RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529667.1

SOX9-AS1-208, SOX9 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene SOX9-AS1, Length 340 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX9-AS1-208ENST00000529667 VILLO15195 856 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 GPR42O15529 346 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 DFNA5O60443 496 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 SCN2BO60939 215 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 CLEC3AO75596 197 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 SLITRK5O94991 958 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 KCNK5O95279 499 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 SLC16A8O95907 504 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 AGR2O95994 175 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 NTRK1P04629 796 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 NPPBP16860 134 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 CKMT2P17540 419 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 ENGP17813 658 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 UQCRC2P22695 453 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 FSHRP23945 695 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 IMPA1P29218 277 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 CCR2P41597 374 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 GDF5P43026 501 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 SERPINB10P48595 397 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 CCR8P51685 355 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 DGKQP52824 942 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 HMGA2P52926 109 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 ITGA1P56199 1179 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 SELENOWP63302 87 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 TUBA1BP68363 451 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 OLR1P78380 273 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 HMGCS1Q01581 520 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 KCNC4Q03721 635 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 CNTN1Q12860 1018 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 RGNQ15493 299 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 DUSP6Q16828 381 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 HKDC1Q2TB90 917 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 PGS1Q32NB8 556 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 FBXO43Q4G163 708 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 CRB2Q5IJ48 1285 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 C6orf141Q5SZD1 244 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 AP1ARQ63HQ0 302 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 METRNLQ641Q3 311 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 NIPAL1Q6NVV3 410 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 SUSD1Q6UWL2 747 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 WASH2PQ6VEQ5 465 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 ZNF621Q6ZSS3 439 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 TUBA1AQ71U36 451 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 MTSS1LQ765P7 747 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 SATL1Q86VE3 508 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 HORMAD1Q86X24 394 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 YAF2Q8IY57 180 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 SYTL1Q8IYJ3 562 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 ZNF786Q8N393 782 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 CHST14Q8NCH0 376 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 DENND6BQ8NEG7 585 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 OR4K1Q8NGD4 311 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 OR5K2Q8NHB8 316 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 PSMA8Q8TAA3 256 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 FBLIM1Q8WUP2 373 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 ESAMQ96AP7 390 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 ELSPBP1Q96BH3 223 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 PPCDCQ96CD2 204 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 THAP11Q96EK4 314 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 APOLD1Q96LR9 279 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 ZNF607Q96SK3 696 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 PKP4Q99569 1192 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 SEPHS2Q99611 448 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 TEX101Q9BY14 249 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 LINC00597Q9H2U6 94 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 CXorf21Q9HAI6 301 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 SIAEQ9HAT2 523 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 NTN4Q9HB63 628 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 PLGRKTQ9HBL7 147 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 WASH6PQ9NQA3 447 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 TRPV5Q9NQA5 729 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 NECTIN3Q9NQS3 549 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 THSD1Q9NS62 852 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 TAS2R9Q9NYW1 312 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 ANKMY1Q9P2S6 941 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 CCL26Q9Y258 94 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 ANGPT4Q9Y264 503 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 ASB1Q9Y576 335 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 CEPT1Q9Y6K0 416 aa6.52□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.6 ms