RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615579.1

TTC28-AS1_3.1-201, humanhuman

BASIC

Gene TTC28-AS1_3, Length 181 nt, Biotype misc RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP13.92□□□□□ -0.18
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PLCL2Q9UPR0 1127 aa13.92□□□□□ -0.18
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 STK38LQ9Y2H1 464 aa13.92□□□□□ -0.18
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TIMM22Q9Y584 194 aa13.92□□□□□ -0.18
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 H0YGG7 62 aa13.91□□□□□ -0.18
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa13.91□□□□□ -0.18
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP13.91□□□□□ -0.18
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 P2RX6O15547 441 aa13.91□□□□□ -0.18
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CAPN1P07384 714 aa13.91□□□□□ -0.18
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CXCR2P25025 360 aa13.91□□□□□ -0.18
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP13.91□□□□□ -0.18
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ARRB2P32121 409 aa13.91□□□□□ -0.18
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 HNF4AP41235 474 aa13.91□□□□□ -0.18
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 HTR6P50406 440 aa13.91□□□□□ -0.18
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 FOXA1P55317 472 aa13.91□□□□□ -0.18
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PKNOX1P55347 436 aa13.91□□□□□ -0.18
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP13.91□□□□□ -0.18
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ACY1Q03154 408 aa13.91□□□□□ -0.18
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 LAPTM5Q13571 262 aa13.91□□□□□ -0.18
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 HKDC1Q2TB90 917 aa13.91□□□□□ -0.18
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 LIPJQ5W064 366 aa13.91□□□□□ -0.18
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ATG16L1Q676U5 607 aa13.91□□□□□ -0.18
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa13.91□□□□□ -0.18
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TRIM42Q8IWZ5 723 aa13.91□□□□□ -0.18
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 LSMEM2Q8N112 164 aa13.91□□□□□ -0.18
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 DNAJC22Q8N4W6 341 aa13.91□□□□□ -0.18
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CSNK1A1LQ8N752 337 aa13.91□□□□□ -0.18
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ANKRD53Q8N9V6 530 aa13.91□□□□□ -0.18
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 MFSD9Q8NBP5 474 aa13.91□□□□□ -0.18
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 OR1L3Q8NH93 324 aa13.91□□□□□ -0.18
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP13.91□□□□□ -0.18
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CNDP1Q96KN2 507 aa13.91□□□□□ -0.18
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP13.91□□□□□ -0.18
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa13.91□□□□□ -0.18
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP13.91□□□□□ -0.18
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 MANSC1Q9H8J5 431 aa13.91□□□□□ -0.18
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP13.91□□□□□ -0.18
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SLC39A1Q9NY26 324 aa13.91□□□□□ -0.18
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SEMA5BQ9P283 1151 aa13.91□□□□□ -0.18
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TRPS1Q9UHF7 1281 aa13.91□□□□□ -0.18
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ZNF225Q9UK10 706 aa13.91□□□□□ -0.18
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 KLK13Q9UKR3 277 aa13.91□□□□□ -0.18
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 RARRES3Q9UL19 164 aa13.91□□□□□ -0.18
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa13.91□□□□□ -0.18
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa13.9□□□□□ -0.18
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP13.9□□□□□ -0.18
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ANKDD1BA6NHY2 528 aa13.9□□□□□ -0.18
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TMEM114B3SHH9 223 aa13.9□□□□□ -0.18
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PLD2O14939 933 aa13.9□□□□□ -0.18
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP13.9□□□□□ -0.18
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 OR2B3O76000 313 aa13.9□□□□□ -0.18
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 KITP10721 976 aa13.9□□□□□ -0.18
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SERPINB3P29508 390 aa13.9□□□□□ -0.18
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SCTRP47872 440 aa13.9□□□□□ -0.18
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 NEK2P51955 445 aa13.9□□□□□ -0.18
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 GYS2P54840 703 aa13.9□□□□□ -0.18
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ITGA1P56199 1179 aa13.9□□□□□ -0.18
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 GABREP78334 506 aa13.9□□□□□ -0.18
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 GUCY1A3Q02108 690 aa13.9□□□□□ -0.18
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 IFT88Q13099 833 aa13.9□□□□□ -0.18
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TBCCQ15814 346 aa13.9□□□□□ -0.18
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa13.9□□□□□ -0.18
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa13.9□□□□□ -0.18
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 FBXO42Q6P3S6 717 aa13.9□□□□□ -0.18
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ATG14Q6ZNE5 492 aa13.9□□□□□ -0.18
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 FAM47EQ6ZV65 393 aa13.9□□□□□ -0.18
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ASPGQ86U10 573 aa13.9□□□□□ -0.18
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TMEM126BQ8IUX1 230 aa13.9□□□□□ -0.18
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 GPR135Q8IZ08 494 aa13.9□□□□□ -0.18
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP13.9□□□□□ -0.18
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP13.9□□□□□ -0.18
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 OR4K1Q8NGD4 311 aa13.9□□□□□ -0.18
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP13.9□□□□□ -0.18
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 METTL6Q8TCB7 284 aa13.9□□□□□ -0.18
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP13.9□□□□□ -0.18
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 NTMT1Q9BV86 223 aa13.9□□□□□ -0.18
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 EHD1Q9H4M9 534 aa13.9□□□□□ -0.18
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ELOVL6Q9H5J4 265 aa13.9□□□□□ -0.18
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP13.9□□□□□ -0.18
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 WDR70Q9NW82 654 aa13.9□□□□□ -0.18
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP13.9□□□□□ -0.18
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PILRAQ9UKJ1 303 aa13.9□□□□□ -0.18
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 KLK4Q9Y5K2 254 aa13.9□□□□□ -0.18
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP13.9□□□□□ -0.18
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 DCHS1Q96JQ0 3298 aa13.89□□□□□ -0.19
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 A0A0G2JN53 185 aa13.89□□□□□ -0.19
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SAP18O00422 153 aaKnown RBP13.89□□□□□ -0.19
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP13.89□□□□□ -0.19
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 UGDHO60701 494 aa13.89□□□□□ -0.19
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 WFS1O76024 890 aa13.89□□□□□ -0.19
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TIAF1O95411 115 aa13.89□□□□□ -0.19
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ESRRBO95718 433 aa13.89□□□□□ -0.19
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SLC35G6P0C7Q6 338 aa13.89□□□□□ -0.19
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 GRK2P25098 689 aa13.89□□□□□ -0.19
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 GABRA4P48169 554 aa13.89□□□□□ -0.19
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 NAA20P61599 178 aa13.89□□□□□ -0.19
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PHEXP78562 749 aa13.89□□□□□ -0.19
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 WASHC2DQ5SRD0 308 aa13.89□□□□□ -0.19
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa13.89□□□□□ -0.19
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 VN1R4Q7Z5H5 301 aa13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.4 ms