RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550442.5

LETMD1-223, Transcript of LETM1 domain containing 1, human

TSL 4

Gene LETMD1, Length 469 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LETMD1-223	ENST00000550442	IFNA14	P01570	189 aa		11.41	□□□□□ -0.58
LETMD1-223	ENST00000550442	SMIM18	P0DKX4	95 aa		11.41	□□□□□ -0.58
LETMD1-223	ENST00000550442	KEL	P23276	732 aa		11.41	□□□□□ -0.58
LETMD1-223	ENST00000550442	PAX7	P23759	505 aa		11.41	□□□□□ -0.58
LETMD1-223	ENST00000550442	HRH2	P25021	359 aa		11.41	□□□□□ -0.58
LETMD1-223	ENST00000550442	ETV3	P41162	512 aa		11.41	□□□□□ -0.58
LETMD1-223	ENST00000550442	ALDH3B2	P48448	385 aa		11.41	□□□□□ -0.58
LETMD1-223	ENST00000550442	LIMK1	P53667	647 aa		11.41	□□□□□ -0.58
LETMD1-223	ENST00000550442	ARSF	P54793	590 aa		11.41	□□□□□ -0.58
LETMD1-223	ENST00000550442	CSNK2B	P67870	215 aa		11.41	□□□□□ -0.58
LETMD1-223	ENST00000550442	RBBP4	Q09028	425 aa		11.41	□□□□□ -0.58
LETMD1-223	ENST00000550442	SFSWAP	Q12872	951 aa	Known RBP	11.41	□□□□□ -0.58
LETMD1-223	ENST00000550442	DAG1	Q14118	895 aa		11.41	□□□□□ -0.58
LETMD1-223	ENST00000550442	SIM2	Q14190	667 aa	Predicted RBP	11.41	□□□□□ -0.58
LETMD1-223	ENST00000550442	PTGR1	Q14914	329 aa		11.41	□□□□□ -0.58
LETMD1-223	ENST00000550442	LARP7	Q4G0J3	582 aa	Known RBP eCLIP	11.41	□□□□□ -0.58
LETMD1-223	ENST00000550442	SPANXN4	Q5MJ08	99 aa		11.41	□□□□□ -0.58
LETMD1-223	ENST00000550442	CCNYL2	Q5T2Q4	361 aa		11.41	□□□□□ -0.58
LETMD1-223	ENST00000550442	CPZ	Q66K79	652 aa		11.41	□□□□□ -0.58
LETMD1-223	ENST00000550442	TMEM215	Q68D42	235 aa		11.41	□□□□□ -0.58
LETMD1-223	ENST00000550442	USP51	Q70EK9	711 aa		11.41	□□□□□ -0.58
LETMD1-223	ENST00000550442	ERN2	Q76MJ5	926 aa	Known RBP	11.41	□□□□□ -0.58
LETMD1-223	ENST00000550442	GRASP	Q7Z6J2	395 aa	Predicted RBP	11.41	□□□□□ -0.58
LETMD1-223	ENST00000550442	SYT12	Q8IV01	421 aa		11.41	□□□□□ -0.58
LETMD1-223	ENST00000550442	LAS2	Q8IYD9	372 aa		11.41	□□□□□ -0.58
LETMD1-223	ENST00000550442	KRT78	Q8N1N4	520 aa		11.41	□□□□□ -0.58
LETMD1-223	ENST00000550442	ZCCHC7	Q8N3Z6	543 aa	Known RBP	11.41	□□□□□ -0.58
LETMD1-223	ENST00000550442	TTC16	Q8NEE8	873 aa		11.41	□□□□□ -0.58
LETMD1-223	ENST00000550442	ZNF555	Q8NEP9	628 aa		11.41	□□□□□ -0.58
LETMD1-223	ENST00000550442	OR9A1P	Q8NGU1	263 aa		11.41	□□□□□ -0.58
LETMD1-223	ENST00000550442	OR2L2	Q8NH16	312 aa		11.41	□□□□□ -0.58
LETMD1-223	ENST00000550442	OR5K1	Q8NHB7	308 aa		11.41	□□□□□ -0.58
LETMD1-223	ENST00000550442	FAM162A	Q96A26	154 aa		11.41	□□□□□ -0.58
LETMD1-223	ENST00000550442	CLDN23	Q96B33	292 aa		11.41	□□□□□ -0.58
LETMD1-223	ENST00000550442	ZNF707	Q96C28	371 aa	Predicted RBP	11.41	□□□□□ -0.58
LETMD1-223	ENST00000550442	COQ8B	Q96D53	544 aa		11.41	□□□□□ -0.58
LETMD1-223	ENST00000550442	ZNF764	Q96H86	408 aa	Predicted RBP	11.41	□□□□□ -0.58
LETMD1-223	ENST00000550442	PYURF	Q96I23	114 aa		11.41	□□□□□ -0.58
LETMD1-223	ENST00000550442	MAGED4	Q96JG8	741 aa		11.41	□□□□□ -0.58
LETMD1-223	ENST00000550442	QRFPR	Q96P65	431 aa		11.41	□□□□□ -0.58
LETMD1-223	ENST00000550442	SLC29A1	Q99808	456 aa		11.41	□□□□□ -0.58
LETMD1-223	ENST00000550442	CPPED1	Q9BRF8	314 aa	Predicted RBP	11.41	□□□□□ -0.58
LETMD1-223	ENST00000550442	SGPP1	Q9BX95	441 aa		11.41	□□□□□ -0.58
LETMD1-223	ENST00000550442	RMI1	Q9H9A7	625 aa		11.41	□□□□□ -0.58
LETMD1-223	ENST00000550442	HPS4	Q9NQG7	708 aa		11.41	□□□□□ -0.58
LETMD1-223	ENST00000550442	TMEM9	Q9P0T7	183 aa		11.41	□□□□□ -0.58
LETMD1-223	ENST00000550442	STOX2	Q9P2F5	926 aa	Predicted RBP	11.41	□□□□□ -0.58
LETMD1-223	ENST00000550442	ZNF282	Q9UDV7	671 aa	Predicted RBP	11.41	□□□□□ -0.58
LETMD1-223	ENST00000550442	BAG5	Q9UL15	447 aa		11.41	□□□□□ -0.58
LETMD1-223	ENST00000550442	OAZ3	Q9UMX2	235 aa		11.41	□□□□□ -0.58
LETMD1-223	ENST00000550442	MRPS17	Q9Y2R5	130 aa	Known RBP	11.41	□□□□□ -0.58
LETMD1-223	ENST00000550442	ZNF451	Q9Y4E5	1061 aa		11.41	□□□□□ -0.58
LETMD1-223	ENST00000550442	FADS3	Q9Y5Q0	445 aa		11.41	□□□□□ -0.58
LETMD1-223	ENST00000550442	BPTF	Q12830	3046 aa		11.41	□□□□□ -0.58
LETMD1-223	ENST00000550442	PLXNA2	O75051	1894 aa		11.4	□□□□□ -0.58
LETMD1-223	ENST00000550442	ARHGEF33	A8MVX0	844 aa		11.4	□□□□□ -0.58
LETMD1-223	ENST00000550442		A8MX80	341 aa		11.4	□□□□□ -0.58
LETMD1-223	ENST00000550442	RNASET2	O00584	256 aa	Known RBP	11.4	□□□□□ -0.58
LETMD1-223	ENST00000550442	SOCS2	O14508	198 aa		11.4	□□□□□ -0.58
LETMD1-223	ENST00000550442	SCAMP3	O14828	347 aa	Known RBP	11.4	□□□□□ -0.58
LETMD1-223	ENST00000550442	FFAR3	O14843	346 aa		11.4	□□□□□ -0.58
LETMD1-223	ENST00000550442	GPR42	O15529	346 aa		11.4	□□□□□ -0.58
LETMD1-223	ENST00000550442	GPR39	O43194	453 aa		11.4	□□□□□ -0.58
LETMD1-223	ENST00000550442	TBX19	O60806	448 aa		11.4	□□□□□ -0.58
LETMD1-223	ENST00000550442	SEMA3D	O95025	777 aa		11.4	□□□□□ -0.58
LETMD1-223	ENST00000550442	SDC1	P18827	310 aa		11.4	□□□□□ -0.58
LETMD1-223	ENST00000550442	CD72	P21854	359 aa		11.4	□□□□□ -0.58
LETMD1-223	ENST00000550442	MAGEA2	P43356	314 aa		11.4	□□□□□ -0.58
LETMD1-223	ENST00000550442	GPR1	P46091	355 aa		11.4	□□□□□ -0.58
LETMD1-223	ENST00000550442	OR4D2	P58180	307 aa		11.4	□□□□□ -0.58
LETMD1-223	ENST00000550442	ADARB1	P78563	741 aa	Known RBP	11.4	□□□□□ -0.58
LETMD1-223	ENST00000550442	HMGCS1	Q01581	520 aa		11.4	□□□□□ -0.58
LETMD1-223	ENST00000550442	LSAMP	Q13449	338 aa		11.4	□□□□□ -0.58
LETMD1-223	ENST00000550442	CNPY1	Q3B7I2	92 aa		11.4	□□□□□ -0.58
LETMD1-223	ENST00000550442	ZNF658B	Q4V348	819 aa	Predicted RBP	11.4	□□□□□ -0.58
LETMD1-223	ENST00000550442	FBXO48	Q5FWF7	155 aa		11.4	□□□□□ -0.58
LETMD1-223	ENST00000550442	C9orf64	Q5T6V5	341 aa		11.4	□□□□□ -0.58
LETMD1-223	ENST00000550442	CPTP	Q5TA50	214 aa		11.4	□□□□□ -0.58
LETMD1-223	ENST00000550442	TMEM220	Q6QAJ8	160 aa		11.4	□□□□□ -0.58
LETMD1-223	ENST00000550442	PIWIL3	Q7Z3Z3	882 aa	Known RBP	11.4	□□□□□ -0.58
LETMD1-223	ENST00000550442	RASGEF1A	Q8N9B8	481 aa		11.4	□□□□□ -0.58
LETMD1-223	ENST00000550442	SETD9	Q8NE22	299 aa		11.4	□□□□□ -0.58
LETMD1-223	ENST00000550442	ST13P5	Q8NFI4	369 aa	Predicted RBP	11.4	□□□□□ -0.58
LETMD1-223	ENST00000550442	OR10A6	Q8NH74	314 aa		11.4	□□□□□ -0.58
LETMD1-223	ENST00000550442	GOT1L1	Q8NHS2	421 aa	Predicted RBP	11.4	□□□□□ -0.58
LETMD1-223	ENST00000550442	CXorf40A	Q8TE69	158 aa		11.4	□□□□□ -0.58
LETMD1-223	ENST00000550442	CHTF18	Q8WVB6	975 aa		11.4	□□□□□ -0.58
LETMD1-223	ENST00000550442	SCAMP4	Q969E2	229 aa		11.4	□□□□□ -0.58
LETMD1-223	ENST00000550442	NUS1	Q96E22	293 aa		11.4	□□□□□ -0.58
LETMD1-223	ENST00000550442	ASB16	Q96NS5	453 aa		11.4	□□□□□ -0.58
LETMD1-223	ENST00000550442	SH3GL3	Q99963	347 aa		11.4	□□□□□ -0.58
LETMD1-223	ENST00000550442	SMG9	Q9H0W8	520 aa	Known RBP	11.4	□□□□□ -0.58
LETMD1-223	ENST00000550442	TMEM245	Q9H330	911 aa		11.4	□□□□□ -0.58
LETMD1-223	ENST00000550442	ZFP14	Q9HCL3	533 aa		11.4	□□□□□ -0.58
LETMD1-223	ENST00000550442	SERHL	Q9NQF3	203 aa		11.4	□□□□□ -0.58
LETMD1-223	ENST00000550442	AASDHPPT	Q9NRN7	309 aa		11.4	□□□□□ -0.58
LETMD1-223	ENST00000550442	SPATA7	Q9P0W8	599 aa		11.4	□□□□□ -0.58
LETMD1-223	ENST00000550442	ZNHIT2	Q9UHR6	403 aa		11.4	□□□□□ -0.58
LETMD1-223	ENST00000550442	ATP6V1H	Q9UI12	483 aa		11.4	□□□□□ -0.58
LETMD1-223	ENST00000550442	ACSL5	Q9ULC5	683 aa		11.4	□□□□□ -0.58

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