RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552222.5

CS-231, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 555 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-231	ENST00000552222	UNC5D	Q6UXZ4	953 aa		13.19	□□□□□ -0.3
CS-231	ENST00000552222	CYHR1	Q6ZMK1	362 aa		13.19	□□□□□ -0.3
CS-231	ENST00000552222	TRIM73	Q86UV7	250 aa		13.19	□□□□□ -0.3
CS-231	ENST00000552222	OOSP2	Q86WS3	158 aa		13.19	□□□□□ -0.3
CS-231	ENST00000552222	MREG	Q8N565	214 aa		13.19	□□□□□ -0.3
CS-231	ENST00000552222	MYRIP	Q8NFW9	859 aa		13.19	□□□□□ -0.3
CS-231	ENST00000552222	SKA2	Q8WVK7	121 aa	Predicted RBP	13.19	□□□□□ -0.3
CS-231	ENST00000552222	ASB11	Q8WXH4	323 aa		13.19	□□□□□ -0.3
CS-231	ENST00000552222	TSPAN17	Q96FV3	270 aa		13.19	□□□□□ -0.3
CS-231	ENST00000552222	PDLIM5	Q96HC4	596 aa	Known RBP	13.19	□□□□□ -0.3
CS-231	ENST00000552222	FERD3L	Q96RJ6	166 aa		13.19	□□□□□ -0.3
CS-231	ENST00000552222	TMUB1	Q9BVT8	246 aa		13.19	□□□□□ -0.3
CS-231	ENST00000552222	SLC22A11	Q9NSA0	550 aa		13.19	□□□□□ -0.3
CS-231	ENST00000552222	SLC24A2	Q9UI40	661 aa		13.19	□□□□□ -0.3
CS-231	ENST00000552222	RUVBL2	Q9Y230	463 aa	Known RBP	13.19	□□□□□ -0.3
CS-231	ENST00000552222	NFS1	Q9Y697	457 aa		13.19	□□□□□ -0.3
CS-231	ENST00000552222	IKBKG	Q9Y6K9	419 aa		13.19	□□□□□ -0.3
CS-231	ENST00000552222	DOCK10	Q96BY6	2186 aa		13.18	□□□□□ -0.3
CS-231	ENST00000552222	BTN3A3	O00478	584 aa		13.18	□□□□□ -0.3
CS-231	ENST00000552222	PSIP1	O75475	530 aa	Known RBP	13.18	□□□□□ -0.3
CS-231	ENST00000552222	IPO13	O94829	963 aa	Known RBP	13.18	□□□□□ -0.3
CS-231	ENST00000552222	C1orf105	O95561	183 aa		13.18	□□□□□ -0.3
CS-231	ENST00000552222	RPN2	P04844	631 aa		13.18	□□□□□ -0.3
CS-231	ENST00000552222	CD99	P14209	185 aa		13.18	□□□□□ -0.3
CS-231	ENST00000552222	SSTR2	P30874	369 aa		13.18	□□□□□ -0.3
CS-231	ENST00000552222	SERPINB9	P50453	376 aa		13.18	□□□□□ -0.3
CS-231	ENST00000552222	SLC12A2	P55011	1212 aa		13.18	□□□□□ -0.3
CS-231	ENST00000552222	SOX8	P57073	446 aa		13.18	□□□□□ -0.3
CS-231	ENST00000552222	RAB10	P61026	200 aa		13.18	□□□□□ -0.3
CS-231	ENST00000552222	PRKG2	Q13237	762 aa		13.18	□□□□□ -0.3
CS-231	ENST00000552222	BMPR2	Q13873	1038 aa		13.18	□□□□□ -0.3
CS-231	ENST00000552222	CYP2A13	Q16696	494 aa		13.18	□□□□□ -0.3
CS-231	ENST00000552222	MROH9	Q5TGP6	573 aa		13.18	□□□□□ -0.3
CS-231	ENST00000552222	LRRC8E	Q6NSJ5	796 aa		13.18	□□□□□ -0.3
CS-231	ENST00000552222	ARMC6	Q6NXE6	501 aa		13.18	□□□□□ -0.3
CS-231	ENST00000552222	IGFL2	Q6UWQ7	119 aa		13.18	□□□□□ -0.3
CS-231	ENST00000552222		Q71RC1	249 aa	Predicted RBP	13.18	□□□□□ -0.3
CS-231	ENST00000552222	PIWIL4	Q7Z3Z4	852 aa	Known RBP	13.18	□□□□□ -0.3
CS-231	ENST00000552222	DCUN1D3	Q8IWE4	304 aa		13.18	□□□□□ -0.3
CS-231	ENST00000552222	DTWD1	Q8N5C7	304 aa		13.18	□□□□□ -0.3
CS-231	ENST00000552222	OR8K5	Q8NH50	307 aa		13.18	□□□□□ -0.3
CS-231	ENST00000552222	CFAP61	Q8NHU2	1237 aa		13.18	□□□□□ -0.3
CS-231	ENST00000552222	LINGO1	Q96FE5	620 aa		13.18	□□□□□ -0.3
CS-231	ENST00000552222	FOPNL	Q96NB1	174 aa		13.18	□□□□□ -0.3
CS-231	ENST00000552222	CD180	Q99467	661 aa		13.18	□□□□□ -0.3
CS-231	ENST00000552222	CCDC77	Q9BR77	488 aa		13.18	□□□□□ -0.3
CS-231	ENST00000552222	HGH1	Q9BTY7	390 aa		13.18	□□□□□ -0.3
CS-231	ENST00000552222	POLG2	Q9UHN1	485 aa		13.18	□□□□□ -0.3
CS-231	ENST00000552222	TSR3	Q9UJK0	312 aa	Known RBP	13.18	□□□□□ -0.3
CS-231	ENST00000552222	ABCA2	Q9BZC7	2435 aa		13.17	□□□□□ -0.3
CS-231	ENST00000552222	GSAP	A4D1B5	854 aa		13.17	□□□□□ -0.3
CS-231	ENST00000552222		E7EQ34	232 aa		13.17	□□□□□ -0.3
CS-231	ENST00000552222	GFY	I3L273	518 aa		13.17	□□□□□ -0.3
CS-231	ENST00000552222	CTIF	O43310	598 aa	Known RBP	13.17	□□□□□ -0.3
CS-231	ENST00000552222	NUDT17	P0C025	328 aa		13.17	□□□□□ -0.3
CS-231	ENST00000552222	TPBGL	P0DKB5	382 aa		13.17	□□□□□ -0.3
CS-231	ENST00000552222	STMN1	P16949	149 aa		13.17	□□□□□ -0.3
CS-231	ENST00000552222	AGXT	P21549	392 aa		13.17	□□□□□ -0.3
CS-231	ENST00000552222	CNTF	P26441	200 aa		13.17	□□□□□ -0.3
CS-231	ENST00000552222	CRABP2	P29373	138 aa		13.17	□□□□□ -0.3
CS-231	ENST00000552222	CCNF	P41002	786 aa		13.17	□□□□□ -0.3
CS-231	ENST00000552222	PMP22	Q01453	160 aa		13.17	□□□□□ -0.3
CS-231	ENST00000552222	ZIC1	Q15915	447 aa		13.17	□□□□□ -0.3
CS-231	ENST00000552222	C3AR1	Q16581	482 aa		13.17	□□□□□ -0.3
CS-231	ENST00000552222	PRAMEF13	Q5VWM6	474 aa		13.17	□□□□□ -0.3
CS-231	ENST00000552222	ADGRD1	Q6QNK2	874 aa		13.17	□□□□□ -0.3
CS-231	ENST00000552222	TAOK1	Q7L7X3	1001 aa		13.17	□□□□□ -0.3
CS-231	ENST00000552222	CMC1	Q7Z7K0	106 aa		13.17	□□□□□ -0.3
CS-231	ENST00000552222	FAM20C	Q8IXL6	584 aa		13.17	□□□□□ -0.3
CS-231	ENST00000552222	NKAP	Q8N5F7	415 aa	Known RBP	13.17	□□□□□ -0.3
CS-231	ENST00000552222	BCORP1	Q8N888	145 aa		13.17	□□□□□ -0.3
CS-231	ENST00000552222	OR52E1	Q8NGJ3	308 aa		13.17	□□□□□ -0.3
CS-231	ENST00000552222	OR2Y1	Q8NGV0	311 aa		13.17	□□□□□ -0.3
CS-231	ENST00000552222	ANKRD49	Q8WVL7	239 aa		13.17	□□□□□ -0.3
CS-231	ENST00000552222	TFB2M	Q9H5Q4	396 aa	Known RBP	13.17	□□□□□ -0.3
CS-231	ENST00000552222	XKR8	Q9H6D3	395 aa		13.17	□□□□□ -0.3
CS-231	ENST00000552222	SYTL2	Q9HCH5	934 aa		13.17	□□□□□ -0.3
CS-231	ENST00000552222	GPAM	Q9HCL2	828 aa		13.17	□□□□□ -0.3
CS-231	ENST00000552222	CAMSAP3	Q9P1Y5	1249 aa	Predicted RBP	13.17	□□□□□ -0.3
CS-231	ENST00000552222	IFT80	Q9P2H3	777 aa	Predicted RBP	13.17	□□□□□ -0.3
CS-231	ENST00000552222	TINAG	Q9UJW2	476 aa		13.17	□□□□□ -0.3
CS-231	ENST00000552222	POMT2	Q9UKY4	750 aa		13.17	□□□□□ -0.3
CS-231	ENST00000552222	PADI2	Q9Y2J8	665 aa		13.17	□□□□□ -0.3
CS-231	ENST00000552222	PRRC2A	P48634	2157 aa	Known RBP	13.17	□□□□□ -0.3
CS-231	ENST00000552222	SEC16A	O15027	2179 aa		13.16	□□□□□ -0.3
CS-231	ENST00000552222	CCDC151	A5D8V7	595 aa		13.16	□□□□□ -0.3
CS-231	ENST00000552222	ARHGEF33	A8MVX0	844 aa		13.16	□□□□□ -0.3
CS-231	ENST00000552222		H3BMH7	237 aa		13.16	□□□□□ -0.3
CS-231	ENST00000552222	AGPS	O00116	658 aa		13.16	□□□□□ -0.3
CS-231	ENST00000552222	SOCS6	O14544	535 aa		13.16	□□□□□ -0.3
CS-231	ENST00000552222	PHGDH	O43175	533 aa	Known RBP	13.16	□□□□□ -0.3
CS-231	ENST00000552222	ALDOA	P04075	364 aa	Known RBP	13.16	□□□□□ -0.3
CS-231	ENST00000552222	SNRPA	P09012	282 aa	Known RBP	13.16	□□□□□ -0.3
CS-231	ENST00000552222	SLC35E2B	P0CK96	405 aa		13.16	□□□□□ -0.3
CS-231	ENST00000552222	ITGAX	P20702	1163 aa		13.16	□□□□□ -0.3
CS-231	ENST00000552222	PRDX3	P30048	256 aa	Known RBP	13.16	□□□□□ -0.3
CS-231	ENST00000552222	CA7	P43166	264 aa		13.16	□□□□□ -0.3
CS-231	ENST00000552222	SERPINB8	P50452	374 aa		13.16	□□□□□ -0.3
CS-231	ENST00000552222	ST13	P50502	369 aa	Known RBP	13.16	□□□□□ -0.3
CS-231	ENST00000552222	AIMP2	Q13155	320 aa	Known RBP	13.16	□□□□□ -0.3

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