RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512656.1

USP46-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 46, humanhuman

TSL 3

Gene USP46, Length 467 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46-208ENST00000512656 PCDH17O14917 1159 aa6.85□□□□□ -1.31
USP46-208ENST00000512656 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
USP46-208ENST00000512656 VPS26AO75436 327 aa6.85□□□□□ -1.31
USP46-208ENST00000512656 USP1O94782 785 aa6.85□□□□□ -1.31
USP46-208ENST00000512656 C1orf105O95561 183 aa6.85□□□□□ -1.31
USP46-208ENST00000512656 HPP00738 406 aa6.85□□□□□ -1.31
USP46-208ENST00000512656 FDXRP22570 491 aa6.85□□□□□ -1.31
USP46-208ENST00000512656 CXCR2P25025 360 aa6.85□□□□□ -1.31
USP46-208ENST00000512656 ATP5DP30049 168 aa6.85□□□□□ -1.31
USP46-208ENST00000512656 CMPK1P30085 196 aa6.85□□□□□ -1.31
USP46-208ENST00000512656 HSD17B2P37059 387 aa6.85□□□□□ -1.31
USP46-208ENST00000512656 GRIA1P42261 906 aa6.85□□□□□ -1.31
USP46-208ENST00000512656 OR1D4P47884 311 aa6.85□□□□□ -1.31
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USP46-208ENST00000512656 AP2B1P63010 937 aa6.85□□□□□ -1.31
USP46-208ENST00000512656 SARNPP82979 210 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
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USP46-208ENST00000512656 CDC16Q13042 620 aa6.85□□□□□ -1.31
USP46-208ENST00000512656 SNX1Q13596 522 aa6.85□□□□□ -1.31
USP46-208ENST00000512656 GRB7Q14451 532 aa6.85□□□□□ -1.31
USP46-208ENST00000512656 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP6.85□□□□□ -1.31
USP46-208ENST00000512656 SEMA3AQ14563 771 aa6.85□□□□□ -1.31
USP46-208ENST00000512656 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
USP46-208ENST00000512656 RPS6KA1Q15418 735 aa6.85□□□□□ -1.31
USP46-208ENST00000512656 CCNG2Q16589 344 aa6.85□□□□□ -1.31
USP46-208ENST00000512656 CRB2Q5IJ48 1285 aa6.85□□□□□ -1.31
USP46-208ENST00000512656 WASHC2DQ5SRD0 308 aa6.85□□□□□ -1.31
USP46-208ENST00000512656 ARMC3Q5W041 872 aa6.85□□□□□ -1.31
USP46-208ENST00000512656 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa6.85□□□□□ -1.31
USP46-208ENST00000512656 KIRREL2Q6UWL6 708 aa6.85□□□□□ -1.31
USP46-208ENST00000512656 IGFL2Q6UWQ7 119 aa6.85□□□□□ -1.31
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USP46-208ENST00000512656 GSTA5Q7RTV2 222 aa6.85□□□□□ -1.31
USP46-208ENST00000512656 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
USP46-208ENST00000512656 KRT222Q8N1A0 295 aa6.85□□□□□ -1.31
USP46-208ENST00000512656 OR2L3Q8NG85 312 aa6.85□□□□□ -1.31
USP46-208ENST00000512656 OR11G2Q8NGC1 345 aa6.85□□□□□ -1.31
USP46-208ENST00000512656 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa6.85□□□□□ -1.31
USP46-208ENST00000512656 GAL3ST3Q96A11 431 aa6.85□□□□□ -1.31
USP46-208ENST00000512656 MVB12AQ96EY5 273 aa6.85□□□□□ -1.31
USP46-208ENST00000512656 PLPPR2Q96GM1 343 aa6.85□□□□□ -1.31
USP46-208ENST00000512656 CNDP1Q96KN2 507 aa6.85□□□□□ -1.31
USP46-208ENST00000512656 IL17FQ96PD4 163 aa6.85□□□□□ -1.31
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USP46-208ENST00000512656 MIPEPQ99797 713 aa6.85□□□□□ -1.31
USP46-208ENST00000512656 DESI2Q9BSY9 194 aa6.85□□□□□ -1.31
USP46-208ENST00000512656 CRB3Q9BUF7 120 aa6.85□□□□□ -1.31
USP46-208ENST00000512656 P2RY12Q9H244 342 aa6.85□□□□□ -1.31
USP46-208ENST00000512656 ZNF304Q9HCX3 659 aa6.85□□□□□ -1.31
USP46-208ENST00000512656 CHRAC1Q9NRG0 131 aa6.85□□□□□ -1.31
USP46-208ENST00000512656 FAM114A2Q9NRY5 505 aa6.85□□□□□ -1.31
USP46-208ENST00000512656 HOMER3Q9NSC5 361 aa6.85□□□□□ -1.31
USP46-208ENST00000512656 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
USP46-208ENST00000512656 CTSFQ9UBX1 484 aa6.85□□□□□ -1.31
USP46-208ENST00000512656 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
USP46-208ENST00000512656 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
USP46-208ENST00000512656 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa6.85□□□□□ -1.31
USP46-208ENST00000512656 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa6.85□□□□□ -1.31
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USP46-208ENST00000512656 A0A0J9YVX5 310 aa6.84□□□□□ -1.31
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USP46-208ENST00000512656 TXNDC9O14530 226 aa6.84□□□□□ -1.31
USP46-208ENST00000512656 CTSVO60911 334 aa6.84□□□□□ -1.31
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USP46-208ENST00000512656 CCNDBP1O95273 360 aa6.84□□□□□ -1.31
USP46-208ENST00000512656 ESR1P03372 595 aa6.84□□□□□ -1.31
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USP46-208ENST00000512656 UQCRHP07919 91 aa6.84□□□□□ -1.31
USP46-208ENST00000512656 ZGLP1P0C6A0 271 aa6.84□□□□□ -1.31
USP46-208ENST00000512656 RNF224P0DH78 156 aa6.84□□□□□ -1.31
USP46-208ENST00000512656 MYBL2P10244 700 aa6.84□□□□□ -1.31
USP46-208ENST00000512656 PKMP14618 531 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
USP46-208ENST00000512656 ETS1P14921 441 aa6.84□□□□□ -1.31
USP46-208ENST00000512656 PAMP19021 973 aa6.84□□□□□ -1.31
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USP46-208ENST00000512656 FMO4P31512 558 aa6.84□□□□□ -1.31
USP46-208ENST00000512656 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
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USP46-208ENST00000512656 KLC1Q07866 573 aa6.84□□□□□ -1.31
USP46-208ENST00000512656 MFAP5Q13361 173 aa6.84□□□□□ -1.31
USP46-208ENST00000512656 ARHGAP19Q14CB8 494 aa6.84□□□□□ -1.31
USP46-208ENST00000512656 TTLL9Q3SXZ7 439 aa6.84□□□□□ -1.31
USP46-208ENST00000512656 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa6.84□□□□□ -1.31
USP46-208ENST00000512656 SFRP5Q5T4F7 317 aa6.84□□□□□ -1.31
USP46-208ENST00000512656 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
USP46-208ENST00000512656 CNSTQ6PJW8 725 aa6.84□□□□□ -1.31
USP46-208ENST00000512656 FAM180AQ6UWF9 173 aa6.84□□□□□ -1.31
USP46-208ENST00000512656 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa6.84□□□□□ -1.31
USP46-208ENST00000512656 COX15Q7KZN9 410 aa6.84□□□□□ -1.31
USP46-208ENST00000512656 RNF44Q7L0R7 432 aa6.84□□□□□ -1.31
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