RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478080.5

CDHR3-211, Transcript of cadherin related family member 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene CDHR3, Length 2,633 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDHR3-211ENST00000478080 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
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CDHR3-211ENST00000478080 MYO1DO94832 1006 aa8.55□□□□□ -1.04
CDHR3-211ENST00000478080 THRBP10828 461 aa8.55□□□□□ -1.04
CDHR3-211ENST00000478080 AQP1P29972 269 aa8.55□□□□□ -1.04
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CDHR3-211ENST00000478080 FAM9CQ8IZT9 166 aa8.55□□□□□ -1.04
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CDHR3-211ENST00000478080 DNAJB8Q8NHS0 232 aa8.55□□□□□ -1.04
CDHR3-211ENST00000478080 HM13Q8TCT9 377 aa8.55□□□□□ -1.04
CDHR3-211ENST00000478080 PPP1R16AQ96I34 528 aa8.55□□□□□ -1.04
CDHR3-211ENST00000478080 MBOAT4Q96T53 435 aa8.55□□□□□ -1.04
CDHR3-211ENST00000478080 KXD1Q9BQD3 176 aa8.55□□□□□ -1.04
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CDHR3-211ENST00000478080 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
CDHR3-211ENST00000478080 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa8.55□□□□□ -1.04
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CDHR3-211ENST00000478080 COL4A3Q01955 1670 aa8.54□□□□□ -1.04
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CDHR3-211ENST00000478080 PRR23AA6NEV1 266 aa8.54□□□□□ -1.04
CDHR3-211ENST00000478080 MGAT4DA6NG13 374 aa8.54□□□□□ -1.04
CDHR3-211ENST00000478080 LATO43561 262 aa8.54□□□□□ -1.04
CDHR3-211ENST00000478080 HS6ST1O60243 411 aa8.54□□□□□ -1.04
CDHR3-211ENST00000478080 MITFO75030 526 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
CDHR3-211ENST00000478080 E2F6O75461 281 aa8.54□□□□□ -1.04
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CDHR3-211ENST00000478080 EPN2O95208 641 aa8.54□□□□□ -1.04
CDHR3-211ENST00000478080 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa8.54□□□□□ -1.04
CDHR3-211ENST00000478080 C7P10643 843 aa8.54□□□□□ -1.04
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CDHR3-211ENST00000478080 DRD3P35462 400 aa8.54□□□□□ -1.04
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CDHR3-211ENST00000478080 PNLIPRP1P54315 467 aa8.54□□□□□ -1.04
CDHR3-211ENST00000478080 TAS2R38P59533 333 aa8.54□□□□□ -1.04
CDHR3-211ENST00000478080 CTBSQ01459 385 aa8.54□□□□□ -1.04
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CDHR3-211ENST00000478080 SHHQ15465 462 aa8.54□□□□□ -1.04
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CDHR3-211ENST00000478080 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
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CDHR3-211ENST00000478080 OR2L2Q8NH16 312 aa8.54□□□□□ -1.04
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CDHR3-211ENST00000478080 SGPP1Q9BX95 441 aa8.54□□□□□ -1.04
CDHR3-211ENST00000478080 OSBPL10Q9BXB5 764 aa8.54□□□□□ -1.04
CDHR3-211ENST00000478080 OR52A5Q9H2C5 316 aa8.54□□□□□ -1.04
CDHR3-211ENST00000478080 SFXN1Q9H9B4 322 aa8.54□□□□□ -1.04
CDHR3-211ENST00000478080 TPT1P8Q9HAU6 139 aa8.54□□□□□ -1.04
CDHR3-211ENST00000478080 BRF2Q9HAW0 419 aa8.54□□□□□ -1.04
CDHR3-211ENST00000478080 CD320Q9NPF0 282 aa8.54□□□□□ -1.04
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CDHR3-211ENST00000478080 DYRK1BQ9Y463 629 aa8.54□□□□□ -1.04
CDHR3-211ENST00000478080 OR1A2Q9Y585 309 aa8.54□□□□□ -1.04
CDHR3-211ENST00000478080 TRPM6Q9BX84 2022 aa8.54□□□□□ -1.04
CDHR3-211ENST00000478080 SCAMP1O15126 338 aa8.54□□□□□ -1.04
CDHR3-211ENST00000478080 KAT7O95251 611 aa8.54□□□□□ -1.04
CDHR3-211ENST00000478080 IL7RP16871 459 aa8.54□□□□□ -1.04
CDHR3-211ENST00000478080 GPX2P18283 190 aa8.54□□□□□ -1.04
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CDHR3-211ENST00000478080 TRPC1P48995 793 aa8.54□□□□□ -1.04
CDHR3-211ENST00000478080 SEC13P55735 322 aa8.54□□□□□ -1.04
CDHR3-211ENST00000478080 ERVK-21P61565 698 aa8.54□□□□□ -1.04
CDHR3-211ENST00000478080 PPP2R2BQ00005 443 aa8.54□□□□□ -1.04
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CDHR3-211ENST00000478080 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
CDHR3-211ENST00000478080 WSCD2Q2TBF2 565 aa8.54□□□□□ -1.04
CDHR3-211ENST00000478080 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP8.54□□□□□ -1.04
CDHR3-211ENST00000478080 PNCKQ6P2M8 343 aa8.54□□□□□ -1.04
CDHR3-211ENST00000478080 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa8.54□□□□□ -1.04
CDHR3-211ENST00000478080 ZNF765Q7L2R6 523 aa8.54□□□□□ -1.04
CDHR3-211ENST00000478080 COMMD6Q7Z4G1 85 aa8.54□□□□□ -1.04
CDHR3-211ENST00000478080 GALNT5Q7Z7M9 940 aa8.54□□□□□ -1.04
CDHR3-211ENST00000478080 SERPINA11Q86U17 422 aa8.54□□□□□ -1.04
CDHR3-211ENST00000478080 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa8.54□□□□□ -1.04
CDHR3-211ENST00000478080 OR52E4Q8NGH9 312 aa8.54□□□□□ -1.04
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