RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577468.2

PTPRM-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-204ENST00000577468 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa2.96□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 COQ6Q9Y2Z9 468 aa2.96□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 L3MBTL1Q9Y468 752 aa2.96□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 HYOU1Q9Y4L1 999 aa2.96□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa2.96□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 USH1CQ9Y6N9 552 aa2.96□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP2.96□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa2.96□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 MAST3O60307 1309 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP2.95□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 AOX1Q06278 1338 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 SETD5Q9C0A6 1442 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 A0A0G2JLW4 131 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 A0A1W2PPV4 95 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 ESYT2A0FGR8 921 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 PRR23AA6NEV1 266 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP2.95□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 ARHGAP42A6NI28 874 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 LIPT2A6NK58 231 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 ASB14A6NK59 587 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 LRRC53A6NM62 1247 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP2.95□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 DRGXA6NNA5 263 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 MYO1GB0I1T2 1018 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 E7ESA3 106 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 LRRN3E7EW58 273 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 CES2O00748 559 aa2.95□□□□□ -1.94
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PTPRM-204ENST00000577468 CTDSP2O14595 271 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 TM9SF1O15321 606 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP2.95□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 HBP1O60381 514 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 CST8O60676 142 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 CDH16O75309 829 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 PROP1O75360 226 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 GPR32O75388 356 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 ACTL6BO94805 426 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 ATP6V1G2O95670 118 aa2.95□□□□□ -1.94
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PTPRM-204ENST00000577468 IQCF3P0C7M6 154 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 TMEM191BP0C7N4 346 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 OR2T7P0C7T2 308 aa2.95□□□□□ -1.94
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PTPRM-204ENST00000577468 ACADSP16219 412 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 MAGP20916 626 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 UCP1P25874 307 aa2.95□□□□□ -1.94
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PTPRM-204ENST00000577468 ICAM3P32942 547 aa2.95□□□□□ -1.94
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PTPRM-204ENST00000577468 OMPP47874 163 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 HCAR3P49019 387 aa2.95□□□□□ -1.94
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PTPRM-204ENST00000577468 RASSF2P50749 326 aa2.95□□□□□ -1.94
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PTPRM-204ENST00000577468 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP2.95□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 SLC16A1P53985 500 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 PRKAG1P54619 331 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP2.95□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 NRG3P56975 720 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 DCDC1P59894 354 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 UBE2G2P60604 165 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 ACTBP60709 375 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 AP1S1P61966 158 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 ACTA2P62736 377 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 VSNL1P62760 191 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 ACTG1P63261 375 aa2.95□□□□□ -1.94
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PTPRM-204ENST00000577468 B4GALNT1Q00973 533 aa2.95□□□□□ -1.94
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PTPRM-204ENST00000577468 GHRHRQ02643 423 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 CACNG1Q06432 222 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 SLC3A1Q07837 685 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 SPOCK1Q08629 439 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 TROAPQ12815 778 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 PDZK1IP1Q13113 114 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP2.95□□□□□ -1.945e-6■■■□□ 15.4
PTPRM-204ENST00000577468 OLIG2Q13516 323 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 ALCAMQ13740 583 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
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