RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592578.5

PSME3-215, Transcript of proteasome activator subunit 3, human

TSL 4

Gene PSME3, Length 549 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PSME3-215	ENST00000592578	KIAA0408	Q6ZU52	694 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PSME3-215	ENST00000592578	PIWIL4	Q7Z3Z4	852 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
PSME3-215	ENST00000592578	ADCK2	Q7Z695	626 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PSME3-215	ENST00000592578	CEP97	Q8IW35	865 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PSME3-215	ENST00000592578	PALM2	Q8IXS6	379 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PSME3-215	ENST00000592578	PDIK1L	Q8N165	341 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PSME3-215	ENST00000592578	CSNK1A1L	Q8N752	337 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PSME3-215	ENST00000592578	STT3B	Q8TCJ2	826 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PSME3-215	ENST00000592578	MCOLN3	Q8TDD5	553 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PSME3-215	ENST00000592578	MIEF2	Q96C03	454 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PSME3-215	ENST00000592578	MVB12A	Q96EY5	273 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PSME3-215	ENST00000592578	CAPZA3	Q96KX2	299 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PSME3-215	ENST00000592578	NDN	Q99608	321 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PSME3-215	ENST00000592578	CTSF	Q9UBX1	484 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PSME3-215	ENST00000592578	FBXL4	Q9UKA2	621 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PSME3-215	ENST00000592578	HS3ST3B1	Q9Y662	390 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PSME3-215	ENST00000592578	NUP210L	Q5VU65	1888 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PSME3-215	ENST00000592578	DOCK10	Q96BY6	2186 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PSME3-215	ENST00000592578	PRPF4	O43172	522 aa	Known RBP eCLIP	13.55	□□□□□ -0.24
PSME3-215	ENST00000592578	BANF1	O75531	89 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PSME3-215	ENST00000592578	FAM155B	O75949	473 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PSME3-215	ENST00000592578	MED26	O95402	600 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PSME3-215	ENST00000592578	C8G	P07360	202 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PSME3-215	ENST00000592578	IVD	P26440	423 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PSME3-215	ENST00000592578	IMPA1	P29218	277 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PSME3-215	ENST00000592578	CA7	P43166	264 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PSME3-215	ENST00000592578	DR1	Q01658	176 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PSME3-215	ENST00000592578	MORF4L2	Q15014	288 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PSME3-215	ENST00000592578	RBBP7	Q16576	425 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PSME3-215	ENST00000592578	MSS51	Q4VC12	460 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PSME3-215	ENST00000592578	GARNL3	Q5VVW2	1013 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PSME3-215	ENST00000592578	SHISA6	Q6ZSJ9	500 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PSME3-215	ENST00000592578	CREG2	Q8IUH2	290 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PSME3-215	ENST00000592578	TMEM151B	Q8IW70	566 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PSME3-215	ENST00000592578	CNTN4	Q8IWV2	1026 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PSME3-215	ENST00000592578	KLHL7	Q8IXQ5	586 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PSME3-215	ENST00000592578	LRRC56	Q8IYG6	542 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
PSME3-215	ENST00000592578	MYO1H	Q8N1T3	1032 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PSME3-215	ENST00000592578	DTWD1	Q8N5C7	304 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PSME3-215	ENST00000592578	OR1N1	Q8NGS0	311 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PSME3-215	ENST00000592578	MTFMT	Q96DP5	389 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
PSME3-215	ENST00000592578	CERS2	Q96G23	380 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PSME3-215	ENST00000592578	C10orf90	Q96M02	699 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PSME3-215	ENST00000592578	CCDC138	Q96M89	665 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PSME3-215	ENST00000592578	OR2A5	Q96R48	311 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PSME3-215	ENST00000592578	CRB3	Q9BUF7	120 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PSME3-215	ENST00000592578	PPAN	Q9NQ55	473 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
PSME3-215	ENST00000592578	CCDC177	Q9NQR7	707 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
PSME3-215	ENST00000592578	RUVBL1	Q9Y265	456 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
PSME3-215	ENST00000592578	SAR1B	Q9Y6B6	198 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PSME3-215	ENST00000592578	TRAV17	A0A0B4J275	112 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PSME3-215	ENST00000592578	USP27X	A6NNY8	438 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PSME3-215	ENST00000592578	MASP2	O00187	686 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PSME3-215	ENST00000592578	SOCS6	O14544	535 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PSME3-215	ENST00000592578	SLC16A5	O15375	505 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PSME3-215	ENST00000592578	AHSG	P02765	367 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PSME3-215	ENST00000592578	ZGLP1	P0C6A0	271 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PSME3-215	ENST00000592578	FBL	P22087	321 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
PSME3-215	ENST00000592578	HRH2	P25021	359 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PSME3-215	ENST00000592578	PAFAH1B1	P43034	410 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PSME3-215	ENST00000592578	SP140	Q13342	867 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PSME3-215	ENST00000592578	MFAP5	Q13361	173 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PSME3-215	ENST00000592578	TUBB8	Q3ZCM7	444 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PSME3-215	ENST00000592578	PAQR3	Q6TCH7	311 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PSME3-215	ENST00000592578	KIRREL2	Q6UWL6	708 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PSME3-215	ENST00000592578	GALNT7	Q86SF2	657 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PSME3-215	ENST00000592578	ZNF295-AS1	Q8N0V1	137 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PSME3-215	ENST00000592578	EEF1AKMT1	Q8WVE0	214 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PSME3-215	ENST00000592578	LRRC39	Q96DD0	335 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PSME3-215	ENST00000592578	NAPG	Q99747	312 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
PSME3-215	ENST00000592578	PCBD2	Q9H0N5	130 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PSME3-215	ENST00000592578	PARVB	Q9HBI1	364 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PSME3-215	ENST00000592578	MCCC2	Q9HCC0	563 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PSME3-215	ENST00000592578	TMEM184C	Q9NVA4	438 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PSME3-215	ENST00000592578	STOX2	Q9P2F5	926 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
PSME3-215	ENST00000592578	SEC14L3	Q9UDX4	400 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PSME3-215	ENST00000592578	NF1	P21359	2839 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PSME3-215	ENST00000592578	MTOR	P42345	2549 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PSME3-215	ENST00000592578	IGLV3-12	A0A075B6K2	115 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PSME3-215	ENST00000592578		A0A1B0GTL3	188 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PSME3-215	ENST00000592578	PABPN1L	A6NDY0	278 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
PSME3-215	ENST00000592578		H7BY64	318 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PSME3-215	ENST00000592578	CCDC188	H7C350	402 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PSME3-215	ENST00000592578	HAT1	O14929	419 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PSME3-215	ENST00000592578	UNC5C	O95185	931 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PSME3-215	ENST00000592578	CLDN14	O95500	239 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PSME3-215	ENST00000592578	UQCRH	P07919	91 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PSME3-215	ENST00000592578	ANXA5	P08758	320 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PSME3-215	ENST00000592578	HIST1H2AG	P0C0S8	130 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
PSME3-215	ENST00000592578	HIST1H2AD	P20671	130 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PSME3-215	ENST00000592578	GABRB3	P28472	473 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PSME3-215	ENST00000592578	ELK3	P41970	407 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PSME3-215	ENST00000592578	ARL4C	P56559	192 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PSME3-215	ENST00000592578	TIAL1	Q01085	375 aa	Known RBP eCLIP	13.53	□□□□□ -0.24
PSME3-215	ENST00000592578	TLE4	Q04727	773 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PSME3-215	ENST00000592578	KLC1	Q07866	573 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PSME3-215	ENST00000592578	DSG2	Q14126	1118 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PSME3-215	ENST00000592578	NDUFA9	Q16795	377 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PSME3-215	ENST00000592578	HKDC1	Q2TB90	917 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PSME3-215	ENST00000592578	RBM20	Q5T481	1227 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24

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