RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492648.2

TAF1B-209, Transcript of TATA-box binding protein associated factor, RNA polymerase I subunit B, human

TSL 5

Gene TAF1B, Length 1,045 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TAF1B-209	ENST00000492648	HSP90AB3P	Q58FF7	597 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TAF1B-209	ENST00000492648	ARMCX4	Q5H9R4	360 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TAF1B-209	ENST00000492648		Q5PR19	223 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TAF1B-209	ENST00000492648	SUSD4	Q5VX71	490 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TAF1B-209	ENST00000492648	TYW3	Q6IPR3	259 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
TAF1B-209	ENST00000492648	MIS18BP1	Q6P0N0	1132 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TAF1B-209	ENST00000492648	PARM1	Q6UWI2	310 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TAF1B-209	ENST00000492648	PLXDC2	Q6UX71	529 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TAF1B-209	ENST00000492648	ANGPTL8	Q6UXH0	198 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TAF1B-209	ENST00000492648	ZNF704	Q6ZNC4	412 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
TAF1B-209	ENST00000492648	ZNF367	Q7RTV3	350 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TAF1B-209	ENST00000492648	C8orf58	Q8NAV2	365 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TAF1B-209	ENST00000492648	MINDY2	Q8NBR6	621 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TAF1B-209	ENST00000492648	ENGASE	Q8NFI3	743 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TAF1B-209	ENST00000492648	RNF128	Q8TEB7	428 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TAF1B-209	ENST00000492648	TMEM174	Q8WUU8	243 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TAF1B-209	ENST00000492648	SLC38A5	Q8WUX1	472 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TAF1B-209	ENST00000492648	RLN3	Q8WXF3	142 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TAF1B-209	ENST00000492648	ZG16B	Q96DA0	208 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TAF1B-209	ENST00000492648	MAGED4	Q96JG8	741 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TAF1B-209	ENST00000492648	APOLD1	Q96LR9	279 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TAF1B-209	ENST00000492648	ZNF48	Q96MX3	618 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
TAF1B-209	ENST00000492648	GUCD1	Q96NT3	240 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TAF1B-209	ENST00000492648	ZNF607	Q96SK3	696 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TAF1B-209	ENST00000492648	CAPS2	Q9BXY5	557 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TAF1B-209	ENST00000492648	RAB6C	Q9H0N0	254 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TAF1B-209	ENST00000492648	THAP2	Q9H0W7	228 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TAF1B-209	ENST00000492648	ACTL8	Q9H568	366 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TAF1B-209	ENST00000492648	WDR76	Q9H967	626 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TAF1B-209	ENST00000492648	TRPV5	Q9NQA5	729 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TAF1B-209	ENST00000492648	YAE1D1	Q9NRH1	226 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TAF1B-209	ENST00000492648	IL36RN	Q9UBH0	155 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TAF1B-209	ENST00000492648	LRWD1	Q9UFC0	647 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TAF1B-209	ENST00000492648	ERVK-19	Q9WJR5	959 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TAF1B-209	ENST00000492648	MRPS2	Q9Y399	296 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
TAF1B-209	ENST00000492648	RAI2	Q9Y5P3	530 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TAF1B-209	ENST00000492648	KIF16B	Q96L93	1317 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TAF1B-209	ENST00000492648	PCDH11Y	Q9BZA8	1340 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TAF1B-209	ENST00000492648		A0A0U1RRA0	63 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TAF1B-209	ENST00000492648	OR5K3	A6NET4	321 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TAF1B-209	ENST00000492648	LRRIQ4	A6NIV6	560 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TAF1B-209	ENST00000492648		J3KR12	359 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TAF1B-209	ENST00000492648		M0R296	226 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TAF1B-209	ENST00000492648	PPEF2	O14830	753 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TAF1B-209	ENST00000492648	XPO1	O14980	1071 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TAF1B-209	ENST00000492648	ARPC2	O15144	300 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TAF1B-209	ENST00000492648	LANCL1	O43813	399 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TAF1B-209	ENST00000492648	GPRIN2	O60269	458 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TAF1B-209	ENST00000492648	RNASEH1	O60930	286 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TAF1B-209	ENST00000492648	CS	O75390	466 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TAF1B-209	ENST00000492648	CSDE1	O75534	798 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TAF1B-209	ENST00000492648	CIB2	O75838	187 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TAF1B-209	ENST00000492648	KIAA0754	O94854	1291 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TAF1B-209	ENST00000492648	UGT2B4	P06133	528 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TAF1B-209	ENST00000492648	CHRNG	P07510	517 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TAF1B-209	ENST00000492648	FGF2	P09038	288 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TAF1B-209	ENST00000492648	NAGA	P17050	411 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TAF1B-209	ENST00000492648	CBL	P22681	906 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TAF1B-209	ENST00000492648	JAK1	P23458	1154 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TAF1B-209	ENST00000492648	PTPN4	P29074	926 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TAF1B-209	ENST00000492648	RASSF2	P50749	326 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TAF1B-209	ENST00000492648	RPS18	P62269	152 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TAF1B-209	ENST00000492648	FKBP1B	P68106	108 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TAF1B-209	ENST00000492648	RPP38	P78345	283 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TAF1B-209	ENST00000492648	CX3CL1	P78423	397 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TAF1B-209	ENST00000492648	DGCR2	P98153	550 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TAF1B-209	ENST00000492648	MYBPC1	Q00872	1141 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TAF1B-209	ENST00000492648	STX1A	Q16623	288 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TAF1B-209	ENST00000492648	NKAIN2	Q5VXU1	208 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TAF1B-209	ENST00000492648	ZNF770	Q6IQ21	691 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TAF1B-209	ENST00000492648	KLHL10	Q6JEL2	608 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TAF1B-209	ENST00000492648	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TAF1B-209	ENST00000492648	TTC27	Q6P3X3	843 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TAF1B-209	ENST00000492648	LRRC8B	Q6P9F7	803 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TAF1B-209	ENST00000492648	LINGO4	Q6UY18	593 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TAF1B-209	ENST00000492648		Q75L30	129 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TAF1B-209	ENST00000492648	LDLRAD3	Q86YD5	345 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TAF1B-209	ENST00000492648	LGI2	Q8N0V4	545 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TAF1B-209	ENST00000492648	GBGT1	Q8N5D6	347 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TAF1B-209	ENST00000492648	CPSF7	Q8N684	471 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TAF1B-209	ENST00000492648	LRRC17	Q8N6Y2	441 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TAF1B-209	ENST00000492648	SMYD1	Q8NB12	490 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TAF1B-209	ENST00000492648	NPEPL1	Q8NDH3	523 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TAF1B-209	ENST00000492648	RDM1	Q8NG50	284 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TAF1B-209	ENST00000492648	OR5R1	Q8NH85	324 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TAF1B-209	ENST00000492648	PINX1	Q96BK5	328 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TAF1B-209	ENST00000492648	ZPBP	Q9BS86	351 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TAF1B-209	ENST00000492648	DUSP26	Q9BV47	211 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TAF1B-209	ENST00000492648	EGLN1	Q9GZT9	426 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TAF1B-209	ENST00000492648	ZMYND12	Q9H0C1	365 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TAF1B-209	ENST00000492648	LRMDA	Q9H2I8	198 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TAF1B-209	ENST00000492648	VCX2	Q9H322	139 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TAF1B-209	ENST00000492648	C10orf88	Q9H8K7	445 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TAF1B-209	ENST00000492648	RNF121	Q9H920	327 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TAF1B-209	ENST00000492648	MARCH7	Q9H992	704 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TAF1B-209	ENST00000492648	ACKR4	Q9NPB9	350 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TAF1B-209	ENST00000492648	KRCC1	Q9NPI7	259 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TAF1B-209	ENST00000492648	ASB6	Q9NWX5	421 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TAF1B-209	ENST00000492648	MIS18A	Q9NYP9	233 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TAF1B-209	ENST00000492648	AIPL1	Q9NZN9	384 aa		4.63	□□□□□ -1.67

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