RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516259.1

RNU6-390P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 390, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-390P, Length 103 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-390P-201ENST00000516259 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP2.96□□□□□ -1.94
RNU6-390P-201ENST00000516259 MAGEA11P43364 429 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-390P-201ENST00000516259 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP2.96□□□□□ -1.94
RNU6-390P-201ENST00000516259 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
RNU6-390P-201ENST00000516259 CLDN17P56750 224 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-390P-201ENST00000516259 ARL16Q0P5N6 197 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-390P-201ENST00000516259 SGCGQ13326 291 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-390P-201ENST00000516259 TRIM29Q14134 588 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-390P-201ENST00000516259 UGP2Q16851 508 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-390P-201ENST00000516259 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP2.96□□□□□ -1.94
RNU6-390P-201ENST00000516259 GPR33Q49SQ1 333 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-390P-201ENST00000516259 XKR3Q5GH77 459 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-390P-201ENST00000516259 FAM72AQ5TYM5 149 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-390P-201ENST00000516259 FAM72DQ6L9T8 149 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-390P-201ENST00000516259 TTC27Q6P3X3 843 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-390P-201ENST00000516259 ZNF790Q6PG37 636 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-390P-201ENST00000516259 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP2.96□□□□□ -1.94
RNU6-390P-201ENST00000516259 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
RNU6-390P-201ENST00000516259 COX8CQ7Z4L0 72 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-390P-201ENST00000516259 RABEPKQ7Z6M1 372 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-390P-201ENST00000516259 FAM72BQ86X60 149 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-390P-201ENST00000516259 CDK20Q8IZL9 346 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-390P-201ENST00000516259 KIRREL3Q8IZU9 778 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-390P-201ENST00000516259 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP2.96□□□□□ -1.94
RNU6-390P-201ENST00000516259 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-390P-201ENST00000516259 CCDC63Q8NA47 563 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-390P-201ENST00000516259 OR7A2PQ8NGA2 310 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-390P-201ENST00000516259 LRRC8CQ8TDW0 803 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-390P-201ENST00000516259 METTL21AQ8WXB1 218 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-390P-201ENST00000516259 SNX21Q969T3 373 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-390P-201ENST00000516259 CDHR1Q96JP9 859 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-390P-201ENST00000516259 LURAP1Q96LR2 239 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-390P-201ENST00000516259 BTBD9Q96Q07 612 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-390P-201ENST00000516259 PANX3Q96QZ0 392 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-390P-201ENST00000516259 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP2.96□□□□□ -1.94
RNU6-390P-201ENST00000516259 LPAR4Q99677 370 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-390P-201ENST00000516259 IDI2Q9BXS1 227 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-390P-201ENST00000516259 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-390P-201ENST00000516259 SHARPINQ9H0F6 387 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-390P-201ENST00000516259 TMEM245Q9H330 911 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-390P-201ENST00000516259 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP2.96□□□□□ -1.94
RNU6-390P-201ENST00000516259 RNF121Q9H920 327 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-390P-201ENST00000516259 DNAJC11Q9NVH1 559 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-390P-201ENST00000516259 TAAR2Q9P1P5 351 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-390P-201ENST00000516259 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP2.96□□□□□ -1.94
RNU6-390P-201ENST00000516259 MOSPD1Q9UJG1 213 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-390P-201ENST00000516259 TSPAN16Q9UKR8 245 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-390P-201ENST00000516259 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP2.96□□□□□ -1.94
RNU6-390P-201ENST00000516259 TCF19Q9Y242 345 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-390P-201ENST00000516259 ABCC9O60706 1549 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-390P-201ENST00000516259 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP2.96□□□□□ -1.94
RNU6-390P-201ENST00000516259 UMODL1Q5DID0 1318 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-390P-201ENST00000516259 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
RNU6-390P-201ENST00000516259 ANTXRLA6NF34 631 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-390P-201ENST00000516259 ANKDD1BA6NHY2 528 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-390P-201ENST00000516259 SMIM1B2RUZ4 78 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-390P-201ENST00000516259 TEX28O15482 410 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-390P-201ENST00000516259 SEC22BO75396 215 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-390P-201ENST00000516259 GRAP2O75791 330 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-390P-201ENST00000516259 GPIP06744 558 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-390P-201ENST00000516259 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
RNU6-390P-201ENST00000516259 DUTP33316 252 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
RNU6-390P-201ENST00000516259 TIMP3P35625 211 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-390P-201ENST00000516259 ATP6V1E1P36543 226 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-390P-201ENST00000516259 NT5C2P49902 561 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-390P-201ENST00000516259 CASP9P55211 416 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-390P-201ENST00000516259 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
RNU6-390P-201ENST00000516259 SLC3A1Q07837 685 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-390P-201ENST00000516259 GRB14Q14449 540 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-390P-201ENST00000516259 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
RNU6-390P-201ENST00000516259 ZNF585BQ52M93 769 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-390P-201ENST00000516259 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP2.95□□□□□ -1.94
RNU6-390P-201ENST00000516259 ARMCX4Q5H9R4 360 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-390P-201ENST00000516259 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-390P-201ENST00000516259 LEKR1Q6ZMV7 388 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-390P-201ENST00000516259 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP2.95□□□□□ -1.94
RNU6-390P-201ENST00000516259 FCRLAQ7L513 359 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-390P-201ENST00000516259 ZNF410Q86VK4 478 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-390P-201ENST00000516259 DNAJC22Q8N4W6 341 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-390P-201ENST00000516259 STPG4Q8N801 248 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-390P-201ENST00000516259 ARL10Q8N8L6 244 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-390P-201ENST00000516259 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
RNU6-390P-201ENST00000516259 ZNF383Q8NA42 475 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-390P-201ENST00000516259 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
RNU6-390P-201ENST00000516259 OR10G8Q8NGN5 311 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-390P-201ENST00000516259 OR1L3Q8NH93 324 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-390P-201ENST00000516259 TMEM190Q8WZ59 177 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-390P-201ENST00000516259 EPSTI1Q96J88 318 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-390P-201ENST00000516259 C10orf90Q96M02 699 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-390P-201ENST00000516259 UHRF2Q96PU4 802 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-390P-201ENST00000516259 CCM2Q9BSQ5 444 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-390P-201ENST00000516259 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP2.95□□□□□ -1.94
RNU6-390P-201ENST00000516259 OSBPL8Q9BZF1 889 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-390P-201ENST00000516259 THAP2Q9H0W7 228 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-390P-201ENST00000516259 VIPAS39Q9H9C1 493 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-390P-201ENST00000516259 SIX2Q9NPC8 291 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-390P-201ENST00000516259 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
RNU6-390P-201ENST00000516259 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP2.95□□□□□ -1.94
RNU6-390P-201ENST00000516259 PANK4Q9NVE7 773 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-390P-201ENST00000516259 ANO10Q9NW15 660 aa2.95□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 83.1 ms