RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487269.1

FAM204A-208, Transcript of family with sequence similarity 204 member A, human

TSL 2

Gene FAM204A, Length 659 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM204A-208	ENST00000487269	ZBTB14	O43829	449 aa		11.27	□□□□□ -0.61
FAM204A-208	ENST00000487269	LCMT2	O60294	686 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.61
FAM204A-208	ENST00000487269	ZG16	O60844	167 aa		11.27	□□□□□ -0.61
FAM204A-208	ENST00000487269	SEC24D	O94855	1032 aa	Predicted RBP	11.27	□□□□□ -0.61
FAM204A-208	ENST00000487269	CCNDBP1	O95273	360 aa		11.27	□□□□□ -0.61
FAM204A-208	ENST00000487269	ENO3	P13929	434 aa	Predicted RBP	11.27	□□□□□ -0.61
FAM204A-208	ENST00000487269	IL1RN	P18510	177 aa		11.27	□□□□□ -0.61
FAM204A-208	ENST00000487269	CXCR2	P25025	360 aa		11.27	□□□□□ -0.61
FAM204A-208	ENST00000487269	BCL6	P41182	706 aa		11.27	□□□□□ -0.61
FAM204A-208	ENST00000487269	TDGF1P3	P51864	188 aa		11.27	□□□□□ -0.61
FAM204A-208	ENST00000487269	CDKN2D	P55273	166 aa		11.27	□□□□□ -0.61
FAM204A-208	ENST00000487269	CSNK1G2	P78368	415 aa		11.27	□□□□□ -0.61
FAM204A-208	ENST00000487269	RELA	Q04206	551 aa		11.27	□□□□□ -0.61
FAM204A-208	ENST00000487269	PHKG1	Q16816	387 aa		11.27	□□□□□ -0.61
FAM204A-208	ENST00000487269	RNASEH2B	Q5TBB1	312 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.61
FAM204A-208	ENST00000487269	ARMC3	Q5W041	872 aa		11.27	□□□□□ -0.61
FAM204A-208	ENST00000487269	FAM180A	Q6UWF9	173 aa		11.27	□□□□□ -0.61
FAM204A-208	ENST00000487269	KCT2	Q8NC54	265 aa		11.27	□□□□□ -0.61
FAM204A-208	ENST00000487269	ZCCHC10	Q8TBK6	192 aa		11.27	□□□□□ -0.61
FAM204A-208	ENST00000487269	EEF1AKMT1	Q8WVE0	214 aa		11.27	□□□□□ -0.61
FAM204A-208	ENST00000487269	ALKBH8	Q96BT7	664 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.61
FAM204A-208	ENST00000487269	ATG10	Q9H0Y0	220 aa		11.27	□□□□□ -0.61
FAM204A-208	ENST00000487269	OLAH	Q9NV23	265 aa		11.27	□□□□□ -0.61
FAM204A-208	ENST00000487269	HCN3	Q9P1Z3	774 aa		11.27	□□□□□ -0.61
FAM204A-208	ENST00000487269	PRPF4	O43172	522 aa	Known RBP eCLIP	11.26	□□□□□ -0.61
FAM204A-208	ENST00000487269	DNAJB6	O75190	326 aa		11.26	□□□□□ -0.61
FAM204A-208	ENST00000487269	WFS1	O76024	890 aa		11.26	□□□□□ -0.61
FAM204A-208	ENST00000487269	MST1	P26927	711 aa		11.26	□□□□□ -0.61
FAM204A-208	ENST00000487269	PMP22	Q01453	160 aa		11.26	□□□□□ -0.61
FAM204A-208	ENST00000487269	NAE1	Q13564	534 aa		11.26	□□□□□ -0.61
FAM204A-208	ENST00000487269	FAM53B	Q14153	422 aa		11.26	□□□□□ -0.61
FAM204A-208	ENST00000487269	CRYM	Q14894	314 aa		11.26	□□□□□ -0.61
FAM204A-208	ENST00000487269	C1QL3	Q5VWW1	255 aa		11.26	□□□□□ -0.61
FAM204A-208	ENST00000487269	FCRLB	Q6BAA4	426 aa		11.26	□□□□□ -0.61
FAM204A-208	ENST00000487269	HIBCH	Q6NVY1	386 aa	Predicted RBP	11.26	□□□□□ -0.61
FAM204A-208	ENST00000487269	RPUSD3	Q6P087	351 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
FAM204A-208	ENST00000487269	PAQR3	Q6TCH7	311 aa		11.26	□□□□□ -0.61
FAM204A-208	ENST00000487269	FJX1	Q86VR8	437 aa		11.26	□□□□□ -0.61
FAM204A-208	ENST00000487269	PDSS2	Q86YH6	399 aa		11.26	□□□□□ -0.61
FAM204A-208	ENST00000487269	BCORP1	Q8N888	145 aa		11.26	□□□□□ -0.61
FAM204A-208	ENST00000487269	SERBP1	Q8NC51	408 aa	Known RBP eCLIP	11.26	□□□□□ -0.61
FAM204A-208	ENST00000487269	C2CD4A	Q8NCU7	369 aa	Predicted RBP	11.26	□□□□□ -0.61
FAM204A-208	ENST00000487269	HAS2	Q92819	552 aa		11.26	□□□□□ -0.61
FAM204A-208	ENST00000487269	MOCOS	Q96EN8	888 aa		11.26	□□□□□ -0.61
FAM204A-208	ENST00000487269	PBK	Q96KB5	322 aa		11.26	□□□□□ -0.61
FAM204A-208	ENST00000487269	PWWP2A	Q96N64	755 aa		11.26	□□□□□ -0.61
FAM204A-208	ENST00000487269	RBCK1	Q9BYM8	510 aa		11.26	□□□□□ -0.61
FAM204A-208	ENST00000487269	CCDC177	Q9NQR7	707 aa	Predicted RBP	11.26	□□□□□ -0.61
FAM204A-208	ENST00000487269	TMEM184C	Q9NVA4	438 aa		11.26	□□□□□ -0.61
FAM204A-208	ENST00000487269	RIC8B	Q9NVN3	520 aa		11.26	□□□□□ -0.61
FAM204A-208	ENST00000487269	TRMT6	Q9UJA5	497 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
FAM204A-208	ENST00000487269	SCN3A	Q9NY46	2000 aa		11.26	□□□□□ -0.61
FAM204A-208	ENST00000487269	TRAV17	A0A0B4J275	112 aa		11.25	□□□□□ -0.61
FAM204A-208	ENST00000487269	DYTN	A2CJ06	578 aa		11.25	□□□□□ -0.61
FAM204A-208	ENST00000487269	CTAGE15	A4D2H0	777 aa		11.25	□□□□□ -0.61
FAM204A-208	ENST00000487269	ZNF860	A6NHJ4	632 aa		11.25	□□□□□ -0.61
FAM204A-208	ENST00000487269	PGRMC1	O00264	195 aa	Known RBP	11.25	□□□□□ -0.61
FAM204A-208	ENST00000487269	PCDH17	O14917	1159 aa		11.25	□□□□□ -0.61
FAM204A-208	ENST00000487269	NRDC	O43847	1150 aa		11.25	□□□□□ -0.61
FAM204A-208	ENST00000487269	MAN1A2	O60476	641 aa		11.25	□□□□□ -0.61
FAM204A-208	ENST00000487269	RDH16	O75452	317 aa		11.25	□□□□□ -0.61
FAM204A-208	ENST00000487269	NSA2	O95478	260 aa	Known RBP	11.25	□□□□□ -0.61
FAM204A-208	ENST00000487269	TSPAN12	O95859	305 aa		11.25	□□□□□ -0.61
FAM204A-208	ENST00000487269	B3GALT4	O96024	378 aa		11.25	□□□□□ -0.61
FAM204A-208	ENST00000487269	AHSG	P02765	367 aa		11.25	□□□□□ -0.61
FAM204A-208	ENST00000487269	STS	P08842	583 aa		11.25	□□□□□ -0.61
FAM204A-208	ENST00000487269	C8orf89	P0DMQ9	161 aa		11.25	□□□□□ -0.61
FAM204A-208	ENST00000487269	CDH1	P12830	882 aa		11.25	□□□□□ -0.61
FAM204A-208	ENST00000487269	FDXR	P22570	491 aa		11.25	□□□□□ -0.61
FAM204A-208	ENST00000487269	XCR1	P46094	333 aa		11.25	□□□□□ -0.61
FAM204A-208	ENST00000487269	AVPR1B	P47901	424 aa		11.25	□□□□□ -0.61
FAM204A-208	ENST00000487269	MEF2A	Q02078	507 aa	Predicted RBP	11.25	□□□□□ -0.61
FAM204A-208	ENST00000487269	DHX9	Q08211	1270 aa	Known RBP	11.25	□□□□□ -0.61
FAM204A-208	ENST00000487269	ZRSR2	Q15696	482 aa	Known RBP	11.25	□□□□□ -0.61
FAM204A-208	ENST00000487269	MINDY4	Q4G0A6	757 aa		11.25	□□□□□ -0.61
FAM204A-208	ENST00000487269	HP1BP3	Q5SSJ5	553 aa	Predicted RBP	11.25	□□□□□ -0.61
FAM204A-208	ENST00000487269	MFSD4B	Q5TF39	518 aa		11.25	□□□□□ -0.61
FAM204A-208	ENST00000487269	TMEM214	Q6NUQ4	689 aa	Known RBP	11.25	□□□□□ -0.61
FAM204A-208	ENST00000487269	MYO7B	Q6PIF6	2116 aa		11.25	□□□□□ -0.61
FAM204A-208	ENST00000487269	AGTRAP	Q6RW13	159 aa		11.25	□□□□□ -0.61
FAM204A-208	ENST00000487269	RIPOR1	Q6ZS17	1223 aa		11.25	□□□□□ -0.61
FAM204A-208	ENST00000487269	CTAGE6	Q86UF2	777 aa		11.25	□□□□□ -0.61
FAM204A-208	ENST00000487269	SLC26A11	Q86WA9	606 aa		11.25	□□□□□ -0.61
FAM204A-208	ENST00000487269	PPIL6	Q8IXY8	311 aa		11.25	□□□□□ -0.61
FAM204A-208	ENST00000487269	SLC35F6	Q8N357	371 aa		11.25	□□□□□ -0.61
FAM204A-208	ENST00000487269	OR5T3	Q8NGG3	340 aa		11.25	□□□□□ -0.61
FAM204A-208	ENST00000487269	OR51Q1	Q8NH59	317 aa		11.25	□□□□□ -0.61
FAM204A-208	ENST00000487269	CALML6	Q8TD86	181 aa		11.25	□□□□□ -0.61
FAM204A-208	ENST00000487269	NR4A3	Q92570	626 aa		11.25	□□□□□ -0.61
FAM204A-208	ENST00000487269	PYCR2	Q96C36	320 aa		11.25	□□□□□ -0.61
FAM204A-208	ENST00000487269	TM4SF19	Q96DZ7	209 aa		11.25	□□□□□ -0.61
FAM204A-208	ENST00000487269	OSBPL9	Q96SU4	736 aa		11.25	□□□□□ -0.61
FAM204A-208	ENST00000487269	CYTH2	Q99418	400 aa		11.25	□□□□□ -0.61
FAM204A-208	ENST00000487269	NPAS2	Q99743	824 aa		11.25	□□□□□ -0.61
FAM204A-208	ENST00000487269	EBNA1BP2	Q99848	306 aa	Known RBP	11.25	□□□□□ -0.61
FAM204A-208	ENST00000487269	WDR83	Q9BRX9	315 aa	Known RBP	11.25	□□□□□ -0.61
FAM204A-208	ENST00000487269	FAM167B	Q9BTA0	163 aa		11.25	□□□□□ -0.61
FAM204A-208	ENST00000487269	CSTF2T	Q9H0L4	616 aa	Known RBP eCLIP	11.25	□□□□□ -0.61
FAM204A-208	ENST00000487269	UTP6	Q9NYH9	597 aa	Known RBP	11.25	□□□□□ -0.61
FAM204A-208	ENST00000487269	IKZF3	Q9UKT9	509 aa		11.25	□□□□□ -0.61

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38 ms