RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557549.5

RBM23-231, Transcript of RNA binding motif protein 23, human

TSL 3

Gene RBM23, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM23-231	ENST00000557549	CXCR2	P25025	360 aa		11.76	□□□□□ -0.53
RBM23-231	ENST00000557549	GSTM2	P28161	218 aa		11.76	□□□□□ -0.53
RBM23-231	ENST00000557549	VSX2	P58304	361 aa	Predicted RBP	11.76	□□□□□ -0.53
RBM23-231	ENST00000557549	ARF3	P61204	181 aa	Predicted RBP	11.76	□□□□□ -0.53
RBM23-231	ENST00000557549	CSNK1G2	P78368	415 aa		11.76	□□□□□ -0.53
RBM23-231	ENST00000557549	DLG1	Q12959	904 aa		11.76	□□□□□ -0.53
RBM23-231	ENST00000557549	OR4D1	Q15615	310 aa		11.76	□□□□□ -0.53
RBM23-231	ENST00000557549	UGT8	Q16880	541 aa		11.76	□□□□□ -0.53
RBM23-231	ENST00000557549	FRMPD2B	Q6IN97	320 aa		11.76	□□□□□ -0.53
RBM23-231	ENST00000557549	EMB	Q6PCB8	327 aa		11.76	□□□□□ -0.53
RBM23-231	ENST00000557549	TMEM151B	Q8IW70	566 aa		11.76	□□□□□ -0.53
RBM23-231	ENST00000557549	SPATA6L	Q8N4H0	392 aa		11.76	□□□□□ -0.53
RBM23-231	ENST00000557549	ACMSD	Q8TDX5	336 aa		11.76	□□□□□ -0.53
RBM23-231	ENST00000557549	SLC5A11	Q8WWX8	675 aa		11.76	□□□□□ -0.53
RBM23-231	ENST00000557549	FKBP10	Q96AY3	582 aa		11.76	□□□□□ -0.53
RBM23-231	ENST00000557549	ALKBH8	Q96BT7	664 aa	Known RBP	11.76	□□□□□ -0.53
RBM23-231	ENST00000557549	PYCR2	Q96C36	320 aa		11.76	□□□□□ -0.53
RBM23-231	ENST00000557549	NXNL1	Q96CM4	212 aa		11.76	□□□□□ -0.53
RBM23-231	ENST00000557549	SEC16B	Q96JE7	1060 aa		11.76	□□□□□ -0.53
RBM23-231	ENST00000557549	EPB41L4B	Q9H329	900 aa		11.76	□□□□□ -0.53
RBM23-231	ENST00000557549	EHD1	Q9H4M9	534 aa		11.76	□□□□□ -0.53
RBM23-231	ENST00000557549	ALG9	Q9H6U8	611 aa		11.76	□□□□□ -0.53
RBM23-231	ENST00000557549	CUTC	Q9NTM9	273 aa		11.76	□□□□□ -0.53
RBM23-231	ENST00000557549	ABCF3	Q9NUQ8	709 aa		11.76	□□□□□ -0.53
RBM23-231	ENST00000557549	CUEDC1	Q9NWM3	386 aa	Predicted RBP	11.76	□□□□□ -0.53
RBM23-231	ENST00000557549	WWOX	Q9NZC7	414 aa		11.76	□□□□□ -0.53
RBM23-231	ENST00000557549	PSMC3IP	Q9P2W1	217 aa	Predicted RBP	11.76	□□□□□ -0.53
RBM23-231	ENST00000557549	TUBD1	Q9UJT1	453 aa		11.76	□□□□□ -0.53
RBM23-231	ENST00000557549	TCFL5	Q9UL49	500 aa		11.76	□□□□□ -0.53
RBM23-231	ENST00000557549	TMCO1	Q9UM00	188 aa		11.76	□□□□□ -0.53
RBM23-231	ENST00000557549	CDC14A	Q9UNH5	594 aa		11.76	□□□□□ -0.53
RBM23-231	ENST00000557549	SLC22A14	Q9Y267	594 aa		11.76	□□□□□ -0.53
RBM23-231	ENST00000557549	MAN2B2	Q9Y2E5	1009 aa		11.76	□□□□□ -0.53
RBM23-231	ENST00000557549	SPTA1	P02549	2419 aa		11.76	□□□□□ -0.53
RBM23-231	ENST00000557549	LOC105369274	A0A096LPK9	316 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RBM23-231	ENST00000557549	LOC102723532	A0A0G2JNH3	316 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RBM23-231	ENST00000557549	TRBC2	A0A5B9	178 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RBM23-231	ENST00000557549	TRIM49D1	C9J1S8	452 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RBM23-231	ENST00000557549	HAT1	O14929	419 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RBM23-231	ENST00000557549	PRPF4	O43172	522 aa	Known RBP eCLIP	11.75	□□□□□ -0.53
RBM23-231	ENST00000557549	SLC28A2	O43868	658 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RBM23-231	ENST00000557549	STK16	O75716	305 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RBM23-231	ENST00000557549	DNAJB5	O75953	348 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RBM23-231	ENST00000557549	WDR47	O94967	919 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RBM23-231	ENST00000557549	CDH1	P12830	882 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RBM23-231	ENST00000557549	NR1D1	P20393	614 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RBM23-231	ENST00000557549	GCA	P28676	217 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RBM23-231	ENST00000557549	AHR	P35869	848 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RBM23-231	ENST00000557549	FOXL2	P58012	376 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RBM23-231	ENST00000557549	PCDH1	Q08174	1060 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RBM23-231	ENST00000557549	CHAF1B	Q13112	559 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RBM23-231	ENST00000557549	FAM53B	Q14153	422 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RBM23-231	ENST00000557549	SLC9A5	Q14940	896 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RBM23-231	ENST00000557549	NDUFA9	Q16795	377 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RBM23-231	ENST00000557549	NKAIN1	Q4KMZ8	207 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RBM23-231	ENST00000557549	MLIP	Q5VWP3	458 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RBM23-231	ENST00000557549	LRRC70	Q7Z2Q7	622 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RBM23-231	ENST00000557549	PRICKLE2	Q7Z3G6	844 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RBM23-231	ENST00000557549	TDRP	Q86YL5	185 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RBM23-231	ENST00000557549	GSPT2	Q8IYD1	628 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
RBM23-231	ENST00000557549	OR4N4	Q8N0Y3	316 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RBM23-231	ENST00000557549	CSNK1A1L	Q8N752	337 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RBM23-231	ENST00000557549	MFSD9	Q8NBP5	474 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RBM23-231	ENST00000557549	CAMKV	Q8NCB2	501 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RBM23-231	ENST00000557549	C9orf43	Q8TAL5	461 aa	Predicted RBP	11.75	□□□□□ -0.53
RBM23-231	ENST00000557549	UHMK1	Q8TAS1	419 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
RBM23-231	ENST00000557549	ADAMTS17	Q8TE56	1095 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RBM23-231	ENST00000557549	UBTD2	Q8WUN7	234 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RBM23-231	ENST00000557549	KCTD4	Q8WVF5	259 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RBM23-231	ENST00000557549	UBLCP1	Q8WVY7	318 aa	Predicted RBP	11.75	□□□□□ -0.53
RBM23-231	ENST00000557549	NEIL2	Q969S2	332 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RBM23-231	ENST00000557549	NACC2	Q96BF6	587 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RBM23-231	ENST00000557549	TM4SF19	Q96DZ7	209 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RBM23-231	ENST00000557549	TSNARE1	Q96NA8	513 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RBM23-231	ENST00000557549	GPR78	Q96P69	363 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RBM23-231	ENST00000557549	AIF1L	Q9BQI0	150 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RBM23-231	ENST00000557549	TRIM55	Q9BYV6	548 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RBM23-231	ENST00000557549	VPS11	Q9H270	941 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RBM23-231	ENST00000557549	CD274	Q9NZQ7	290 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RBM23-231	ENST00000557549	HEMK1	Q9Y5R4	338 aa	Predicted RBP	11.75	□□□□□ -0.53
RBM23-231	ENST00000557549	PCSK5	Q92824	1860 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RBM23-231	ENST00000557549	TNRC6A	Q8NDV7	1962 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
RBM23-231	ENST00000557549	ARGFX	A6NJG6	315 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RBM23-231	ENST00000557549	MAP2K7	O14733	419 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RBM23-231	ENST00000557549	TAPBP	O15533	448 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RBM23-231	ENST00000557549	SUV39H1	O43463	412 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RBM23-231	ENST00000557549	KLK8	O60259	260 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RBM23-231	ENST00000557549	CNOT3	O75175	753 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
RBM23-231	ENST00000557549	H2AFY	O75367	372 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
RBM23-231	ENST00000557549	KLF7	O75840	302 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
RBM23-231	ENST00000557549	ALAS2	P22557	587 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RBM23-231	ENST00000557549	KCNC1	P48547	511 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RBM23-231	ENST00000557549	ALDH18A1	P54886	795 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
RBM23-231	ENST00000557549	VSNL1	P62760	191 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RBM23-231	ENST00000557549	CDC16	Q13042	620 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RBM23-231	ENST00000557549	PWP1	Q13610	501 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RBM23-231	ENST00000557549	NCF4	Q15080	339 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RBM23-231	ENST00000557549	COLEC12	Q5KU26	742 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RBM23-231	ENST00000557549	CPZ	Q66K79	652 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RBM23-231	ENST00000557549	ATG9B	Q674R7	924 aa		11.74	□□□□□ -0.53

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.5 ms