RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540445.5

LMO3-222, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene LMO3, Length 906 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-222ENST00000540445 RNF14Q9UBS8 474 aa8.56□□□□□ -1.04
LMO3-222ENST00000540445 MKL2Q9ULH7 1088 aa8.56□□□□□ -1.04
LMO3-222ENST00000540445 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
LMO3-222ENST00000540445 PYCARDQ9ULZ3 195 aa8.56□□□□□ -1.04
LMO3-222ENST00000540445 SNX24Q9Y343 169 aa8.56□□□□□ -1.04
LMO3-222ENST00000540445 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
LMO3-222ENST00000540445 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa8.55□□□□□ -1.04
LMO3-222ENST00000540445 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa8.55□□□□□ -1.04
LMO3-222ENST00000540445 BLACEA4D250 179 aa8.55□□□□□ -1.04
LMO3-222ENST00000540445 H0YIG0 161 aa8.55□□□□□ -1.04
LMO3-222ENST00000540445 NDC80O14777 642 aa8.55□□□□□ -1.04
LMO3-222ENST00000540445 P2RX6O15547 441 aa8.55□□□□□ -1.04
LMO3-222ENST00000540445 OR1F1O43749 312 aa8.55□□□□□ -1.04
LMO3-222ENST00000540445 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
LMO3-222ENST00000540445 WFS1O76024 890 aa8.55□□□□□ -1.04
LMO3-222ENST00000540445 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
LMO3-222ENST00000540445 SERPIND1P05546 499 aa8.55□□□□□ -1.04
LMO3-222ENST00000540445 CDH1P12830 882 aa8.55□□□□□ -1.04
LMO3-222ENST00000540445 GP1BBP13224 206 aa8.55□□□□□ -1.04
LMO3-222ENST00000540445 NPPBP16860 134 aa8.55□□□□□ -1.04
LMO3-222ENST00000540445 CSNK1G2P78368 415 aa8.55□□□□□ -1.04
LMO3-222ENST00000540445 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
LMO3-222ENST00000540445 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
LMO3-222ENST00000540445 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
LMO3-222ENST00000540445 MGAT5Q09328 741 aa8.55□□□□□ -1.04
LMO3-222ENST00000540445 CALCOCO2Q13137 446 aa8.55□□□□□ -1.04
LMO3-222ENST00000540445 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
LMO3-222ENST00000540445 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
LMO3-222ENST00000540445 CSHL1Q14406 222 aa8.55□□□□□ -1.04
LMO3-222ENST00000540445 MINDY4Q4G0A6 757 aa8.55□□□□□ -1.04
LMO3-222ENST00000540445 CRB2Q5IJ48 1285 aa8.55□□□□□ -1.04
LMO3-222ENST00000540445 DUPD1Q68J44 220 aa8.55□□□□□ -1.04
LMO3-222ENST00000540445 LCTLQ6UWM7 567 aa8.55□□□□□ -1.04
LMO3-222ENST00000540445 ISLR2Q6UXK2 745 aa8.55□□□□□ -1.04
LMO3-222ENST00000540445 Q6ZS92 163 aa8.55□□□□□ -1.04
LMO3-222ENST00000540445 CAPN12Q6ZSI9 719 aa8.55□□□□□ -1.04
LMO3-222ENST00000540445 ZBED8Q8IZ13 594 aa8.55□□□□□ -1.04
LMO3-222ENST00000540445 TBC1D19Q8N5T2 526 aa8.55□□□□□ -1.04
LMO3-222ENST00000540445 AMER3Q8N944 861 aa8.55□□□□□ -1.04
LMO3-222ENST00000540445 FBXO36Q8NEA4 188 aa8.55□□□□□ -1.04
LMO3-222ENST00000540445 PYROXD1Q8WU10 500 aa8.55□□□□□ -1.04
LMO3-222ENST00000540445 SLC13A3Q8WWT9 602 aa8.55□□□□□ -1.04
LMO3-222ENST00000540445 ATL1Q8WXF7 558 aa8.55□□□□□ -1.04
LMO3-222ENST00000540445 THAP11Q96EK4 314 aa8.55□□□□□ -1.04
LMO3-222ENST00000540445 LMF1Q96S06 567 aa8.55□□□□□ -1.04
LMO3-222ENST00000540445 OLFM1Q99784 485 aa8.55□□□□□ -1.04
LMO3-222ENST00000540445 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
LMO3-222ENST00000540445 MESP1Q9BRJ9 268 aa8.55□□□□□ -1.04
LMO3-222ENST00000540445 HAUS8Q9BT25 410 aa8.55□□□□□ -1.04
LMO3-222ENST00000540445 TGIF2Q9GZN2 237 aa8.55□□□□□ -1.04
LMO3-222ENST00000540445 ANKHQ9HCJ1 492 aa8.55□□□□□ -1.04
LMO3-222ENST00000540445 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa8.55□□□□□ -1.04
LMO3-222ENST00000540445 C14orf105Q9NVL8 296 aa8.55□□□□□ -1.04
LMO3-222ENST00000540445 ASF1BQ9NVP2 202 aa8.55□□□□□ -1.04
LMO3-222ENST00000540445 SH2B3Q9UQQ2 575 aa8.55□□□□□ -1.04
LMO3-222ENST00000540445 SVILO95425 2214 aa8.55□□□□□ -1.04
LMO3-222ENST00000540445 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa8.55□□□□□ -1.04
LMO3-222ENST00000540445 POLEQ07864 2286 aa8.54□□□□□ -1.04
LMO3-222ENST00000540445 CACNA1DQ01668 2161 aa8.54□□□□□ -1.04
LMO3-222ENST00000540445 DYTNA2CJ06 578 aa8.54□□□□□ -1.04
LMO3-222ENST00000540445 SGK494L7N484 410 aa8.54□□□□□ -1.04
LMO3-222ENST00000540445 KLHL18O94889 574 aa8.54□□□□□ -1.04
LMO3-222ENST00000540445 BMP10O95393 424 aa8.54□□□□□ -1.04
LMO3-222ENST00000540445 SLC35G6P0C7Q6 338 aa8.54□□□□□ -1.04
LMO3-222ENST00000540445 ICAM2P13598 275 aa8.54□□□□□ -1.04
LMO3-222ENST00000540445 IL1RNP18510 177 aa8.54□□□□□ -1.04
LMO3-222ENST00000540445 FDXRP22570 491 aa8.54□□□□□ -1.04
LMO3-222ENST00000540445 CASQ1P31415 396 aa8.54□□□□□ -1.04
LMO3-222ENST00000540445 RPL21P46778 160 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
LMO3-222ENST00000540445 CCR8P51685 355 aa8.54□□□□□ -1.04
LMO3-222ENST00000540445 SLC12A2P55011 1212 aa8.54□□□□□ -1.04
LMO3-222ENST00000540445 AP1S2P56377 157 aa8.54□□□□□ -1.04
LMO3-222ENST00000540445 ARG2P78540 354 aa8.54□□□□□ -1.04
LMO3-222ENST00000540445 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
LMO3-222ENST00000540445 Q0VFX4 171 aa8.54□□□□□ -1.04
LMO3-222ENST00000540445 CDC16Q13042 620 aa8.54□□□□□ -1.04
LMO3-222ENST00000540445 NR6A1Q15406 480 aa8.54□□□□□ -1.04
LMO3-222ENST00000540445 STEAP4Q687X5 459 aa8.54□□□□□ -1.04
LMO3-222ENST00000540445 MAATS1Q7Z4T9 603 aa8.54□□□□□ -1.04
LMO3-222ENST00000540445 ASPGQ86U10 573 aa8.54□□□□□ -1.04
LMO3-222ENST00000540445 CUZD1Q86UP6 607 aa8.54□□□□□ -1.04
LMO3-222ENST00000540445 SLC26A11Q86WA9 606 aa8.54□□□□□ -1.04
LMO3-222ENST00000540445 KCT2Q8NC54 265 aa8.54□□□□□ -1.04
LMO3-222ENST00000540445 CATSPER1Q8NEC5 780 aa8.54□□□□□ -1.04
LMO3-222ENST00000540445 OR51Q1Q8NH59 317 aa8.54□□□□□ -1.04
LMO3-222ENST00000540445 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa8.54□□□□□ -1.04
LMO3-222ENST00000540445 PPP4R1Q8TF05 950 aa8.54□□□□□ -1.04
LMO3-222ENST00000540445 VPS39Q96JC1 886 aa8.54□□□□□ -1.04
LMO3-222ENST00000540445 PDLIM2Q96JY6 352 aa8.54□□□□□ -1.04
LMO3-222ENST00000540445 EGFL8Q99944 293 aa8.54□□□□□ -1.04
LMO3-222ENST00000540445 SGPP1Q9BX95 441 aa8.54□□□□□ -1.04
LMO3-222ENST00000540445 FAM129AQ9BZQ8 928 aa8.54□□□□□ -1.04
LMO3-222ENST00000540445 DPH5Q9H2P9 285 aa8.54□□□□□ -1.04
LMO3-222ENST00000540445 PLAC1Q9HBJ0 212 aa8.54□□□□□ -1.04
LMO3-222ENST00000540445 PTGFRNQ9P2B2 879 aa8.54□□□□□ -1.04
LMO3-222ENST00000540445 TXNDC16Q9P2K2 825 aa8.54□□□□□ -1.04
LMO3-222ENST00000540445 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
LMO3-222ENST00000540445 CSAG2Q9Y5P2 127 aa8.54□□□□□ -1.04
LMO3-222ENST00000540445 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa8.53□□□□□ -1.04
LMO3-222ENST00000540445 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa8.53□□□□□ -1.04
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