RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520898.5

UBR5-208, Transcript of ubiquitin protein ligase E3 component n-recognin 5, human

TSL 3

Gene UBR5, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBR5-208	ENST00000520898	MLPH	Q9BV36	600 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
UBR5-208	ENST00000520898	NUP85	Q9BW27	656 aa		4.98	□□□□□ -1.61
UBR5-208	ENST00000520898	SPATA16	Q9BXB7	569 aa		4.98	□□□□□ -1.61
UBR5-208	ENST00000520898	TRIM7	Q9C029	511 aa		4.98	□□□□□ -1.61
UBR5-208	ENST00000520898	ILKAP	Q9H0C8	392 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
UBR5-208	ENST00000520898	SMURF2	Q9HAU4	748 aa		4.98	□□□□□ -1.61
UBR5-208	ENST00000520898	PCDH9	Q9HC56	1237 aa		4.98	□□□□□ -1.61
UBR5-208	ENST00000520898	ZBTB20	Q9HC78	741 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
UBR5-208	ENST00000520898	SERHL	Q9NQF3	203 aa		4.98	□□□□□ -1.61
UBR5-208	ENST00000520898	AGPAT4	Q9NRZ5	378 aa		4.98	□□□□□ -1.61
UBR5-208	ENST00000520898	RLIM	Q9NVW2	624 aa		4.98	□□□□□ -1.61
UBR5-208	ENST00000520898	TAS2R14	Q9NYV8	317 aa		4.98	□□□□□ -1.61
UBR5-208	ENST00000520898	PKD2L2	Q9NZM6	624 aa		4.98	□□□□□ -1.61
UBR5-208	ENST00000520898	JKAMP	Q9P055	326 aa		4.98	□□□□□ -1.61
UBR5-208	ENST00000520898	AMACR	Q9UHK6	382 aa		4.98	□□□□□ -1.61
UBR5-208	ENST00000520898	OSGIN2	Q9Y236	505 aa		4.98	□□□□□ -1.61
UBR5-208	ENST00000520898	CACNA1C	Q13936	2221 aa		4.98	□□□□□ -1.61
UBR5-208	ENST00000520898	NSD1	Q96L73	2696 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
UBR5-208	ENST00000520898	NCOA6	Q14686	2063 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
UBR5-208	ENST00000520898		A0A1B0GUH1	482 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBR5-208	ENST00000520898	MROH6	A6NGR9	719 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBR5-208	ENST00000520898	PES1	O00541	588 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
UBR5-208	ENST00000520898	MATN3	O15232	486 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBR5-208	ENST00000520898	KLHL41	O60662	606 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBR5-208	ENST00000520898	KCNJ13	O60928	360 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBR5-208	ENST00000520898	RNF8	O76064	485 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBR5-208	ENST00000520898	IPO13	O94829	963 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
UBR5-208	ENST00000520898	LCA5L	O95447	670 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBR5-208	ENST00000520898	TCF4	P15884	667 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBR5-208	ENST00000520898	CA4	P22748	312 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBR5-208	ENST00000520898	SERPINB6	P35237	376 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBR5-208	ENST00000520898	PTGER4	P35408	488 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBR5-208	ENST00000520898	PCK1	P35558	622 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBR5-208	ENST00000520898	TSFM	P43897	325 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
UBR5-208	ENST00000520898	HSPA7	P48741	367 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBR5-208	ENST00000520898	KPNA2	P52292	529 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
UBR5-208	ENST00000520898	GALNT2	Q10471	571 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBR5-208	ENST00000520898	CTBP1	Q13363	440 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBR5-208	ENST00000520898	ART3	Q13508	389 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBR5-208	ENST00000520898	RAB32	Q13637	225 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBR5-208	ENST00000520898	SYCP1	Q15431	976 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBR5-208	ENST00000520898	RPE65	Q16518	533 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBR5-208	ENST00000520898	MPEG1	Q2M385	716 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBR5-208	ENST00000520898	DPCR1	Q3MIW9	517 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBR5-208	ENST00000520898	BOLA3	Q53S33	107 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBR5-208	ENST00000520898	TXNRD3NB	Q6F5E7	133 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBR5-208	ENST00000520898	ZNF529	Q6P280	563 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBR5-208	ENST00000520898	PGBD2	Q6P3X8	592 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBR5-208	ENST00000520898	IGFL2	Q6UWQ7	119 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBR5-208	ENST00000520898	GDF7	Q7Z4P5	450 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBR5-208	ENST00000520898	IRF2BP2	Q7Z5L9	587 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBR5-208	ENST00000520898	PDSS2	Q86YH6	399 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBR5-208	ENST00000520898	RAB43	Q86YS6	212 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBR5-208	ENST00000520898	ZADH2	Q8N4Q0	377 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBR5-208	ENST00000520898	OR1L3	Q8NH93	324 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBR5-208	ENST00000520898	FAM71B	Q8TC56	605 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBR5-208	ENST00000520898	FAR1	Q8WVX9	515 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBR5-208	ENST00000520898	CXorf40B	Q96DE9	158 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBR5-208	ENST00000520898	SNX22	Q96L94	193 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBR5-208	ENST00000520898	FER1L6-AS2	Q96M78	137 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBR5-208	ENST00000520898	PPM1M	Q96MI6	270 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBR5-208	ENST00000520898	AGAP3	Q96P47	875 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBR5-208	ENST00000520898	TSGA13	Q96PP4	275 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBR5-208	ENST00000520898	VPS35	Q96QK1	796 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBR5-208	ENST00000520898	TRIB3	Q96RU7	358 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBR5-208	ENST00000520898	SLX1A	Q9BQ83	275 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBR5-208	ENST00000520898	SYTL2	Q9HCH5	934 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBR5-208	ENST00000520898	SEPT11	Q9NVA2	429 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
UBR5-208	ENST00000520898	RBM22	Q9NW64	420 aa	Known RBP eCLIP	4.97	□□□□□ -1.61
UBR5-208	ENST00000520898	HRASLS2	Q9NWW9	162 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBR5-208	ENST00000520898	TAB2	Q9NYJ8	693 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBR5-208	ENST00000520898	MYO1A	Q9UBC5	1043 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBR5-208	ENST00000520898	COPG2	Q9UBF2	871 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBR5-208	ENST00000520898	TRIM10	Q9UDY6	481 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBR5-208	ENST00000520898	CSAG2	Q9Y5P2	127 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBR5-208	ENST00000520898	KLF2	Q9Y5W3	355 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
UBR5-208	ENST00000520898	FLNA	P21333	2647 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
UBR5-208	ENST00000520898	SNRNP200	O75643	2136 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898		A0A1W2PRX2	142 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	SLC9B1P1	A6NJY1	282 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898		B5MCH6	92 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898		H3BMH7	237 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	MATN2	O00339	956 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	HOXA3	O43365	443 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	MFSD11	O43934	449 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	MTX2	O75431	263 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	CDK14	O94921	469 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	HAUS5	O94927	633 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	IGHE	P01854	428 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	KRT1	P04264	644 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	HLA-DQB2	P05538	268 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	ANXA2	P07355	339 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	VCL	P18206	1134 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	CCNC	P24863	283 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	OTX2	P32243	289 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	ARSE	P51690	589 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	CLRN1	P58418	232 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	SLC25A11	Q02978	314 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	TMEM115	Q12893	351 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	RIN1	Q13671	783 aa		4.96	□□□□□ -1.62

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