RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498367.1

PDCD4-211, Transcript of programmed cell death 4, humanhuman

TSL 3

Gene PDCD4, Length 975 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD4-211ENST00000498367 PMS2CLQ68D20 193 aa6.99□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 FIGLAQ6QHK4 219 aa6.99□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 VITQ6UXI7 678 aa6.99□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 TMEM26Q6ZUK4 368 aa6.99□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 SMIM15Q7Z3B0 74 aa6.99□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 ZFAND4Q86XD8 727 aa6.99□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 ZNF280BQ86YH2 543 aa6.99□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 TRAM1L1Q8N609 369 aa6.99□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 PQLC3Q8N755 202 aa6.99□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 ZNF248Q8NDW4 579 aa6.99□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 DNERQ8NFT8 737 aa6.99□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 OR8K1Q8NGG5 319 aa6.99□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 RAB40AQ8WXH6 277 aa6.99□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 ASB15Q8WXK1 588 aa6.99□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 ARNTL2Q8WYA1 636 aa6.99□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 PWWP2AQ96N64 755 aa6.99□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 CTRCQ99895 268 aa6.99□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 ABHD6Q9BV23 337 aa6.99□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 EGLN1Q9GZT9 426 aa6.99□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 OR51B6Q9H340 312 aa6.99□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 ATXN3LQ9H3M9 355 aa6.99□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa6.99□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 C7orf69Q9H7B7 122 aa6.99□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 LMAN1LQ9HAT1 526 aa6.99□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 FOLH1BQ9HBA9 442 aa6.99□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 LRRC4Q9HBW1 653 aa6.99□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 ASAH2Q9NR71 780 aa6.99□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 BTG4Q9NY30 223 aa6.99□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 ONECUT1Q9UBC0 465 aa6.99□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 NARFQ9UHQ1 456 aa6.99□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 FBXL7Q9UJT9 491 aa6.99□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 PCDHA12Q9UN75 941 aa6.99□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 KCNJ14Q9UNX9 436 aa6.99□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 OR10H1Q9Y4A9 318 aa6.99□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa6.98□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 SMCO3A2RU48 225 aa6.98□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 PRR19A6NJB7 356 aa6.98□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 FAM90A8PA6NJQ4 464 aa6.98□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 WWP2O00308 870 aa6.98□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 DUX1O43812 170 aa6.98□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 NME6O75414 186 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 GPX5O75715 221 aa6.98□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 PIGRP01833 764 aa6.98□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 FTH1P02794 183 aa6.98□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 GPIP06744 558 aa6.98□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 FAM90A13PP0C7W8 464 aa6.98□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 FAM90A24PP0C7X0 464 aa6.98□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 FCGR2AP12318 317 aa6.98□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 EPHA1P21709 976 aa6.98□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 TACR3P29371 465 aa6.98□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 CDC25BP30305 580 aa6.98□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 GTF2H1P32780 548 aa6.98□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 ADRA1AP35348 466 aa6.98□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 P2RY2P41231 377 aa6.98□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 ALDH3B2P48448 385 aa6.98□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 CXCR3P49682 368 aa6.98□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 ACADVLP49748 655 aa6.98□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 CDK9P50750 372 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 PPT1P50897 306 aa6.98□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 PTENP60484 403 aa6.98□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 ECT2LQ008S8 904 aa6.98□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 IL9RQ01113 521 aa6.98□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 ZNF33AQ06730 810 aa6.98□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 CDH17Q12864 832 aa6.98□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 TGFBIQ15582 683 aa6.98□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 SLC18A3Q16572 532 aa6.98□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 VWC2Q2TAL6 325 aa6.98□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 NDUFAF6Q330K2 333 aa6.98□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 ZCWPW2Q504Y3 356 aa6.98□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 XKR6Q5GH73 641 aa6.98□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 TEX30Q5JUR7 227 aa6.98□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 EPHA10Q5JZY3 1008 aa6.98□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 CTSL3PQ5NE16 218 aa6.98□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 GLB1LQ6UWU2 654 aa6.98□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa6.98□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa6.98□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 ADGRF4Q8IZF3 695 aa6.98□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 MCOLN2Q8IZK6 566 aa6.98□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 GCNT2Q8N0V5 402 aa6.98□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 PQLC1Q8N2U9 271 aa6.98□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 TTC9BQ8N6N2 239 aa6.98□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 CCDC197Q8NCU1 140 aa6.98□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 DTD1Q8TEA8 209 aa6.98□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.2 ms