RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538333.3

LIMK1-208, Transcript of LIM domain kinase 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene LIMK1, Length 2,170 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMK1-208ENST00000538333 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP13.5□□□□□ -0.25
LIMK1-208ENST00000538333 LPCAT2Q7L5N7 544 aa13.5□□□□□ -0.25
LIMK1-208ENST00000538333 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
LIMK1-208ENST00000538333 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
LIMK1-208ENST00000538333 CPA6Q8N4T0 437 aa13.5□□□□□ -0.25
LIMK1-208ENST00000538333 GPR156Q8NFN8 814 aa13.5□□□□□ -0.25
LIMK1-208ENST00000538333 REPS1Q96D71 796 aa13.5□□□□□ -0.25
LIMK1-208ENST00000538333 EFCAB11Q9BUY7 163 aa13.5□□□□□ -0.25
LIMK1-208ENST00000538333 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa13.5□□□□□ -0.25
LIMK1-208ENST00000538333 CHST8Q9H2A9 424 aa13.5□□□□□ -0.25
LIMK1-208ENST00000538333 OR52A5Q9H2C5 316 aa13.5□□□□□ -0.25
LIMK1-208ENST00000538333 EHD1Q9H4M9 534 aa13.5□□□□□ -0.25
LIMK1-208ENST00000538333 TPT1P8Q9HAU6 139 aa13.5□□□□□ -0.25
LIMK1-208ENST00000538333 VNN3Q9NY84 501 aa13.5□□□□□ -0.25
LIMK1-208ENST00000538333 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP13.5□□□□□ -0.25
LIMK1-208ENST00000538333 VEGFDO43915 354 aa13.49□□□□□ -0.25
LIMK1-208ENST00000538333 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa13.49□□□□□ -0.25
LIMK1-208ENST00000538333 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
LIMK1-208ENST00000538333 OPRD1P41143 372 aa13.49□□□□□ -0.25
LIMK1-208ENST00000538333 P2RY2P41231 377 aa13.49□□□□□ -0.25
LIMK1-208ENST00000538333 YAP1P46937 504 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
LIMK1-208ENST00000538333 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP13.49□□□□□ -0.25
LIMK1-208ENST00000538333 STARD3Q14849 445 aa13.49□□□□□ -0.25
LIMK1-208ENST00000538333 C16orf72Q14CZ0 275 aa13.49□□□□□ -0.25
LIMK1-208ENST00000538333 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
LIMK1-208ENST00000538333 TTC23Q5W5X9 447 aa13.49□□□□□ -0.25
LIMK1-208ENST00000538333 CRTC3Q6UUV7 619 aa13.49□□□□□ -0.25
LIMK1-208ENST00000538333 ARMCX6Q7L4S7 300 aa13.49□□□□□ -0.25
LIMK1-208ENST00000538333 GPR141Q7Z602 305 aa13.49□□□□□ -0.25
LIMK1-208ENST00000538333 THAP5Q7Z6K1 395 aa13.49□□□□□ -0.25
LIMK1-208ENST00000538333 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa13.49□□□□□ -0.25
LIMK1-208ENST00000538333 PLA2G15Q8NCC3 412 aa13.49□□□□□ -0.25
LIMK1-208ENST00000538333 COX14Q96I36 57 aa13.49□□□□□ -0.25
LIMK1-208ENST00000538333 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
LIMK1-208ENST00000538333 SPNS1Q9H2V7 528 aa13.49□□□□□ -0.25
LIMK1-208ENST00000538333 LTB4R2Q9NPC1 389 aa13.49□□□□□ -0.25
LIMK1-208ENST00000538333 IL1RAPQ9NPH3 570 aa13.49□□□□□ -0.25
LIMK1-208ENST00000538333 DMRT3Q9NQL9 472 aa13.49□□□□□ -0.25
LIMK1-208ENST00000538333 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
LIMK1-208ENST00000538333 PIPSLA2A3N6 862 aa13.49□□□□□ -0.25
LIMK1-208ENST00000538333 MGAT4DA6NG13 374 aa13.49□□□□□ -0.25
LIMK1-208ENST00000538333 PCDH7O60245 1069 aa13.49□□□□□ -0.25
LIMK1-208ENST00000538333 TRMUO75648 421 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
LIMK1-208ENST00000538333 EN2P19622 333 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
LIMK1-208ENST00000538333 PRKACGP22612 351 aa13.49□□□□□ -0.25
LIMK1-208ENST00000538333 KDELR2P33947 212 aa13.49□□□□□ -0.25
LIMK1-208ENST00000538333 CTBSQ01459 385 aa13.49□□□□□ -0.25
LIMK1-208ENST00000538333 KCNAB2Q13303 367 aa13.49□□□□□ -0.25
LIMK1-208ENST00000538333 SPIDRQ14159 915 aa13.49□□□□□ -0.25
LIMK1-208ENST00000538333 C7orf61Q8IZ16 206 aa13.49□□□□□ -0.25
LIMK1-208ENST00000538333 SYNPOQ8N3V7 929 aa13.49□□□□□ -0.25
LIMK1-208ENST00000538333 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
LIMK1-208ENST00000538333 HDAC8Q9BY41 377 aa13.49□□□□□ -0.25
LIMK1-208ENST00000538333 TRPV4Q9HBA0 871 aa13.49□□□□□ -0.25
LIMK1-208ENST00000538333 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa13.49□□□□□ -0.25
LIMK1-208ENST00000538333 PRSS16Q9NQE7 514 aa13.49□□□□□ -0.25
LIMK1-208ENST00000538333 DYRK4Q9NR20 520 aa13.49□□□□□ -0.25
LIMK1-208ENST00000538333 OBP2AQ9NY56 170 aa13.49□□□□□ -0.25
LIMK1-208ENST00000538333 ABCG2Q9UNQ0 655 aa13.49□□□□□ -0.25
LIMK1-208ENST00000538333 DYRK1BQ9Y463 629 aa13.49□□□□□ -0.25
LIMK1-208ENST00000538333 TRPM6Q9BX84 2022 aa13.49□□□□□ -0.25
LIMK1-208ENST00000538333 B4GAT1O43505 415 aa13.48□□□□□ -0.25
LIMK1-208ENST00000538333 ZNF682O95780 498 aa13.48□□□□□ -0.25
LIMK1-208ENST00000538333 FSHRP23945 695 aa13.48□□□□□ -0.25
LIMK1-208ENST00000538333 HPCAL1P37235 193 aa13.48□□□□□ -0.25
LIMK1-208ENST00000538333 ESRRGP62508 458 aa13.48□□□□□ -0.25
LIMK1-208ENST00000538333 GAB1Q13480 694 aa13.48□□□□□ -0.25
LIMK1-208ENST00000538333 VEZF1Q14119 521 aa13.48□□□□□ -0.25
LIMK1-208ENST00000538333 PDGFRLQ15198 375 aa13.48□□□□□ -0.25
LIMK1-208ENST00000538333 DUSP6Q16828 381 aa13.48□□□□□ -0.25
LIMK1-208ENST00000538333 ZNF385BQ569K4 471 aa13.48□□□□□ -0.25
LIMK1-208ENST00000538333 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa13.48□□□□□ -0.25
LIMK1-208ENST00000538333 ANXA8L1Q5VT79 327 aa13.48□□□□□ -0.25
LIMK1-208ENST00000538333 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
LIMK1-208ENST00000538333 NXPE4Q6UWF7 544 aa13.48□□□□□ -0.25
LIMK1-208ENST00000538333 UNC5DQ6UXZ4 953 aa13.48□□□□□ -0.25
LIMK1-208ENST00000538333 CBLL1Q75N03 491 aa13.48□□□□□ -0.25
LIMK1-208ENST00000538333 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP13.48□□□□□ -0.25
LIMK1-208ENST00000538333 COMMD6Q7Z4G1 85 aa13.48□□□□□ -0.25
LIMK1-208ENST00000538333 GALNT10Q86SR1 603 aa13.48□□□□□ -0.25
LIMK1-208ENST00000538333 HIPK1Q86Z02 1210 aa13.48□□□□□ -0.25
LIMK1-208ENST00000538333 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP13.48□□□□□ -0.25
LIMK1-208ENST00000538333 ZFP90Q8TF47 636 aa13.48□□□□□ -0.25
LIMK1-208ENST00000538333 SLC5A11Q8WWX8 675 aa13.48□□□□□ -0.25
LIMK1-208ENST00000538333 CXorf40BQ96DE9 158 aa13.48□□□□□ -0.25
LIMK1-208ENST00000538333 SH3GL3Q99963 347 aa13.48□□□□□ -0.25
LIMK1-208ENST00000538333 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
LIMK1-208ENST00000538333 SFXN1Q9H9B4 322 aa13.48□□□□□ -0.25
LIMK1-208ENST00000538333 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
LIMK1-208ENST00000538333 ATP6V1HQ9UI12 483 aa13.48□□□□□ -0.25
LIMK1-208ENST00000538333 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa13.48□□□□□ -0.25
LIMK1-208ENST00000538333 U3KQV3 271 aa13.48□□□□□ -0.25
LIMK1-208ENST00000538333 TRANK1O15050 2925 aa13.48□□□□□ -0.25
LIMK1-208ENST00000538333 DOCK8Q8NF50 2099 aa13.48□□□□□ -0.25
LIMK1-208ENST00000538333 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa13.48□□□□□ -0.25
LIMK1-208ENST00000538333 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP13.48□□□□□ -0.25
LIMK1-208ENST00000538333 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
LIMK1-208ENST00000538333 E2F6O75461 281 aa13.48□□□□□ -0.25
LIMK1-208ENST00000538333 KLHL18O94889 574 aa13.48□□□□□ -0.25
LIMK1-208ENST00000538333 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.9 ms