RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487279.6

IFFO1-209, Transcript of intermediate filament family orphan 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene IFFO1, Length 2,786 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1-209ENST00000487279 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa15.94■□□□□ 0.14
IFFO1-209ENST00000487279 RTP3Q9BQQ7 232 aa15.94■□□□□ 0.14
IFFO1-209ENST00000487279 RNF121Q9H920 327 aa15.94■□□□□ 0.14
IFFO1-209ENST00000487279 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa15.94■□□□□ 0.14
IFFO1-209ENST00000487279 LEUTXA8MZ59 168 aa15.94■□□□□ 0.14
IFFO1-209ENST00000487279 LOC730098B7Z3J9 87 aa15.94■□□□□ 0.14
IFFO1-209ENST00000487279 TAPBPO15533 448 aa15.94■□□□□ 0.14
IFFO1-209ENST00000487279 KCNK5O95279 499 aa15.94■□□□□ 0.14
IFFO1-209ENST00000487279 NUDT7P0C024 238 aa15.94■□□□□ 0.14
IFFO1-209ENST00000487279 ENGP17813 658 aa15.94■□□□□ 0.14
IFFO1-209ENST00000487279 MC4RP32245 332 aa15.94■□□□□ 0.14
IFFO1-209ENST00000487279 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
IFFO1-209ENST00000487279 VMACQ2NL98 169 aa15.94■□□□□ 0.14
IFFO1-209ENST00000487279 XKR4Q5GH76 650 aa15.94■□□□□ 0.14
IFFO1-209ENST00000487279 TOR2AQ5JU69 321 aa15.94■□□□□ 0.14
IFFO1-209ENST00000487279 LRIF1Q5T3J3 769 aa15.94■□□□□ 0.14
IFFO1-209ENST00000487279 SBSNQ6UWP8 590 aa15.94■□□□□ 0.14
IFFO1-209ENST00000487279 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa15.94■□□□□ 0.14
IFFO1-209ENST00000487279 VWA5B2Q8N398 1253 aa15.94■□□□□ 0.14
IFFO1-209ENST00000487279 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa15.94■□□□□ 0.14
IFFO1-209ENST00000487279 ABCC13Q9NSE7 274 aa15.94■□□□□ 0.14
IFFO1-209ENST00000487279 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa15.94■□□□□ 0.14
IFFO1-209ENST00000487279 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
IFFO1-209ENST00000487279 IMPAD1Q9NX62 359 aa15.94■□□□□ 0.14
IFFO1-209ENST00000487279 PCDH10Q9P2E7 1040 aa15.94■□□□□ 0.14
IFFO1-209ENST00000487279 DUSP12Q9UNI6 340 aa15.94■□□□□ 0.14
IFFO1-209ENST00000487279 A0A1W2PQH9 124 aa15.93■□□□□ 0.14
IFFO1-209ENST00000487279 MOXD2PA6NHM9 499 aa15.93■□□□□ 0.14
IFFO1-209ENST00000487279 HMBSP08397 361 aa15.93■□□□□ 0.14
IFFO1-209ENST00000487279 CSF3P09919 207 aa15.93■□□□□ 0.14
IFFO1-209ENST00000487279 ERP29P30040 261 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
IFFO1-209ENST00000487279 KCNQ1P51787 676 aa15.93■□□□□ 0.14
IFFO1-209ENST00000487279 CASP9P55211 416 aa15.93■□□□□ 0.14
IFFO1-209ENST00000487279 ITGA1P56199 1179 aa15.93■□□□□ 0.14
IFFO1-209ENST00000487279 OLR1P78380 273 aa15.93■□□□□ 0.14
IFFO1-209ENST00000487279 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP15.93■□□□□ 0.14
IFFO1-209ENST00000487279 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP15.93■□□□□ 0.149e-7■■■■□ 22.8
IFFO1-209ENST00000487279 CYP27C1Q4G0S4 372 aa15.93■□□□□ 0.14
IFFO1-209ENST00000487279 AFTPHQ6ULP2 937 aa15.93■□□□□ 0.14
IFFO1-209ENST00000487279 ZNF621Q6ZSS3 439 aa15.93■□□□□ 0.14
IFFO1-209ENST00000487279 LPPQ93052 612 aa15.93■□□□□ 0.14
IFFO1-209ENST00000487279 MAL2Q969L2 176 aa15.93■□□□□ 0.14
IFFO1-209ENST00000487279 TADA1Q96BN2 335 aa15.93■□□□□ 0.14
IFFO1-209ENST00000487279 GABARAPL3Q9BY60 117 aa15.93■□□□□ 0.14
IFFO1-209ENST00000487279 ABCB9Q9NP78 766 aa15.93■□□□□ 0.14
IFFO1-209ENST00000487279 NUDT4Q9NZJ9 180 aa15.93■□□□□ 0.14
IFFO1-209ENST00000487279 SLC23A1Q9UHI7 598 aa15.93■□□□□ 0.14
IFFO1-209ENST00000487279 CLIC1O00299 241 aa15.93■□□□□ 0.14
IFFO1-209ENST00000487279 TRAPPC2P0DI81 140 aa15.93■□□□□ 0.14
IFFO1-209ENST00000487279 TRAPPC2BP0DI82 140 aa15.93■□□□□ 0.14
IFFO1-209ENST00000487279 GZMKP49863 264 aa15.93■□□□□ 0.14
IFFO1-209ENST00000487279 TATDN3Q17R31 274 aa15.93■□□□□ 0.14
IFFO1-209ENST00000487279 TEX26Q8N6G2 289 aa15.93■□□□□ 0.14
IFFO1-209ENST00000487279 SYT17Q9BSW7 474 aa15.93■□□□□ 0.14
IFFO1-209ENST00000487279 ZYG11BQ9C0D3 744 aa15.93■□□□□ 0.14
IFFO1-209ENST00000487279 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa15.93■□□□□ 0.14
IFFO1-209ENST00000487279 A0A075B6Q4 140 aa15.92■□□□□ 0.14
IFFO1-209ENST00000487279 OPN1SWP03999 348 aa15.92■□□□□ 0.14
IFFO1-209ENST00000487279 SEMG1P04279 462 aa15.92■□□□□ 0.14
IFFO1-209ENST00000487279 PSPHP78330 225 aa15.92■□□□□ 0.14
IFFO1-209ENST00000487279 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
IFFO1-209ENST00000487279 C5orf22Q49AR2 442 aa15.92■□□□□ 0.14
IFFO1-209ENST00000487279 TIGD5Q53EQ6 642 aa15.92■□□□□ 0.14
IFFO1-209ENST00000487279 IDO2Q6ZQW0 420 aa15.92■□□□□ 0.14
IFFO1-209ENST00000487279 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
IFFO1-209ENST00000487279 ZZZ3Q8IYH5 903 aa15.92■□□□□ 0.14
IFFO1-209ENST00000487279 ULK4Q96C45 1275 aa15.92■□□□□ 0.14
IFFO1-209ENST00000487279 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
IFFO1-209ENST00000487279 RAD9AQ99638 391 aa15.92■□□□□ 0.14
IFFO1-209ENST00000487279 TTLL2Q9BWV7 592 aa15.92■□□□□ 0.14
IFFO1-209ENST00000487279 FAM83DQ9H4H8 585 aa15.92■□□□□ 0.14
IFFO1-209ENST00000487279 C3orf14Q9HBI5 128 aa15.92■□□□□ 0.14
IFFO1-209ENST00000487279 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
IFFO1-209ENST00000487279 TBX18O95935 607 aa15.92■□□□□ 0.14
IFFO1-209ENST00000487279 MYCP01106 439 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
IFFO1-209ENST00000487279 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
IFFO1-209ENST00000487279 OR1E2P47887 323 aa15.92■□□□□ 0.14
IFFO1-209ENST00000487279 ESCO2Q56NI9 601 aa15.92■□□□□ 0.14
IFFO1-209ENST00000487279 MS4A13Q5J8X5 152 aa15.92■□□□□ 0.14
IFFO1-209ENST00000487279 PTOV1Q86YD1 416 aa15.92■□□□□ 0.14
IFFO1-209ENST00000487279 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP15.92■□□□□ 0.14
IFFO1-209ENST00000487279 RDH10Q8IZV5 341 aa15.92■□□□□ 0.14
IFFO1-209ENST00000487279 CDC26Q8NHZ8 85 aa15.92■□□□□ 0.14
IFFO1-209ENST00000487279 ENKURQ8TC29 256 aa15.92■□□□□ 0.14
IFFO1-209ENST00000487279 SPPL2AQ8TCT8 520 aa15.92■□□□□ 0.14
IFFO1-209ENST00000487279 PANX1Q96RD7 426 aa15.92■□□□□ 0.14
IFFO1-209ENST00000487279 RPS6KA6Q9UK32 745 aa15.92■□□□□ 0.14
IFFO1-209ENST00000487279 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
IFFO1-209ENST00000487279 PLK4O00444 970 aa15.92■□□□□ 0.14
IFFO1-209ENST00000487279 RAMP2O60895 175 aa15.92■□□□□ 0.14
IFFO1-209ENST00000487279 TNFRSF21O75509 655 aa15.92■□□□□ 0.14
IFFO1-209ENST00000487279 M6PRP20645 277 aa15.92■□□□□ 0.14
IFFO1-209ENST00000487279 RGRP47804 291 aa15.92■□□□□ 0.14
IFFO1-209ENST00000487279 IQCCQ4KMZ1 466 aa15.92■□□□□ 0.14
IFFO1-209ENST00000487279 PDZK1Q5T2W1 519 aa15.92■□□□□ 0.14
IFFO1-209ENST00000487279 SAXO2Q658L1 398 aa15.92■□□□□ 0.14
IFFO1-209ENST00000487279 TMC8Q8IU68 726 aa15.92■□□□□ 0.14
IFFO1-209ENST00000487279 OR9Q2Q8NGE9 314 aa15.92■□□□□ 0.14
IFFO1-209ENST00000487279 OR10T2Q8NGX3 314 aa15.92■□□□□ 0.14
IFFO1-209ENST00000487279 REPS1Q96D71 796 aa15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.9 ms