RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489741.1

PRPF40A-210, Transcript of pre-mRNA processing factor 40 homolog A, humanhuman

TSL 3

Gene PRPF40A, Length 776 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40A-210ENST00000489741 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa6.15□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 BBS12Q6ZW61 710 aa6.15□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 DAAM2Q86T65 1068 aa6.15□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 OOSP2Q86WS3 158 aa6.15□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 VSTM4Q8IW00 320 aa6.15□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 KATNAL2Q8IYT4 538 aa6.15□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 RCOR2Q8IZ40 523 aa6.15□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 ZBTB2Q8N680 514 aa6.15□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 Q8NA96 180 aa6.15□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 IPMKQ8NFU5 416 aa6.15□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 OR4K2Q8NGD2 314 aa6.15□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 OR1L3Q8NH93 324 aa6.15□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 CPT1CQ8TCG5 803 aa6.15□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa6.15□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 NAT14Q8WUY8 206 aa6.15□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 P3H4Q92791 437 aa6.15□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 RMDN2Q96LZ7 410 aa6.15□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 CCDC42Q96M95 316 aa6.15□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 C12orf66Q96MD2 445 aa6.15□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 CCM2Q9BSQ5 444 aa6.15□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 PITPNM3Q9BZ71 974 aa6.15□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 CHST8Q9H2A9 424 aa6.15□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 OR52A5Q9H2C5 316 aa6.15□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 ARNT2Q9HBZ2 717 aa6.15□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 SYTL2Q9HCH5 934 aa6.15□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 POMT2Q9UKY4 750 aa6.15□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 POLEQ07864 2286 aa6.15□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 CSMD1Q96PZ7 3565 aa6.14□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 MED13Q9UHV7 2174 aa6.14□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa6.14□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 ARGFXA6NJG6 315 aa6.14□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa6.14□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 C2orf81A6NN90 581 aa6.14□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa6.14□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 BTN3A3O00478 584 aa6.14□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 LDB2O43679 373 aa6.14□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 SPOPO43791 374 aa6.14□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 VPS4BO75351 444 aa6.14□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 ULK1O75385 1050 aa6.14□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 ANXA9O76027 345 aa6.14□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 LCA5LO95447 670 aa6.14□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 APOC2P02655 101 aa6.14□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 SLPIP03973 132 aa6.14□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 TPM3P06753 285 aa6.14□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 RBL1P28749 1068 aa6.14□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 GABRA4P48169 554 aa6.14□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 CD151P48509 253 aa6.14□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 PRLHRP49683 370 aa6.14□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 PGDP52209 483 aa6.14□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 VAV2P52735 878 aa6.14□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 GEMP55040 296 aa6.14□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 PDE1BQ01064 536 aa6.14□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 CHAF1BQ13112 559 aa6.14□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 KLF10Q13118 480 aa6.14□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 OLIG2Q13516 323 aa6.14□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 FAM214AQ32MH5 1076 aa6.14□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 CRB2Q5IJ48 1285 aa6.14□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 TMTC4Q5T4D3 741 aa6.14□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 FAM69BQ5VUD6 431 aa6.14□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 KAZNQ674X7 775 aa6.14□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 IGFL4Q6B9Z1 124 aa6.14□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa6.14□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 FAM198BQ6UWH4 519 aa6.14□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 MED25Q71SY5 747 aa6.14□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 DET1Q7L5Y6 550 aa6.14□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 HPS6Q86YV9 775 aa6.14□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 TMEM126BQ8IUX1 230 aa6.14□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 CFAP206Q8IYR0 622 aa6.14□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa6.14□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 ACVR1CQ8NER5 493 aa6.14□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 FDCSPQ8NFU4 85 aa6.14□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 OR4E2Q8NGC2 313 aa6.14□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 OR5M3Q8NGP4 307 aa6.14□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 OR13C4Q8NGS5 318 aa6.14□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 HM13Q8TCT9 377 aa6.14□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 CPT1BQ92523 772 aa6.14□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 KRT35Q92764 455 aa6.14□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 MR1Q95460 341 aa6.14□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa6.14□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 NRTNQ99748 197 aa6.14□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 SLC25A23Q9BV35 468 aa6.14□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 NUDT9Q9BW91 350 aa6.14□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa6.14□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 GBA3Q9H227 469 aa6.14□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 GOLPH3Q9H4A6 298 aa6.14□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.6 ms