RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485532.1

PRAME-212, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 709 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-212ENST00000485532 PYROXD1Q8WU10 500 aa12.01□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 CFAP36Q96G28 342 aa12.01□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 EPS8L2Q9H6S3 715 aa12.01□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP12.01□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa12.01□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 PLA2G3Q9NZ20 509 aa12.01□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 PTGFRNQ9P2B2 879 aa12.01□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 TRPC4Q9UBN4 977 aa12.01□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 TAC3Q9UHF0 121 aa12.01□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 OSGIN2Q9Y236 505 aa12.01□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP12.01□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa12□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP12□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa12□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 IDSB3KWA1 339 aa12□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 E5RI56 91 aa12□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 I3L1I5 382 aaPredicted RBP12□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 HAT1O14929 419 aa12□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 LRRTM2O43300 516 aa12□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 SLC16A8O95907 504 aa12□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 SYF2O95926 243 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 PGAM1P18669 254 aa12□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 ATP5DP30049 168 aa12□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 HSD17B3P37058 310 aa12□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 TSFMP43897 325 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 CLCN7P51798 805 aa12□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 PNLIPRP1P54315 467 aa12□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 EMP2P54851 167 aa12□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 MFAP5Q13361 173 aa12□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 CTBP1Q13363 440 aa12□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP12□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 ARMC3Q5W041 872 aa12□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 ZNF470Q6ECI4 717 aa12□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 NEPROQ6NW34 567 aa12□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 PRMT9Q6P2P2 845 aa12□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 CSNK1A1LQ8N752 337 aa12□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 MAGEC3Q8TD91 643 aa12□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 ZNF480Q8WV37 535 aa12□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 FAR1Q8WVX9 515 aa12□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 SMPDL3AQ92484 453 aa12□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 PSMF1Q92530 271 aa12□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP12□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 OR2A5Q96R48 311 aa12□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 TCF12Q99081 682 aa12□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 NAT9Q9BTE0 207 aa12□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 SAMD15Q9P1V8 674 aa12□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 MED16Q9Y2X0 877 aa12□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa12□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 SCN3AQ9NY46 2000 aa11.99□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa11.99□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 MAGEB16A2A368 324 aa11.99□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 H3BMM5 538 aa11.99□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 RIPK2O43353 540 aa11.99□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 FOXS1O43638 330 aa11.99□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 USP1O94782 785 aa11.99□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 ACSL3O95573 720 aa11.99□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 PRR35P0CG20 571 aa11.99□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 OGNP20774 298 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 SSTR1P30872 391 aa11.99□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 ADARP55265 1226 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 CRYMQ14894 314 aa11.99□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 TLR1Q15399 786 aa11.99□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 ICE2Q659A1 982 aa11.99□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 ZNF425Q6IV72 752 aa11.99□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 CAPN12Q6ZSI9 719 aa11.99□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 KBTBD2Q8IY47 623 aa11.99□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 OR1N1Q8NGS0 311 aa11.99□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 MYO9AB2RTY4 2548 aa11.99□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa11.98□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa11.98□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 E7ENX8 843 aa11.98□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 VPS26AO75436 327 aa11.98□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 JRKO75564 520 aa11.98□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 CATP04040 527 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 HEXBP07686 556 aa11.98□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 ABHD2P08910 425 aa11.98□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 GSTA2P09210 222 aa11.98□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 ITGAMP11215 1152 aa11.98□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 SOX11P35716 441 aa11.98□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 SLC26A3P40879 764 aa11.98□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 SLC1A2P43004 574 aa11.98□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 ARG2P78540 354 aa11.98□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 TAP2Q03519 686 aa11.98□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 DSG2Q14126 1118 aa11.98□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 SPANXN3Q5MJ09 141 aa11.98□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 CYHR1Q6ZMK1 362 aa11.98□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 NDUFAF7Q7L592 441 aa11.98□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 PRSS41Q7RTY9 318 aa11.98□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 ADCK2Q7Z695 626 aa11.98□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 PALM2Q8IXS6 379 aa11.98□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP11.98□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP11.98□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 ASB11Q8WXH4 323 aa11.98□□□□□ -0.49
PRAME-212ENST00000485532 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.1 ms