RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514178.5

PGGT1B-205, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 4

Gene PGGT1B, Length 553 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-205ENST00000514178 MTMR12Q9C0I1 747 aa7.03□□□□□ -1.28
PGGT1B-205ENST00000514178 SHARPINQ9H0F6 387 aa7.03□□□□□ -1.28
PGGT1B-205ENST00000514178 CARD9Q9H257 536 aa7.03□□□□□ -1.28
PGGT1B-205ENST00000514178 EVA1AQ9H8M9 152 aa7.03□□□□□ -1.28
PGGT1B-205ENST00000514178 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
PGGT1B-205ENST00000514178 RNF7Q9UBF6 113 aa7.03□□□□□ -1.28
PGGT1B-205ENST00000514178 UBQLN2Q9UHD9 624 aa7.03□□□□□ -1.28
PGGT1B-205ENST00000514178 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
PGGT1B-205ENST00000514178 NSG2Q9Y328 171 aa7.03□□□□□ -1.28
PGGT1B-205ENST00000514178 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa7.03□□□□□ -1.28
PGGT1B-205ENST00000514178 TMEM129A0AVI4 362 aa7.02□□□□□ -1.29
PGGT1B-205ENST00000514178 LHCGRP22888 699 aa7.02□□□□□ -1.29
PGGT1B-205ENST00000514178 SFNP31947 248 aa7.02□□□□□ -1.29
PGGT1B-205ENST00000514178 CETN2P41208 172 aa7.02□□□□□ -1.29
PGGT1B-205ENST00000514178 SQLEQ14534 574 aa7.02□□□□□ -1.29
PGGT1B-205ENST00000514178 TAF13Q15543 124 aa7.02□□□□□ -1.29
PGGT1B-205ENST00000514178 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
PGGT1B-205ENST00000514178 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP7.02□□□□□ -1.29
PGGT1B-205ENST00000514178 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
PGGT1B-205ENST00000514178 PRSS35Q8N3Z0 413 aa7.02□□□□□ -1.29
PGGT1B-205ENST00000514178 ZNF843Q8N446 348 aa7.02□□□□□ -1.29
PGGT1B-205ENST00000514178 ZNF383Q8NA42 475 aa7.02□□□□□ -1.29
PGGT1B-205ENST00000514178 SMYD1Q8NB12 490 aa7.02□□□□□ -1.29
PGGT1B-205ENST00000514178 GGHQ92820 318 aa7.02□□□□□ -1.29
PGGT1B-205ENST00000514178 IGSF21Q96ID5 467 aa7.02□□□□□ -1.29
PGGT1B-205ENST00000514178 RHNO1Q9BSD3 238 aa7.02□□□□□ -1.29
PGGT1B-205ENST00000514178 C5orf66Q9H5L9 145 aa7.02□□□□□ -1.29
PGGT1B-205ENST00000514178 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
PGGT1B-205ENST00000514178 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
PGGT1B-205ENST00000514178 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
PGGT1B-205ENST00000514178 DONSONQ9NYP3 566 aa7.02□□□□□ -1.29
PGGT1B-205ENST00000514178 SPASTQ9UBP0 616 aa7.02□□□□□ -1.29
PGGT1B-205ENST00000514178 TNNQ9UQP3 1299 aa7.02□□□□□ -1.29
PGGT1B-205ENST00000514178 R4GN57 208 aa7.02□□□□□ -1.29
PGGT1B-205ENST00000514178 NPHP3Q7Z494 1330 aa7.01□□□□□ -1.29
PGGT1B-205ENST00000514178 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa7.01□□□□□ -1.29
PGGT1B-205ENST00000514178 ANTXRLA6NF34 631 aa7.01□□□□□ -1.29
PGGT1B-205ENST00000514178 ZNF197O14709 1029 aa7.01□□□□□ -1.29
PGGT1B-205ENST00000514178 ATP6V0E1O15342 81 aa7.01□□□□□ -1.29
PGGT1B-205ENST00000514178 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
PGGT1B-205ENST00000514178 CCDC192P0DO97 292 aa7.01□□□□□ -1.29
PGGT1B-205ENST00000514178 CA6P23280 308 aa7.01□□□□□ -1.29
PGGT1B-205ENST00000514178 ALDH4A1P30038 563 aa7.01□□□□□ -1.29
PGGT1B-205ENST00000514178 CAMLGP49069 296 aa7.01□□□□□ -1.29
PGGT1B-205ENST00000514178 GPC3P51654 580 aa7.01□□□□□ -1.29
PGGT1B-205ENST00000514178 ART1P52961 327 aa7.01□□□□□ -1.29
PGGT1B-205ENST00000514178 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
PGGT1B-205ENST00000514178 GAMTQ14353 236 aa7.01□□□□□ -1.29
PGGT1B-205ENST00000514178 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
PGGT1B-205ENST00000514178 ZNF542PQ5EBM4 170 aa7.01□□□□□ -1.29
PGGT1B-205ENST00000514178 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa7.01□□□□□ -1.29
PGGT1B-205ENST00000514178 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
PGGT1B-205ENST00000514178 CCNYQ8ND76 341 aa7.01□□□□□ -1.29
PGGT1B-205ENST00000514178 PIK3R3Q92569 461 aa7.01□□□□□ -1.29
PGGT1B-205ENST00000514178 TMEM186Q96B77 213 aa7.01□□□□□ -1.29
PGGT1B-205ENST00000514178 MED30Q96HR3 178 aa7.01□□□□□ -1.29
PGGT1B-205ENST00000514178 ST6GAL2Q96JF0 529 aa7.01□□□□□ -1.29
PGGT1B-205ENST00000514178 C4orf45Q96LM5 186 aa7.01□□□□□ -1.29
PGGT1B-205ENST00000514178 FAM213AQ9BRX8 229 aa7.01□□□□□ -1.29
PGGT1B-205ENST00000514178 KCNMB3Q9NPA1 279 aa7.01□□□□□ -1.29
PGGT1B-205ENST00000514178 ECHDC1Q9NTX5 307 aa7.01□□□□□ -1.29
PGGT1B-205ENST00000514178 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
PGGT1B-205ENST00000514178 FAM118AQ9NWS6 357 aa7.01□□□□□ -1.29
PGGT1B-205ENST00000514178 TSPAN16Q9UKR8 245 aa7.01□□□□□ -1.29
PGGT1B-205ENST00000514178 KCNJ14Q9UNX9 436 aa7.01□□□□□ -1.29
PGGT1B-205ENST00000514178 TMED7Q9Y3B3 224 aa7.01□□□□□ -1.29
PGGT1B-205ENST00000514178 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa7□□□□□ -1.29
PGGT1B-205ENST00000514178 PLSCR5A0PG75 271 aa7□□□□□ -1.29
PGGT1B-205ENST00000514178 HSF2BPO75031 334 aa7□□□□□ -1.29
PGGT1B-205ENST00000514178 ALPLP05186 524 aa7□□□□□ -1.29
PGGT1B-205ENST00000514178 ETS1P14921 441 aa7□□□□□ -1.29
PGGT1B-205ENST00000514178 SRD5A2P31213 254 aa7□□□□□ -1.29
PGGT1B-205ENST00000514178 CLDN17P56750 224 aa7□□□□□ -1.29
PGGT1B-205ENST00000514178 SRP54P61011 504 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
PGGT1B-205ENST00000514178 RPP38P78345 283 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
PGGT1B-205ENST00000514178 SLC3A1Q07837 685 aa7□□□□□ -1.29
PGGT1B-205ENST00000514178 SLC25A53Q5H9E4 307 aa7□□□□□ -1.29
PGGT1B-205ENST00000514178 ARMCX4Q5H9R4 360 aa7□□□□□ -1.29
PGGT1B-205ENST00000514178 C20orf194Q5TEA3 1177 aa7□□□□□ -1.29
PGGT1B-205ENST00000514178 UGT3A1Q6NUS8 523 aa7□□□□□ -1.29
PGGT1B-205ENST00000514178 NEK5Q6P3R8 708 aa7□□□□□ -1.29
PGGT1B-205ENST00000514178 ISLR2Q6UXK2 745 aa7□□□□□ -1.29
PGGT1B-205ENST00000514178 B3GLCTQ6Y288 498 aa7□□□□□ -1.29
PGGT1B-205ENST00000514178 NLRP14Q86W24 1093 aa7□□□□□ -1.29
PGGT1B-205ENST00000514178 RCOR2Q8IZ40 523 aa7□□□□□ -1.29
PGGT1B-205ENST00000514178 ELMOD2Q8IZ81 293 aa7□□□□□ -1.29
PGGT1B-205ENST00000514178 OR13C3Q8NGS6 347 aa7□□□□□ -1.29
PGGT1B-205ENST00000514178 METTL21AQ8WXB1 218 aa7□□□□□ -1.29
PGGT1B-205ENST00000514178 LGALS12Q96DT0 336 aa7□□□□□ -1.29
PGGT1B-205ENST00000514178 BTBD9Q96Q07 612 aa7□□□□□ -1.29
PGGT1B-205ENST00000514178 ZNF577Q9BSK1 485 aa7□□□□□ -1.29
PGGT1B-205ENST00000514178 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa7□□□□□ -1.29
PGGT1B-205ENST00000514178 NACAP1Q9BZK3 213 aa7□□□□□ -1.29
PGGT1B-205ENST00000514178 TMEM245Q9H330 911 aa7□□□□□ -1.29
PGGT1B-205ENST00000514178 CPVLQ9H3G5 476 aa7□□□□□ -1.29
PGGT1B-205ENST00000514178 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa7□□□□□ -1.29
PGGT1B-205ENST00000514178 CCPG1Q9ULG6 757 aa7□□□□□ -1.29
PGGT1B-205ENST00000514178 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa6.99□□□□□ -1.29
PGGT1B-205ENST00000514178 SLC15A5A6NIM6 579 aa6.99□□□□□ -1.29
PGGT1B-205ENST00000514178 C16orf97H3BN30 126 aa6.99□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.1 ms