RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526317.5

CSRP1-208, Transcript of cysteine and glycine rich protein 1, human

TSL 3

Gene CSRP1, Length 374 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CSRP1-208	ENST00000526317	PSMC3IP	Q9P2W1	217 aa	Predicted RBP	9.99	□□□□□ -0.81
CSRP1-208	ENST00000526317	RAB21	Q9UL25	225 aa		9.99	□□□□□ -0.81
CSRP1-208	ENST00000526317	ASB1	Q9Y576	335 aa		9.99	□□□□□ -0.81
CSRP1-208	ENST00000526317	AHCTF1	Q8WYP5	2266 aa		9.99	□□□□□ -0.81
CSRP1-208	ENST00000526317	ZFHX4	Q86UP3	3567 aa		9.99	□□□□□ -0.81
CSRP1-208	ENST00000526317	ANKRD11	Q6UB99	2663 aa	Predicted RBP	9.98	□□□□□ -0.81
CSRP1-208	ENST00000526317	FOXO6	A8MYZ6	492 aa		9.98	□□□□□ -0.81
CSRP1-208	ENST00000526317	CLGN	O14967	610 aa		9.98	□□□□□ -0.81
CSRP1-208	ENST00000526317	FOXS1	O43638	330 aa		9.98	□□□□□ -0.81
CSRP1-208	ENST00000526317	KLF7	O75840	302 aa	Predicted RBP	9.98	□□□□□ -0.81
CSRP1-208	ENST00000526317	IPO13	O94829	963 aa	Known RBP	9.98	□□□□□ -0.81
CSRP1-208	ENST00000526317	FURIN	P09958	794 aa		9.98	□□□□□ -0.81
CSRP1-208	ENST00000526317	PYGB	P11216	843 aa		9.98	□□□□□ -0.81
CSRP1-208	ENST00000526317	PIM1	P11309	404 aa	Predicted RBP	9.98	□□□□□ -0.81
CSRP1-208	ENST00000526317	EPOR	P19235	508 aa		9.98	□□□□□ -0.81
CSRP1-208	ENST00000526317	VARS	P26640	1264 aa	Known RBP	9.98	□□□□□ -0.81
CSRP1-208	ENST00000526317	SLCO1A2	P46721	670 aa		9.98	□□□□□ -0.81
CSRP1-208	ENST00000526317	SCTR	P47872	440 aa		9.98	□□□□□ -0.81
CSRP1-208	ENST00000526317	ALDH18A1	P54886	795 aa	Known RBP	9.98	□□□□□ -0.81
CSRP1-208	ENST00000526317	SNRPN	P63162	240 aa	Known RBP	9.98	□□□□□ -0.81
CSRP1-208	ENST00000526317	MC1R	Q01726	317 aa		9.98	□□□□□ -0.81
CSRP1-208	ENST00000526317	NCF4	Q15080	339 aa		9.98	□□□□□ -0.81
CSRP1-208	ENST00000526317	RASA2	Q15283	850 aa		9.98	□□□□□ -0.81
CSRP1-208	ENST00000526317	RBBP5	Q15291	538 aa	Known RBP	9.98	□□□□□ -0.81
CSRP1-208	ENST00000526317	PFKFB4	Q16877	469 aa		9.98	□□□□□ -0.81
CSRP1-208	ENST00000526317	TSNAXIP1	Q2TAA8	658 aa		9.98	□□□□□ -0.81
CSRP1-208	ENST00000526317	GARNL3	Q5VVW2	1013 aa		9.98	□□□□□ -0.81
CSRP1-208	ENST00000526317	ATG9B	Q674R7	924 aa		9.98	□□□□□ -0.81
CSRP1-208	ENST00000526317	MRPL14	Q6P1L8	145 aa	Known RBP	9.98	□□□□□ -0.81
CSRP1-208	ENST00000526317	EMB	Q6PCB8	327 aa		9.98	□□□□□ -0.81
CSRP1-208	ENST00000526317	FAM198B	Q6UWH4	519 aa		9.98	□□□□□ -0.81
CSRP1-208	ENST00000526317	SH2D5	Q6ZV89	423 aa		9.98	□□□□□ -0.81
CSRP1-208	ENST00000526317	TMPRSS11B	Q86T26	416 aa		9.98	□□□□□ -0.81
CSRP1-208	ENST00000526317	ASPG	Q86U10	573 aa		9.98	□□□□□ -0.81
CSRP1-208	ENST00000526317	TMEM151B	Q8IW70	566 aa		9.98	□□□□□ -0.81
CSRP1-208	ENST00000526317	ENDOV	Q8N8Q3	282 aa	Known RBP	9.98	□□□□□ -0.81
CSRP1-208	ENST00000526317	SNX31	Q8N9S9	440 aa		9.98	□□□□□ -0.81
CSRP1-208	ENST00000526317	ANKRD53	Q8N9V6	530 aa		9.98	□□□□□ -0.81
CSRP1-208	ENST00000526317	KCT2	Q8NC54	265 aa		9.98	□□□□□ -0.81
CSRP1-208	ENST00000526317	CAMKV	Q8NCB2	501 aa		9.98	□□□□□ -0.81
CSRP1-208	ENST00000526317	OR2W6P	Q8NHA6	318 aa		9.98	□□□□□ -0.81
CSRP1-208	ENST00000526317	STARD8	Q92502	1023 aa		9.98	□□□□□ -0.81
CSRP1-208	ENST00000526317	CAVIN3	Q969G5	261 aa		9.98	□□□□□ -0.81
CSRP1-208	ENST00000526317	MOCOS	Q96EN8	888 aa		9.98	□□□□□ -0.81
CSRP1-208	ENST00000526317	SCYL1	Q96KG9	808 aa		9.98	□□□□□ -0.81
CSRP1-208	ENST00000526317	C10orf90	Q96M02	699 aa		9.98	□□□□□ -0.81
CSRP1-208	ENST00000526317	C17orf62	Q9BQA9	187 aa		9.98	□□□□□ -0.81
CSRP1-208	ENST00000526317	AIF1L	Q9BQI0	150 aa		9.98	□□□□□ -0.81
CSRP1-208	ENST00000526317	ACTL8	Q9H568	366 aa		9.98	□□□□□ -0.81
CSRP1-208	ENST00000526317	ZNF304	Q9HCX3	659 aa		9.98	□□□□□ -0.81
CSRP1-208	ENST00000526317	TMEM216	Q9P0N5	145 aa		9.98	□□□□□ -0.81
CSRP1-208	ENST00000526317	GPN3	Q9UHW5	284 aa	Predicted RBP	9.98	□□□□□ -0.81
CSRP1-208	ENST00000526317	TCFL5	Q9UL49	500 aa		9.98	□□□□□ -0.81
CSRP1-208	ENST00000526317	CDC14A	Q9UNH5	594 aa		9.98	□□□□□ -0.81
CSRP1-208	ENST00000526317	MRPS2	Q9Y399	296 aa	Known RBP	9.98	□□□□□ -0.81
CSRP1-208	ENST00000526317	MAU2	Q9Y6X3	613 aa		9.98	□□□□□ -0.81
CSRP1-208	ENST00000526317	CCDC88C	Q9P219	2028 aa		9.97	□□□□□ -0.81
CSRP1-208	ENST00000526317	TLDC2	A0PJX2	215 aa		9.97	□□□□□ -0.81
CSRP1-208	ENST00000526317	LRRC14B	A6NHZ5	514 aa		9.97	□□□□□ -0.81
CSRP1-208	ENST00000526317		C9J4A7	227 aa		9.97	□□□□□ -0.81
CSRP1-208	ENST00000526317	GOLGA8R	I6L899	631 aa		9.97	□□□□□ -0.81
CSRP1-208	ENST00000526317		K7EPI3	171 aa		9.97	□□□□□ -0.81
CSRP1-208	ENST00000526317	CNOT3	O75175	753 aa	Known RBP	9.97	□□□□□ -0.81
CSRP1-208	ENST00000526317	ALB	P02768	609 aa		9.97	□□□□□ -0.81
CSRP1-208	ENST00000526317	TUBB	P07437	444 aa		9.97	□□□□□ -0.81
CSRP1-208	ENST00000526317	CD63	P08962	238 aa		9.97	□□□□□ -0.81
CSRP1-208	ENST00000526317	SBK3	P0C264	359 aa		9.97	□□□□□ -0.81
CSRP1-208	ENST00000526317	PRKAR1A	P10644	381 aa		9.97	□□□□□ -0.81
CSRP1-208	ENST00000526317	GFAP	P14136	432 aa		9.97	□□□□□ -0.81
CSRP1-208	ENST00000526317	CXCR2	P25025	360 aa		9.97	□□□□□ -0.81
CSRP1-208	ENST00000526317	AHR	P35869	848 aa		9.97	□□□□□ -0.81
CSRP1-208	ENST00000526317	CASP2	P42575	452 aa		9.97	□□□□□ -0.81
CSRP1-208	ENST00000526317	REEP5	Q00765	189 aa		9.97	□□□□□ -0.81
CSRP1-208	ENST00000526317	PCDH1	Q08174	1060 aa		9.97	□□□□□ -0.81
CSRP1-208	ENST00000526317	FAM53B	Q14153	422 aa		9.97	□□□□□ -0.81
CSRP1-208	ENST00000526317	DOC2A	Q14183	400 aa		9.97	□□□□□ -0.81
CSRP1-208	ENST00000526317	SLC9A5	Q14940	896 aa		9.97	□□□□□ -0.81
CSRP1-208	ENST00000526317	SETDB1	Q15047	1291 aa		9.97	□□□□□ -0.81
CSRP1-208	ENST00000526317	PCBP2	Q15366	365 aa	Known RBP eCLIP	9.97	□□□□□ -0.81
CSRP1-208	ENST00000526317	PDK4	Q16654	411 aa		9.97	□□□□□ -0.81
CSRP1-208	ENST00000526317	NDUFA9	Q16795	377 aa		9.97	□□□□□ -0.81
CSRP1-208	ENST00000526317	ATP1A1-AS1	Q5TC04	95 aa		9.97	□□□□□ -0.81
CSRP1-208	ENST00000526317	FAM69B	Q5VUD6	431 aa		9.97	□□□□□ -0.81
CSRP1-208	ENST00000526317	PRMT9	Q6P2P2	845 aa		9.97	□□□□□ -0.81
CSRP1-208	ENST00000526317	COX15	Q7KZN9	410 aa		9.97	□□□□□ -0.81
CSRP1-208	ENST00000526317	LRRC70	Q7Z2Q7	622 aa		9.97	□□□□□ -0.81
CSRP1-208	ENST00000526317	SYVN1	Q86TM6	617 aa		9.97	□□□□□ -0.81
CSRP1-208	ENST00000526317	CNPY4	Q8N129	248 aa		9.97	□□□□□ -0.81
CSRP1-208	ENST00000526317	TBC1D19	Q8N5T2	526 aa		9.97	□□□□□ -0.81
CSRP1-208	ENST00000526317	METTL27	Q8N6F8	245 aa	Predicted RBP	9.97	□□□□□ -0.81
CSRP1-208	ENST00000526317	ACMSD	Q8TDX5	336 aa		9.97	□□□□□ -0.81
CSRP1-208	ENST00000526317	EPS8L3	Q8TE67	593 aa	Known RBP	9.97	□□□□□ -0.81
CSRP1-208	ENST00000526317	UBTD2	Q8WUN7	234 aa		9.97	□□□□□ -0.81
CSRP1-208	ENST00000526317	TTC9	Q92623	222 aa		9.97	□□□□□ -0.81
CSRP1-208	ENST00000526317	COL26A1	Q96A83	441 aa		9.97	□□□□□ -0.81
CSRP1-208	ENST00000526317	WDR34	Q96EX3	536 aa		9.97	□□□□□ -0.81
CSRP1-208	ENST00000526317	MRPL57	Q9BQC6	102 aa	Known RBP	9.97	□□□□□ -0.81
CSRP1-208	ENST00000526317	EHD1	Q9H4M9	534 aa		9.97	□□□□□ -0.81
CSRP1-208	ENST00000526317	NT5DC2	Q9H857	520 aa		9.97	□□□□□ -0.81
CSRP1-208	ENST00000526317	PPCS	Q9HAB8	311 aa		9.97	□□□□□ -0.81

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