.26■□□□□ 0.03
CLN3-246ENST00000636228 ATG10Q9H0Y0 220 aa15.26■□□□□ 0.03
CLN3-246ENST00000636228 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP15.26■□□□□ 0.03
CLN3-246ENST00000636228 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP15.26■□□□□ 0.03
CLN3-246ENST00000636228 ABI3Q9P2A4 366 aa15.26■□□□□ 0.03
CLN3-246ENST00000636228 KLHL42Q9P2K6 505 aa15.26■□□□□ 0.03
CLN3-246ENST00000636228 FBXO5Q9UKT4 447 aa15.26■□□□□ 0.03
CLN3-246ENST00000636228 CREBBPQ92793 2442 aa15.26■□□□□ 0.03
CLN3-246ENST00000636228 MAN1A2O60476 641 aa15.25■□□□□ 0.03
CLN3-246ENST00000636228 RDH16O75452 317 aa15.25■□□□□ 0.03
CLN3-246ENST00000636228 NSA2O95478 260 aaKnown RBP15.25■□□□□ 0.03
CLN3-246ENST00000636228 CRYABP02511 175 aaKnown RBP15.25■□□□□ 0.03
CLN3-246ENST00000636228 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP15.25■□□□□ 0.03
CLN3-246ENST00000636228 CCDC175P0C221 793 aa15.25■□□□□ 0.03
CLN3-246ENST00000636228 MLNP12872 115 aa15.25■□□□□ 0.03
CLN3-246ENST00000636228 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP15.25■□□□□ 0.03
CLN3-246ENST00000636228 BCL6P41182 706 aa15.25■□□□□ 0.03
CLN3-246ENST00000636228 CSNK1G2P78368 415 aa15.25■□□□□ 0.03
CLN3-246ENST00000636228 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP15.25■□□□□ 0.03
CLN3-246ENST00000636228 LONRF1Q17RB8 773 aa15.25■□□□□ 0.03
CLN3-246ENST00000636228 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa15.25■□□□□ 0.03
CLN3-246ENST00000636228 ZNF766Q5HY98 468 aa15.25■□□□□ 0.03
CLN3-246ENST00000636228 SLC26A11Q86WA9 606 aa15.25■□□□□ 0.03
CLN3-246ENST00000636228 MCEMP1Q8IX19 187 aa15.25■□□□□ 0.03
CLN3-246ENST00000636228 BEST3Q8N1M1 668 aa15.25■□□□□ 0.03
CLN3-246ENST00000636228 MCUQ8NE86 351 aa15.25■□□□□ 0.03
CLN3-246ENST00000636228 CCDC120Q96HB5 630 aa15.25■□□□□ 0.03
CLN3-246ENST00000636228 SIGLEC10Q96LC7 697 aa15.25■□□□□ 0.03
CLN3-246ENST00000636228 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP15.25■□□□□ 0.03
CLN3-246ENST00000636228 RNF32Q9H0A6 362 aa15.25■□□□□ 0.03
CLN3-246ENST00000636228 PDE10AQ9Y233 779 aa15.25■□□□□ 0.03
CLN3-246ENST00000636228 ZNF860A6NHJ4 632 aa15.24■□□□□ 0.03
CLN3-246ENST00000636228 DNAJB6O75190 326 aa15.24■□□□□ 0.03
CLN3-246ENST00000636228 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP15.24■□□□□ 0.03
CLN3-246ENST00000636228 CDH1P12830 882 aa15.24■□□□□ 0.03
CLN3-246ENST00000636228 PGGT1BP53609 377 aa15.24■□□□□ 0.03
CLN3-246ENST00000636228 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP15.24■□□□□ 0.03
CLN3-246ENST00000636228 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP15.24■□□□□ 0.03
CLN3-246ENST00000636228 NAE1Q13564 534 aa15.24■□□□□ 0.03
CLN3-246ENST00000636228 ACER2Q5QJU3 275 aa15.24■□□□□ 0.03
CLN3-246ENST00000636228 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP15.24■□□□□ 0.03
CLN3-246ENST00000636228 MRGPRGQ86SM5 289 aa15.24■□□□□ 0.03
CLN3-246ENST00000636228 TRIM58Q8NG06 486 aa15.24■□□□□ 0.03
CLN3-246ENST00000636228 OR5T3Q8NGG3 340 aa15.24■□□□□ 0.03
CLN3-246ENST00000636228 DNAJB8Q8NHS0 232 aa15.24■□□□□ 0.03
CLN3-246ENST00000636228 MCOLN3Q8TDD5 553 aa15.24■□□□□ 0.03
CLN3-246ENST00000636228 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa15.24■□□□□ 0.03
CLN3-246ENST00000636228 NPAS2Q99743 824 aa15.24■□□□□ 0.03
CLN3-246ENST00000636228 KCNK13Q9HB14 408 aa15.24■□□□□ 0.03
CLN3-246ENST00000636228 ANKHQ9HCJ1 492 aa15.24■□□□□ 0.03
CLN3-246ENST00000636228 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP15.24■□□□□ 0.03
CLN3-246ENST00000636228 KLHL1Q9NR64 748 aa15.24■□□□□ 0.03
CLN3-246ENST00000636228 TEKT2Q9UIF3 430 aa15.24■□□□□ 0.03
CLN3-246ENST00000636228 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa15.24■□□□□ 0.03
CLN3-246ENST00000636228 NEU2Q9Y3R4 380 aa15.24■□□□□ 0.03
CLN3-246ENST00000636228 LRBAP50851 2863 aa15.24■□□□□ 0.03
CLN3-246ENST00000636228 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa15.23■□□□□ 0.03
CLN3-246ENST00000636228 FAM227AF5H4B4 570 aa15.23■□□□□ 0.03
CLN3-246ENST00000636228 ZNHIT1O43257 154 aa15.23■□□□□ 0.03
CLN3-246ENST00000636228 B3GALT4O96024 378 aa15.23■□□□□ 0.03
CLN3-246ENST00000636228 CD96P40200 585 aa15.23■□□□□ 0.03
CLN3-246ENST00000636228 MAGEA3P43357 314 aa15.23■□□□□ 0.03
CLN3-246ENST00000636228 AP2B1P63010 937 aa15.23■□□□□ 0.03
CLN3-246ENST00000636228 ART3Q13508 389 aa15.23■□□□□ 0.03
CLN3-246ENST00000636228 TUBA3CQ13748 450 aa15.23■□□□□ 0.03
CLN3-246ENST00000636228 PTK6Q13882 451 aa15.23■□□□□ 0.03
CLN3-246ENST00000636228 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP15.23■□□□□ 0.03
CLN3-246ENST00000636228 PLAG1Q6DJT9 500 aa15.23■□□□□ 0.03
CLN3-246ENST00000636228 SPINK14Q6IE38 97 aa15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.5 ms