RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550658.1

SYF2P1-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene SYF2P1, Length 413 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2P1-201ENST00000550658 SSX9Q7RTT3 188 aa3.4□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 RD3Q7Z3Z2 195 aa3.4□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 ADIPOR2Q86V24 386 aa3.4□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa3.4□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 AQP12AQ8IXF9 295 aa3.4□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 DSELQ8IZU8 1212 aa3.4□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 GCNT2Q8N0V5 402 aa3.4□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 FBXO39Q8N4B4 442 aa3.4□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 ZBTB2Q8N680 514 aa3.4□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 FITM2Q8N6M3 262 aa3.4□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 ZNF611Q8N823 705 aa3.4□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 ZNF781Q8N8C0 355 aa3.4□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 AMER3Q8N944 861 aa3.4□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 MINDY2Q8NBR6 621 aa3.4□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa3.4□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 TMIEQ8NEW7 156 aa3.4□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 ZNF596Q8TC21 504 aa3.4□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 TRPC4APQ8TEL6 797 aa3.4□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 GIPC3Q8TF64 312 aa3.4□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 TRIB2Q92519 343 aa3.4□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 LPIN2Q92539 896 aa3.4□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 SNX19Q92543 992 aa3.4□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 RAB1CQ92928 201 aa3.4□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 OPTNQ96CV9 577 aa3.4□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 FAM122AQ96E09 287 aa3.4□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 ZNF479Q96JC4 524 aa3.4□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 ZNF583Q96ND8 569 aa3.4□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 BBS4Q96RK4 519 aa3.4□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 GPHA2Q96T91 129 aa3.4□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 MYOCQ99972 504 aa3.4□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 ATG101Q9BSB4 218 aa3.4□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 UBAC1Q9BSL1 405 aa3.4□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 TMEM43Q9BTV4 400 aa3.4□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 PTDSS2Q9BVG9 487 aa3.4□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 MED20Q9H944 212 aa3.4□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 SLC22A11Q9NSA0 550 aa3.4□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 TXLNGQ9NUQ3 528 aa3.4□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 NDUFA13Q9P0J0 144 aa3.4□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa3.4□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 CHRNA9Q9UGM1 479 aa3.4□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 SLC23A1Q9UHI7 598 aa3.4□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP3.4□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 CFL2Q9Y281 166 aa3.4□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 CA5BQ9Y2D0 317 aa3.4□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 RAD50Q92878 1312 aa3.4□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 ATRNL1Q5VV63 1379 aa3.39□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 NINLQ9Y2I6 1382 aa3.39□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 TRAV25A0A0B4J276 109 aa3.39□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 UBE2QL1A1L167 161 aa3.39□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 OR6C68A6NDL8 312 aa3.39□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 TMEM247A6NEH6 219 aa3.39□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 WASH3PC4AMC7 463 aa3.39□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 H3BQ06 376 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 H3BQV1 296 aa3.39□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 AGPSO00116 658 aa3.39□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 DCLK1O15075 740 aa3.39□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 INPPL1O15357 1258 aa3.39□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 DFNA5O60443 496 aa3.39□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 JRKO75564 520 aa3.39□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 SCGNO76038 276 aa3.39□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 TMCC1O94876 653 aa3.39□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 SUN1O94901 812 aa3.39□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 STBD1O95210 358 aa3.39□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 LCA5LO95447 670 aa3.39□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 MT-ND1P03886 318 aa3.39□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 ICAM1P05362 532 aa3.39□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 CAPN1P07384 714 aa3.39□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 ALOX5P09917 674 aa3.39□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 FCGR2AP12318 317 aa3.39□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 DARSP14868 501 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 UGT1A1P22309 533 aa3.39□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 PRPH2P23942 346 aa3.39□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 TKTP29401 623 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 PRDX6P30041 224 aa3.39□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 RYKP34925 604 aa3.39□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 ADRA1AP35348 466 aa3.39□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 PCYT1AP49585 367 aa3.39□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 RGS4P49798 205 aa3.39□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 PPT1P50897 306 aa3.39□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 CLCN3P51790 818 aa3.39□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 GPR143P51810 404 aa3.39□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 IST1P53990 364 aa3.39□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 CDH6P55285 790 aa3.39□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 RAB14P61106 215 aa3.39□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 RAB11AP62491 216 aa3.39□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 SKP1P63208 163 aa3.39□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 TNNC1P63316 161 aa3.39□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.9 ms