RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000581080.1

RARA-AS1-201, RARA antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RARA-AS1, Length 1,790 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARA-AS1-201ENST00000581080 HAT1O14929 419 aa22.41■■□□□ 1.18
RARA-AS1-201ENST00000581080 ZW10O43264 779 aa22.41■■□□□ 1.18
RARA-AS1-201ENST00000581080 PCDHGA12O60330 932 aa22.41■■□□□ 1.18
RARA-AS1-201ENST00000581080 TGFB1P01137 390 aa22.41■■□□□ 1.18
RARA-AS1-201ENST00000581080 ENGP17813 658 aa22.41■■□□□ 1.18
RARA-AS1-201ENST00000581080 LSSP48449 732 aa22.41■■□□□ 1.18
RARA-AS1-201ENST00000581080 STX1BP61266 288 aa22.41■■□□□ 1.18
RARA-AS1-201ENST00000581080 PPP1CAP62136 330 aa22.41■■□□□ 1.18
RARA-AS1-201ENST00000581080 NAA25Q14CX7 972 aa22.41■■□□□ 1.18
RARA-AS1-201ENST00000581080 SPRED3Q2MJR0 410 aa22.41■■□□□ 1.18
RARA-AS1-201ENST00000581080 IL23RQ5VWK5 629 aa22.41■■□□□ 1.18
RARA-AS1-201ENST00000581080 TBC1D19Q8N5T2 526 aa22.41■■□□□ 1.18
RARA-AS1-201ENST00000581080 TTLQ8NG68 377 aa22.41■■□□□ 1.18
RARA-AS1-201ENST00000581080 PPM1MQ96MI6 270 aa22.41■■□□□ 1.18
RARA-AS1-201ENST00000581080 TUBB6Q9BUF5 446 aa22.41■■□□□ 1.18
RARA-AS1-201ENST00000581080 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
RARA-AS1-201ENST00000581080 NMRK1Q9NWW6 199 aa22.41■■□□□ 1.18
RARA-AS1-201ENST00000581080 ANKMY1Q9P2S6 941 aa22.41■■□□□ 1.18
RARA-AS1-201ENST00000581080 PADI4Q9UM07 663 aa22.41■■□□□ 1.18
RARA-AS1-201ENST00000581080 TMED5Q9Y3A6 229 aa22.41■■□□□ 1.18
RARA-AS1-201ENST00000581080 DMDP11532 3685 aa22.41■■□□□ 1.18
RARA-AS1-201ENST00000581080 A0A0J9YY10 115 aa22.4■■□□□ 1.18
RARA-AS1-201ENST00000581080 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
RARA-AS1-201ENST00000581080 PIK3R1P27986 724 aa22.4■■□□□ 1.18
RARA-AS1-201ENST00000581080 GSTM2P28161 218 aa22.4■■□□□ 1.18
RARA-AS1-201ENST00000581080 ALDH4A1P30038 563 aa22.4■■□□□ 1.18
RARA-AS1-201ENST00000581080 BCL6P41182 706 aa22.4■■□□□ 1.18
RARA-AS1-201ENST00000581080 GPR3P46089 330 aa22.4■■□□□ 1.18
RARA-AS1-201ENST00000581080 MRPL19P49406 292 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
RARA-AS1-201ENST00000581080 RPS6KA2Q15349 733 aa22.4■■□□□ 1.18
RARA-AS1-201ENST00000581080 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
RARA-AS1-201ENST00000581080 MIER2Q8N344 545 aa22.4■■□□□ 1.18
RARA-AS1-201ENST00000581080 FAM181AQ8N9Y4 354 aa22.4■■□□□ 1.18
RARA-AS1-201ENST00000581080 BRINP2Q9C0B6 783 aa22.4■■□□□ 1.18
RARA-AS1-201ENST00000581080 ABCG4Q9H172 646 aa22.4■■□□□ 1.18
RARA-AS1-201ENST00000581080 EVA1BQ9NVM1 165 aa22.4■■□□□ 1.18
RARA-AS1-201ENST00000581080 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
RARA-AS1-201ENST00000581080 MYO15AQ9UKN7 3530 aa22.4■■□□□ 1.18
RARA-AS1-201ENST00000581080 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
RARA-AS1-201ENST00000581080 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
RARA-AS1-201ENST00000581080 MYF5P13349 255 aa22.4■■□□□ 1.18
RARA-AS1-201ENST00000581080 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
RARA-AS1-201ENST00000581080 GPX3P22352 226 aa22.4■■□□□ 1.18
RARA-AS1-201ENST00000581080 AHRP35869 848 aa22.4■■□□□ 1.18
RARA-AS1-201ENST00000581080 CYP4F2P78329 520 aa22.4■■□□□ 1.18
RARA-AS1-201ENST00000581080 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
RARA-AS1-201ENST00000581080 NR1D2Q14995 579 aa22.4■■□□□ 1.18
RARA-AS1-201ENST00000581080 FCRL6Q6DN72 434 aa22.4■■□□□ 1.18
RARA-AS1-201ENST00000581080 LAIR1Q6GTX8 287 aa22.4■■□□□ 1.18
RARA-AS1-201ENST00000581080 FIGLAQ6QHK4 219 aa22.4■■□□□ 1.18
RARA-AS1-201ENST00000581080 PARP9Q8IXQ6 854 aa22.4■■□□□ 1.18
RARA-AS1-201ENST00000581080 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
RARA-AS1-201ENST00000581080 NSL1Q96IY1 281 aa22.4■■□□□ 1.18
RARA-AS1-201ENST00000581080 APOLD1Q96LR9 279 aa22.4■■□□□ 1.18
RARA-AS1-201ENST00000581080 SERPINI1Q99574 410 aa22.4■■□□□ 1.18
RARA-AS1-201ENST00000581080 OR51B5Q9H339 312 aa22.4■■□□□ 1.18
RARA-AS1-201ENST00000581080 ASIC5Q9NY37 505 aa22.4■■□□□ 1.18
RARA-AS1-201ENST00000581080 SIGLEC6O43699 453 aa22.39■■□□□ 1.17
RARA-AS1-201ENST00000581080 SH3BGRLO75368 114 aa22.39■■□□□ 1.17
RARA-AS1-201ENST00000581080 UNC5CO95185 931 aa22.39■■□□□ 1.17
RARA-AS1-201ENST00000581080 G6PDP11413 515 aa22.39■■□□□ 1.17
RARA-AS1-201ENST00000581080 EZRP15311 586 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
RARA-AS1-201ENST00000581080 RELAQ04206 551 aa22.39■■□□□ 1.17
RARA-AS1-201ENST00000581080 CUL3Q13618 768 aa22.39■■□□□ 1.17
RARA-AS1-201ENST00000581080 TCEAL6Q6IPX3 200 aa22.39■■□□□ 1.17
RARA-AS1-201ENST00000581080 FBXO42Q6P3S6 717 aa22.39■■□□□ 1.17
RARA-AS1-201ENST00000581080 MINDY1Q8N5J2 469 aa22.39■■□□□ 1.17
RARA-AS1-201ENST00000581080 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
RARA-AS1-201ENST00000581080 CHTF18Q8WVB6 975 aa22.39■■□□□ 1.17
RARA-AS1-201ENST00000581080 TCEAL3Q969E4 200 aa22.39■■□□□ 1.17
RARA-AS1-201ENST00000581080 CMTM5Q96DZ9 223 aa22.39■■□□□ 1.17
RARA-AS1-201ENST00000581080 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
RARA-AS1-201ENST00000581080 RAB33BQ9H082 229 aa22.39■■□□□ 1.17
RARA-AS1-201ENST00000581080 TAGLN3Q9UI15 199 aa22.39■■□□□ 1.17
RARA-AS1-201ENST00000581080 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
RARA-AS1-201ENST00000581080 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa22.39■■□□□ 1.17
RARA-AS1-201ENST00000581080 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa22.39■■□□□ 1.17
RARA-AS1-201ENST00000581080 CACNA1HO95180 2353 aa22.39■■□□□ 1.17
RARA-AS1-201ENST00000581080 CLEC3AO75596 197 aa22.38■■□□□ 1.17
RARA-AS1-201ENST00000581080 ACPPP15309 386 aa22.38■■□□□ 1.17
RARA-AS1-201ENST00000581080 CD1EP15812 388 aa22.38■■□□□ 1.17
RARA-AS1-201ENST00000581080 ACADVLP49748 655 aa22.38■■□□□ 1.17
RARA-AS1-201ENST00000581080 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
RARA-AS1-201ENST00000581080 ACSM2AQ08AH3 577 aa22.38■■□□□ 1.17
RARA-AS1-201ENST00000581080 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
RARA-AS1-201ENST00000581080 ACSM2BQ68CK6 577 aa22.38■■□□□ 1.17
RARA-AS1-201ENST00000581080 PAOXQ6QHF9 649 aa22.38■■□□□ 1.17
RARA-AS1-201ENST00000581080 MFSD9Q8NBP5 474 aa22.38■■□□□ 1.17
RARA-AS1-201ENST00000581080 OR6C4Q8NGE1 309 aa22.38■■□□□ 1.17
RARA-AS1-201ENST00000581080 CREB3L4Q8TEY5 395 aa22.38■■□□□ 1.17
RARA-AS1-201ENST00000581080 MS4A8Q9BY19 250 aa22.38■■□□□ 1.17
RARA-AS1-201ENST00000581080 SEMA6CQ9H3T2 930 aa22.38■■□□□ 1.17
RARA-AS1-201ENST00000581080 EPB41L1Q9H4G0 881 aa22.38■■□□□ 1.17
RARA-AS1-201ENST00000581080 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa22.38■■□□□ 1.17
RARA-AS1-201ENST00000581080 LOC100653049A0A140TA62 436 aa22.38■■□□□ 1.17
RARA-AS1-201ENST00000581080 ATP5HO75947 161 aa22.38■■□□□ 1.17
RARA-AS1-201ENST00000581080 KRT34O76011 436 aa22.38■■□□□ 1.17
RARA-AS1-201ENST00000581080 PVRP15151 417 aa22.38■■□□□ 1.17
RARA-AS1-201ENST00000581080 CALB2P22676 271 aa22.38■■□□□ 1.17
RARA-AS1-201ENST00000581080 PRDX6P30041 224 aa22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.8 ms