RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592385.5

HDAC5-211, Transcript of histone deacetylase 5, humanhuman

TSL 5

Gene HDAC5, Length 2,601 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC5-211ENST00000592385 FZD4Q9ULV1 537 aa14.75□□□□□ -0.05
HDAC5-211ENST00000592385 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa14.75□□□□□ -0.05
HDAC5-211ENST00000592385 MYCP01106 439 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
HDAC5-211ENST00000592385 C9P02748 559 aa14.74□□□□□ -0.05
HDAC5-211ENST00000592385 CYP4B1P13584 511 aa14.74□□□□□ -0.05
HDAC5-211ENST00000592385 HOXA9P31269 272 aa14.74□□□□□ -0.05
HDAC5-211ENST00000592385 FMO3P31513 532 aa14.74□□□□□ -0.05
HDAC5-211ENST00000592385 RXRGP48443 463 aa14.74□□□□□ -0.05
HDAC5-211ENST00000592385 MVKQ03426 396 aa14.74□□□□□ -0.05
HDAC5-211ENST00000592385 NPTX1Q15818 432 aa14.74□□□□□ -0.05
HDAC5-211ENST00000592385 DPPA4Q7L190 304 aa14.74□□□□□ -0.05
HDAC5-211ENST00000592385 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa14.74□□□□□ -0.05
HDAC5-211ENST00000592385 GALNT10Q86SR1 603 aa14.74□□□□□ -0.05
HDAC5-211ENST00000592385 NPAS3Q8IXF0 933 aa14.74□□□□□ -0.05
HDAC5-211ENST00000592385 PARP8Q8N3A8 854 aa14.74□□□□□ -0.05
HDAC5-211ENST00000592385 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
HDAC5-211ENST00000592385 CXorf40BQ96DE9 158 aa14.74□□□□□ -0.05
HDAC5-211ENST00000592385 EPYCQ99645 322 aa14.74□□□□□ -0.05
HDAC5-211ENST00000592385 PITX2Q99697 317 aa14.74□□□□□ -0.05
HDAC5-211ENST00000592385 CCM2Q9BSQ5 444 aa14.74□□□□□ -0.05
HDAC5-211ENST00000592385 SPHK2Q9NRA0 654 aa14.74□□□□□ -0.05
HDAC5-211ENST00000592385 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
HDAC5-211ENST00000592385 ERVK-18Q9QC07 812 aa14.74□□□□□ -0.05
HDAC5-211ENST00000592385 SLC22A1O15245 554 aa14.74□□□□□ -0.05
HDAC5-211ENST00000592385 XYLBO75191 536 aa14.74□□□□□ -0.05
HDAC5-211ENST00000592385 DIRAS1O95057 198 aa14.74□□□□□ -0.05
HDAC5-211ENST00000592385 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
HDAC5-211ENST00000592385 IMPA1P29218 277 aa14.74□□□□□ -0.05
HDAC5-211ENST00000592385 MLLT10P55197 1068 aa14.74□□□□□ -0.05
HDAC5-211ENST00000592385 IL1RL1Q01638 556 aa14.74□□□□□ -0.05
HDAC5-211ENST00000592385 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
HDAC5-211ENST00000592385 IQCCQ4KMZ1 466 aa14.74□□□□□ -0.05
HDAC5-211ENST00000592385 ARSIQ5FYB1 569 aa14.74□□□□□ -0.05
HDAC5-211ENST00000592385 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
HDAC5-211ENST00000592385 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
HDAC5-211ENST00000592385 SVOPQ8N4V2 548 aa14.74□□□□□ -0.05
HDAC5-211ENST00000592385 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa14.74□□□□□ -0.05
HDAC5-211ENST00000592385 OR7G3Q8NG95 312 aa14.74□□□□□ -0.05
HDAC5-211ENST00000592385 ZFP90Q8TF47 636 aa14.74□□□□□ -0.05
HDAC5-211ENST00000592385 GLYATL1Q969I3 302 aa14.74□□□□□ -0.05
HDAC5-211ENST00000592385 C7orf34Q96L11 122 aa14.74□□□□□ -0.05
HDAC5-211ENST00000592385 FOPNLQ96NB1 174 aa14.74□□□□□ -0.05
HDAC5-211ENST00000592385 ZNF347Q96SE7 839 aa14.74□□□□□ -0.05
HDAC5-211ENST00000592385 NECTIN3Q9NQS3 549 aa14.74□□□□□ -0.05
HDAC5-211ENST00000592385 ADPRHL2Q9NX46 363 aa14.74□□□□□ -0.05
HDAC5-211ENST00000592385 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
HDAC5-211ENST00000592385 DKK3Q9UBP4 350 aa14.74□□□□□ -0.05
HDAC5-211ENST00000592385 E9PQ18 207 aa14.73□□□□□ -0.05
HDAC5-211ENST00000592385 NPC1O15118 1278 aa14.73□□□□□ -0.05
HDAC5-211ENST00000592385 CCL16O15467 120 aa14.73□□□□□ -0.05
HDAC5-211ENST00000592385 ETHE1O95571 254 aa14.73□□□□□ -0.05
HDAC5-211ENST00000592385 SLC16A8O95907 504 aa14.73□□□□□ -0.05
HDAC5-211ENST00000592385 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
HDAC5-211ENST00000592385 IDSP22304 550 aa14.73□□□□□ -0.05
HDAC5-211ENST00000592385 CD6P30203 668 aa14.73□□□□□ -0.05
HDAC5-211ENST00000592385 PCGF2P35227 344 aa14.73□□□□□ -0.05
HDAC5-211ENST00000592385 CTSCP53634 463 aa14.73□□□□□ -0.05
HDAC5-211ENST00000592385 WDR5P61964 334 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
HDAC5-211ENST00000592385 TEAD4Q15561 434 aa14.73□□□□□ -0.05
HDAC5-211ENST00000592385 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
HDAC5-211ENST00000592385 C1orf53Q5VUE5 145 aa14.73□□□□□ -0.05
HDAC5-211ENST00000592385 TMEM215Q68D42 235 aa14.73□□□□□ -0.05
HDAC5-211ENST00000592385 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
HDAC5-211ENST00000592385 DCDC5Q6ZRR9 648 aa14.73□□□□□ -0.05
HDAC5-211ENST00000592385 ATG16L2Q8NAA4 619 aa14.73□□□□□ -0.05
HDAC5-211ENST00000592385 HCAR2Q8TDS4 363 aa14.73□□□□□ -0.05
HDAC5-211ENST00000592385 CHPT1Q8WUD6 406 aa14.73□□□□□ -0.05
HDAC5-211ENST00000592385 YME1L1Q96TA2 773 aa14.73□□□□□ -0.05
HDAC5-211ENST00000592385 PKP4Q99569 1192 aa14.73□□□□□ -0.05
HDAC5-211ENST00000592385 TMEM39AQ9NV64 488 aa14.73□□□□□ -0.05
HDAC5-211ENST00000592385 FAM8A1Q9UBU6 413 aa14.73□□□□□ -0.05
HDAC5-211ENST00000592385 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
HDAC5-211ENST00000592385 VPS4AQ9UN37 437 aa14.73□□□□□ -0.05
HDAC5-211ENST00000592385 PADI2Q9Y2J8 665 aa14.73□□□□□ -0.05
HDAC5-211ENST00000592385 PCM1Q15154 2024 aa14.73□□□□□ -0.05
HDAC5-211ENST00000592385 MGAT4DA6NG13 374 aa14.73□□□□□ -0.05
HDAC5-211ENST00000592385 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
HDAC5-211ENST00000592385 SUV39H1O43463 412 aa14.73□□□□□ -0.05
HDAC5-211ENST00000592385 FGF19O95750 216 aa14.73□□□□□ -0.05
HDAC5-211ENST00000592385 TFPTP0C1Z6 253 aa14.73□□□□□ -0.05
HDAC5-211ENST00000592385 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP14.73□□□□□ -0.05
HDAC5-211ENST00000592385 NNMTP40261 264 aa14.73□□□□□ -0.05
HDAC5-211ENST00000592385 EPHA5P54756 1037 aa14.73□□□□□ -0.05
HDAC5-211ENST00000592385 KCNJ10P78508 379 aa14.73□□□□□ -0.05
HDAC5-211ENST00000592385 NR1D2Q14995 579 aa14.73□□□□□ -0.05
HDAC5-211ENST00000592385 RGNQ15493 299 aa14.73□□□□□ -0.05
HDAC5-211ENST00000592385 PROX2Q3B8N5 592 aa14.73□□□□□ -0.05
HDAC5-211ENST00000592385 CCSMST1Q4G0I0 132 aa14.73□□□□□ -0.05
HDAC5-211ENST00000592385 HUS1BQ8NHY5 278 aa14.73□□□□□ -0.05
HDAC5-211ENST00000592385 RNF217Q8TC41 542 aa14.73□□□□□ -0.05
HDAC5-211ENST00000592385 REPS1Q96D71 796 aa14.73□□□□□ -0.05
HDAC5-211ENST00000592385 LRIG1Q96JA1 1093 aa14.73□□□□□ -0.05
HDAC5-211ENST00000592385 MRGPRX3Q96LB0 322 aa14.73□□□□□ -0.05
HDAC5-211ENST00000592385 TBC1D14Q9P2M4 693 aa14.73□□□□□ -0.05
HDAC5-211ENST00000592385 TRIM17Q9Y577 477 aa14.73□□□□□ -0.05
HDAC5-211ENST00000592385 CORINQ9Y5Q5 1042 aa14.73□□□□□ -0.05
HDAC5-211ENST00000592385 KCNE2Q9Y6J6 123 aa14.73□□□□□ -0.05
HDAC5-211ENST00000592385 EFCAB14O75071 495 aa14.72□□□□□ -0.05
HDAC5-211ENST00000592385 CXCL14O95715 111 aa14.72□□□□□ -0.05
HDAC5-211ENST00000592385 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.2 ms