RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490677.1

HOXB3-211, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXB3, Length 1,109 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-211ENST00000490677 HECTD2Q5U5R9 776 aa26.35■■□□□ 1.81
HOXB3-211ENST00000490677 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP26.35■■□□□ 1.81
HOXB3-211ENST00000490677 LCTLQ6UWM7 567 aa26.35■■□□□ 1.81
HOXB3-211ENST00000490677 PDIK1LQ8N165 341 aa26.35■■□□□ 1.81
HOXB3-211ENST00000490677 MYO1HQ8N1T3 1032 aa26.35■■□□□ 1.81
HOXB3-211ENST00000490677 SSC4DQ8WTU2 575 aa26.35■■□□□ 1.81
HOXB3-211ENST00000490677 CFAP36Q96G28 342 aa26.35■■□□□ 1.81
HOXB3-211ENST00000490677 OR4K3Q96R72 315 aa26.35■■□□□ 1.81
HOXB3-211ENST00000490677 LMF1Q96S06 567 aa26.35■■□□□ 1.81
HOXB3-211ENST00000490677 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa26.34■■□□□ 1.81
HOXB3-211ENST00000490677 FEZF1A0PJY2 475 aa26.34■■□□□ 1.81
HOXB3-211ENST00000490677 H0YIG0 161 aa26.34■■□□□ 1.81
HOXB3-211ENST00000490677 TTI1O43156 1089 aa26.34■■□□□ 1.81
HOXB3-211ENST00000490677 JRKO75564 520 aa26.34■■□□□ 1.81
HOXB3-211ENST00000490677 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP26.34■■□□□ 1.81
HOXB3-211ENST00000490677 NSA2O95478 260 aaKnown RBP26.34■■□□□ 1.81
HOXB3-211ENST00000490677 ANXA5P08758 320 aa26.34■■□□□ 1.81
HOXB3-211ENST00000490677 DR1Q01658 176 aa26.34■■□□□ 1.81
HOXB3-211ENST00000490677 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP26.34■■□□□ 1.81
HOXB3-211ENST00000490677 FAAH2Q6GMR7 532 aa26.34■■□□□ 1.81
HOXB3-211ENST00000490677 TMEM207Q6UWW9 146 aa26.34■■□□□ 1.81
HOXB3-211ENST00000490677 LINC00696Q6ZRV3 163 aa26.34■■□□□ 1.81
HOXB3-211ENST00000490677 KBTBD2Q8IY47 623 aa26.34■■□□□ 1.81
HOXB3-211ENST00000490677 OR56A3Q8NH54 315 aa26.34■■□□□ 1.81
HOXB3-211ENST00000490677 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP26.34■■□□□ 1.81
HOXB3-211ENST00000490677 DNAJB14Q8TBM8 379 aa26.34■■□□□ 1.81
HOXB3-211ENST00000490677 LRRC39Q96DD0 335 aa26.34■■□□□ 1.81
HOXB3-211ENST00000490677 THAP11Q96EK4 314 aa26.34■■□□□ 1.81
HOXB3-211ENST00000490677 PDLIM2Q96JY6 352 aa26.34■■□□□ 1.81
HOXB3-211ENST00000490677 YIPF2Q9BWQ6 316 aa26.34■■□□□ 1.81
HOXB3-211ENST00000490677 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa26.34■■□□□ 1.81
HOXB3-211ENST00000490677 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP26.34■■□□□ 1.81
HOXB3-211ENST00000490677 PSAT1Q9Y617 370 aa26.34■■□□□ 1.81
HOXB3-211ENST00000490677 UNC79Q9P2D8 2635 aa26.34■■□□□ 1.81
HOXB3-211ENST00000490677 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP26.33■■□□□ 1.81
HOXB3-211ENST00000490677 WIPF3A6NGB9 483 aa26.33■■□□□ 1.81
HOXB3-211ENST00000490677 CDH1P12830 882 aa26.33■■□□□ 1.81
HOXB3-211ENST00000490677 ITGA8P53708 1063 aa26.33■■□□□ 1.81
HOXB3-211ENST00000490677 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP26.33■■□□□ 1.81
HOXB3-211ENST00000490677 NDUFA9Q16795 377 aa26.33■■□□□ 1.81
HOXB3-211ENST00000490677 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa26.33■■□□□ 1.81
HOXB3-211ENST00000490677 SBSNQ6UWP8 590 aa26.33■■□□□ 1.81
HOXB3-211ENST00000490677 C17orf64Q86WR6 236 aa26.33■■□□□ 1.81
HOXB3-211ENST00000490677 PDSS2Q86YH6 399 aa26.33■■□□□ 1.81
HOXB3-211ENST00000490677 KCT2Q8NC54 265 aa26.33■■□□□ 1.81
HOXB3-211ENST00000490677 CATSPER1Q8NEC5 780 aa26.33■■□□□ 1.81
HOXB3-211ENST00000490677 ABHD11Q8NFV4 315 aa26.33■■□□□ 1.81
HOXB3-211ENST00000490677 OR4K1Q8NGD4 311 aa26.33■■□□□ 1.81
HOXB3-211ENST00000490677 SARGQ9BW04 601 aa26.33■■□□□ 1.81
HOXB3-211ENST00000490677 ZNF700Q9H0M5 742 aa26.33■■□□□ 1.81
HOXB3-211ENST00000490677 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP26.33■■□□□ 1.81
HOXB3-211ENST00000490677 VWA7Q9Y334 891 aa26.33■■□□□ 1.81
HOXB3-211ENST00000490677 E2F3O00716 465 aa26.32■■□□□ 1.8
HOXB3-211ENST00000490677 PCDH17O14917 1159 aa26.32■■□□□ 1.8
HOXB3-211ENST00000490677 SERPINA7P05543 415 aa26.32■■□□□ 1.8
HOXB3-211ENST00000490677 HEXBP07686 556 aa26.32■■□□□ 1.8
HOXB3-211ENST00000490677 CCND1P24385 295 aa26.32■■□□□ 1.8
HOXB3-211ENST00000490677 IL2P60568 153 aa26.32■■□□□ 1.8
HOXB3-211ENST00000490677 GNG11P61952 73 aa26.32■■□□□ 1.8
HOXB3-211ENST00000490677 CBLBQ13191 982 aa26.32■■□□□ 1.8
HOXB3-211ENST00000490677 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP26.32■■□□□ 1.8
HOXB3-211ENST00000490677 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP26.32■■□□□ 1.8
HOXB3-211ENST00000490677 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa26.32■■□□□ 1.8
HOXB3-211ENST00000490677 PRR7Q8TB68 274 aa26.32■■□□□ 1.8
HOXB3-211ENST00000490677 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP26.32■■□□□ 1.8
HOXB3-211ENST00000490677 PYCR2Q96C36 320 aa26.32■■□□□ 1.8
HOXB3-211ENST00000490677 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP26.32■■□□□ 1.8
HOXB3-211ENST00000490677 IMMP1LQ96LU5 166 aa26.32■■□□□ 1.8
HOXB3-211ENST00000490677 VN1R1Q9GZP7 353 aa26.32■■□□□ 1.8
HOXB3-211ENST00000490677 EPS8L2Q9H6S3 715 aa26.32■■□□□ 1.8
HOXB3-211ENST00000490677 MKL2Q9ULH7 1088 aa26.32■■□□□ 1.8
HOXB3-211ENST00000490677 PYCARDQ9ULZ3 195 aa26.32■■□□□ 1.8
HOXB3-211ENST00000490677 SAR1BQ9Y6B6 198 aa26.32■■□□□ 1.8
HOXB3-211ENST00000490677 E7ESA3 106 aa26.31■■□□□ 1.8
HOXB3-211ENST00000490677 IL1RNP18510 177 aa26.31■■□□□ 1.8
HOXB3-211ENST00000490677 AVPR1BP47901 424 aa26.31■■□□□ 1.8
HOXB3-211ENST00000490677 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP26.31■■□□□ 1.8
HOXB3-211ENST00000490677 FAM45BPQ6NSW5 357 aa26.31■■□□□ 1.8
HOXB3-211ENST00000490677 SLC26A11Q86WA9 606 aa26.31■■□□□ 1.8
HOXB3-211ENST00000490677 PALM2Q8IXS6 379 aa26.31■■□□□ 1.8
HOXB3-211ENST00000490677 GPATCH11Q8N954 259 aa26.31■■□□□ 1.8
HOXB3-211ENST00000490677 FAM45AQ8TCE6 357 aa26.31■■□□□ 1.8
HOXB3-211ENST00000490677 RUNDC3BQ96NL0 473 aa26.31■■□□□ 1.8
HOXB3-211ENST00000490677 MCMBPQ9BTE3 642 aa26.31■■□□□ 1.8
HOXB3-211ENST00000490677 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP26.31■■□□□ 1.8
HOXB3-211ENST00000490677 MOCS1Q9NZB8 636 aa26.31■■□□□ 1.8
HOXB3-211ENST00000490677 ANKUB1A6NFN9 424 aa26.3■■□□□ 1.8
HOXB3-211ENST00000490677 CXCR2P25025 360 aa26.3■■□□□ 1.8
HOXB3-211ENST00000490677 AP1S2P56377 157 aa26.3■■□□□ 1.8
HOXB3-211ENST00000490677 TLR1Q15399 786 aa26.3■■□□□ 1.8
HOXB3-211ENST00000490677 PPP1R3AQ16821 1122 aa26.3■■□□□ 1.8
HOXB3-211ENST00000490677 DUPD1Q68J44 220 aa26.3■■□□□ 1.8
HOXB3-211ENST00000490677 ANKMY2Q8IV38 441 aa26.3■■□□□ 1.8
HOXB3-211ENST00000490677 MFSD9Q8NBP5 474 aa26.3■■□□□ 1.8
HOXB3-211ENST00000490677 GRHL3Q8TE85 626 aa26.3■■□□□ 1.8
HOXB3-211ENST00000490677 FBXL8Q96CD0 374 aa26.3■■□□□ 1.8
HOXB3-211ENST00000490677 SNF8Q96H20 258 aa26.3■■□□□ 1.8
HOXB3-211ENST00000490677 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP26.3■■□□□ 1.8
HOXB3-211ENST00000490677 RIC8BQ9NVN3 520 aa26.3■■□□□ 1.8
HOXB3-211ENST00000490677 ARL15Q9NXU5 204 aa26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.5 ms