RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000627440.2

SNAP23-223, Transcript of synaptosome associated protein 23, human

TSL 5 BASIC

Gene SNAP23, Length 210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNAP23-223	ENST00000627440	CP	P00450	1065 aa		5.67	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	HLA-DRA	P01903	254 aa		5.67	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	PPP3CB	P16298	524 aa		5.67	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	NDUFS1	P28331	727 aa		5.67	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	YWHAZ	P63104	245 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	KRT33B	Q14525	404 aa		5.67	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	KRT32	Q14532	448 aa		5.67	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	MCM6	Q14566	821 aa		5.67	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	CYTH1	Q15438	398 aa		5.67	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	TSNAXIP1	Q2TAA8	658 aa		5.67	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	FAM214A	Q32MH5	1076 aa		5.67	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF750	Q32MQ0	723 aa		5.67	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	TTC38	Q5R3I4	469 aa		5.67	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF648	Q5T619	568 aa	Predicted RBP	5.67	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	RAD9B	Q6WBX8	426 aa		5.67	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	LANCL3	Q6ZV70	420 aa		5.67	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	DOK3	Q7L591	496 aa		5.67	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	CDKL3	Q8IVW4	592 aa	Predicted RBP	5.67	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	GCNT2	Q8N0V5	402 aa		5.67	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	KBTBD8	Q8NFY9	601 aa		5.67	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	NEIL3	Q8TAT5	605 aa		5.67	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	SLC35F5	Q8WV83	523 aa		5.67	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	C12orf66	Q96MD2	445 aa		5.67	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	KLHL4	Q9C0H6	718 aa		5.67	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	BLZF1	Q9H2G9	400 aa		5.67	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	SLC6A15	Q9H2J7	730 aa		5.67	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	TMEM8A	Q9HCN3	771 aa		5.67	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	RAD18	Q9NS91	495 aa		5.67	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	CISH	Q9NSE2	258 aa		5.67	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	WHRN	Q9P202	907 aa		5.67	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	DNAI1	Q9UI46	699 aa		5.67	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	CAPN11	Q9UMQ6	739 aa		5.67	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	MAPRE3	Q9UPY8	281 aa		5.67	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	CAMK2A	Q9UQM7	478 aa		5.67	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	FKBP7	Q9Y680	259 aa		5.67	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440		A0A0G2JMM0	328 aa		5.66	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440		A0A1W2PPB8	328 aa		5.66	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	LOC390937	A0A1W2PQ73	354 aa		5.66	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440		A0A1W2PRS3	328 aa		5.66	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	FADS2P1	A8MWK0	482 aa		5.66	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	KIR3DP1	A8MWS1	328 aa		5.66	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440		G3V3Y1	287 aa		5.66	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	CLDN34	H7C241	214 aa		5.66	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440		H7C417	338 aa		5.66	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440		M0QYV0	167 aa		5.66	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	PNP	P00491	289 aa		5.66	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	SFTPB	P07988	381 aa		5.66	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	PRB4	P10163	310 aa	Predicted RBP	5.66	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	LMO1	P25800	156 aa		5.66	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	SLC6A12	P48065	614 aa		5.66	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	MAPKAPK2	P49137	400 aa		5.66	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	PNLIPRP1	P54315	467 aa		5.66	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	BPIFB4	P59827	614 aa		5.66	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	IFT88	Q13099	833 aa		5.66	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	GAB1	Q13480	694 aa		5.66	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	RCAN2	Q14206	197 aa		5.66	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	ACBD5	Q5T8D3	534 aa	Predicted RBP	5.66	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	RNF187	Q5TA31	235 aa	Predicted RBP	5.66	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	LRRC66	Q68CR7	880 aa		5.66	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	ADNP2	Q6IQ32	1131 aa		5.66	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF474	Q6S9Z5	364 aa	Predicted RBP	5.66	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	C1orf229	Q6ZS94	237 aa	Predicted RBP	5.66	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	C4orf32	Q8N8J7	132 aa		5.66	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	NOA1	Q8NC60	698 aa	Known RBP	5.66	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	LMO3	Q8TAP4	145 aa		5.66	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	NANP	Q8TBE9	248 aa		5.66	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	FAM71B	Q8TC56	605 aa		5.66	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	C10orf90	Q96M02	699 aa		5.66	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	LRRC37B	Q96QE4	947 aa		5.66	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	SNX18	Q96RF0	628 aa		5.66	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	TM9SF2	Q99805	663 aa		5.66	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	FAM173A	Q9BQD7	235 aa		5.66	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	TACO1	Q9BSH4	297 aa	Known RBP	5.66	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	ALOXE3	Q9BYJ1	711 aa		5.66	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	WDCP	Q9H6R7	721 aa		5.66	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	ST7	Q9NRC1	585 aa		5.66	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	CBLN4	Q9NTU7	201 aa		5.66	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	CISD1	Q9NZ45	108 aa	Known RBP	5.66	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	KCMF1	Q9P0J7	381 aa		5.66	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	ASH2L	Q9UBL3	628 aa		5.66	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	ERVK-11	Q9UQG0	969 aa		5.66	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	RNF114	Q9Y508	228 aa		5.66	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	TET2	Q6N021	2002 aa	Predicted RBP	5.65	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440		A0A1W2PQ67	120 aa		5.65	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	MYO1F	O00160	1098 aa		5.65	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	PRPF4	O43172	522 aa	Known RBP eCLIP	5.65	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	ANP32C	O43423	234 aa		5.65	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	RCBTB2	O95199	551 aa		5.65	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	SLC25A14	O95258	325 aa	Predicted RBP	5.65	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	CRYBA1	P05813	215 aa		5.65	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	TBXA2R	P21731	343 aa		5.65	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	MGAT1	P26572	445 aa		5.65	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	USP8	P40818	1118 aa		5.65	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	PRPH	P41219	470 aa		5.65	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	RGR	P47804	291 aa		5.65	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	CSNK1D	P48730	415 aa		5.65	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	SNRPN	P63162	240 aa	Known RBP	5.65	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	ATP11A	P98196	1134 aa		5.65	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	DUSP8	Q13202	625 aa		5.65	□□□□□ -1.5
SNAP23-223	ENST00000627440	CCNI	Q14094	377 aa		5.65	□□□□□ -1.5

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.2 ms