RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481211.1

NISCH-208, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 557 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-208ENST00000481211 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP12.49□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 CCDC74BQ96LY2 380 aa12.49□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP12.49□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 CDK15Q96Q40 435 aa12.49□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 DEPDC7Q96QD5 511 aa12.49□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 NLNQ9BYT8 704 aa12.49□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 C20orf27Q9GZN8 174 aa12.49□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 ACSS2Q9NR19 701 aa12.49□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP12.49□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 PLCL2Q9UPR0 1127 aa12.49□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa12.49□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 RP1P56715 2156 aa12.48□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 A0A1B0GTL3 188 aa12.48□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 URADA6NGE7 173 aa12.48□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 SLC28A1O00337 649 aa12.48□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 MANBAO00462 879 aa12.48□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 HAT1O14929 419 aa12.48□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 HDAC3O15379 428 aa12.48□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP12.48□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 OR1F1O43749 312 aa12.48□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP12.48□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 VPS4BO75351 444 aa12.48□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 SLC35G6P0C7Q6 338 aa12.48□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 FTH1P19P0C7X4 201 aa12.48□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP12.48□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 PVRP15151 417 aa12.48□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 MPSTP25325 297 aa12.48□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP12.48□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 CCR10P46092 362 aa12.48□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 EMP3P54852 163 aa12.48□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 YBX1P67809 324 aaKnown RBP12.48□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP12.48□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 RGS1Q08116 209 aa12.48□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP12.48□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 ZIC1Q15915 447 aa12.48□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 FBXO42Q6P3S6 717 aa12.48□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 FAM47EQ6ZV65 393 aa12.48□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 TRIM46Q7Z4K8 759 aa12.48□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa12.48□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 AGBL5Q8NDL9 886 aa12.48□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP12.48□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 TWIST2Q8WVJ9 160 aa12.48□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 SELENOMQ8WWX9 145 aa12.48□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 CCT6BQ92526 530 aa12.48□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 CMTM7Q96FZ5 175 aa12.48□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP12.48□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 ZNF285Q96NJ3 590 aa12.48□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 OR2A5Q96R48 311 aa12.48□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 CENPKQ9BS16 269 aa12.48□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 TRIM55Q9BYV6 548 aa12.48□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa12.48□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 TMEM9Q9P0T7 183 aa12.48□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 KLHL3Q9UH77 587 aa12.48□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa12.48□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP12.48□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa12.48□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 FAM186AA6NE01 2351 aa12.48□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 ASXL3Q9C0F0 2248 aa12.47□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 GMNCA6NCL1 334 aa12.47□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 NPIPB8E9PQR5 432 aa12.47□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 CTSVO60911 334 aa12.47□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 SERPINA6P08185 405 aa12.47□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 PCNAP12004 261 aa12.47□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP12.47□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 PCSK2P16519 638 aa12.47□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 PRPH2P23942 346 aa12.47□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP12.47□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP12.47□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 GYS2P54840 703 aa12.47□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP12.47□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP12.47□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 TGM3Q08188 693 aa12.47□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 CUL3Q13618 768 aa12.47□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 UGT3A2Q3SY77 523 aa12.47□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 TMEM35AQ53FP2 167 aa12.47□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 SNAP47Q5SQN1 464 aa12.47□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 PHF19Q5T6S3 580 aa12.47□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP12.47□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 CLEC6AQ6EIG7 209 aa12.47□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 NIPAL1Q6NVV3 410 aa12.47□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 CHSY3Q70JA7 882 aa12.47□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa12.47□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 ASPGQ86U10 573 aa12.47□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP12.47□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 FAM20CQ8IXL6 584 aa12.47□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP12.47□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 HUS1BQ8NHY5 278 aa12.47□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 NT5CQ8TCD5 201 aa12.47□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP12.47□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP12.47□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 PPM1MQ96MI6 270 aa12.47□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 SERPINI1Q99574 410 aa12.47□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 CMKLR1Q99788 373 aa12.47□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa12.47□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 SPNS1Q9H2V7 528 aa12.47□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP12.47□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 DMRT3Q9NQL9 472 aa12.47□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 RIC8BQ9NVN3 520 aa12.47□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP12.46□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 A0A0J9YVX5 310 aa12.46□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.6 ms