RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466636.1

SRPRB-202, Transcript of SRP receptor subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene SRPRB, Length 917 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRB-202ENST00000466636 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP9.16□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa9.16□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 FAM9CQ8IZT9 166 aa9.16□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 MINDY1Q8N5J2 469 aa9.16□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa9.16□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP9.16□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 ANKRD53Q8N9V6 530 aa9.16□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 OR2L3Q8NG85 312 aa9.16□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 CLHC1Q8NHS4 586 aa9.16□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa9.16□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 ZFPM2Q8WW38 1151 aa9.16□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 LCN9Q8WX39 176 aa9.16□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 DNASE2BQ8WZ79 361 aa9.16□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 PRAP1Q96NZ9 151 aa9.16□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 TSSK3Q96PN8 268 aa9.16□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 SERPINI1Q99574 410 aa9.16□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 LRRC61Q9BV99 259 aa9.16□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 EBPLQ9BY08 206 aa9.16□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP9.16□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 RASSF4Q9H2L5 321 aa9.16□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 POT1Q9NUX5 634 aa9.16□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 OR6C2Q9NZP2 312 aa9.16□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 TMEM181Q9P2C4 612 aa9.16□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP9.16□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 ADGRE2Q9UHX3 823 aa9.16□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 PACSIN3Q9UKS6 424 aa9.16□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa9.16□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa9.15□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa9.15□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 TRBC2A0A5B9 178 aa9.15□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 OR5K4A6NMS3 321 aa9.15□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 TRIM38O00635 465 aa9.15□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 PRMT3O60678 531 aa9.15□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 MYO1DO94832 1006 aa9.15□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 CCNDBP1O95273 360 aa9.15□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 TGFB1P01137 390 aa9.15□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 IL6P05231 212 aa9.15□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 CTSEP14091 401 aa9.15□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 JUNDP17535 347 aa9.15□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 SLC7A2P52569 658 aa9.15□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 NXPH1P58417 271 aa9.15□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 SIGLEC14Q08ET2 396 aa9.15□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 C1orf61Q13536 156 aa9.15□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 NFYCQ13952 458 aa9.15□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 GPR18Q14330 331 aa9.15□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 NUMA1Q14980 2115 aa9.15□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 SF1Q15637 639 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa9.15□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 SPANXN4Q5MJ08 99 aa9.15□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 C1orf146Q5VVC0 180 aa9.15□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 ZNF425Q6IV72 752 aa9.15□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 PRMT9Q6P2P2 845 aa9.15□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 TAF8Q7Z7C8 310 aa9.15□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 SFTPA2Q8IWL1 248 aa9.15□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 FAM20CQ8IXL6 584 aa9.15□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 TMEFF1Q8IYR6 380 aa9.15□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 NAGSQ8N159 534 aa9.15□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 METTL4Q8N3J2 472 aa9.15□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 FBXL6Q8N531 539 aa9.15□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 GPR156Q8NFN8 814 aa9.15□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 OR4E2Q8NGC2 313 aa9.15□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 SLC13A3Q8WWT9 602 aa9.15□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 PATE1Q8WXA2 126 aa9.15□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 TESCQ96BS2 214 aa9.15□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 LRRC58Q96CX6 371 aa9.15□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 EGLN2Q96KS0 407 aa9.15□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP9.15□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 SLC39A3Q9BRY0 314 aa9.15□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 MS4A8Q9BY19 250 aa9.15□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 OR51B5Q9H339 312 aa9.15□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 SRMSQ9H3Y6 488 aa9.15□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 SPAG4Q9NPE6 437 aa9.15□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP9.15□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 TMEM184CQ9NVA4 438 aa9.15□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 GID8Q9NWU2 228 aa9.15□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 NMRK1Q9NWW6 199 aa9.15□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 CMTM6Q9NX76 183 aa9.15□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 ABCD2Q9UBJ2 740 aa9.15□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 CPNE7Q9UBL6 633 aa9.15□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 CD300AQ9UGN4 299 aa9.15□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 POMPQ9Y244 141 aa9.15□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa9.15□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 UNC80Q8N2C7 3258 aa9.14□□□□□ -0.95
SRPRB-202ENST00000466636 FEZF1A0PJY2 475 aa9.14□□□□□ -0.95
SRPRB-202ENST00000466636 FAM221BA6H8Z2 402 aa9.14□□□□□ -0.95
SRPRB-202ENST00000466636 PRORSD1PA6NEY8 169 aa9.14□□□□□ -0.95
SRPRB-202ENST00000466636 NME4O00746 187 aa9.14□□□□□ -0.95
SRPRB-202ENST00000466636 VILLO15195 856 aa9.14□□□□□ -0.95
SRPRB-202ENST00000466636 PCDH7O60245 1069 aa9.14□□□□□ -0.95
SRPRB-202ENST00000466636 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
SRPRB-202ENST00000466636 SH3BGRLO75368 114 aa9.14□□□□□ -0.95
SRPRB-202ENST00000466636 KLHL18O94889 574 aa9.14□□□□□ -0.95
SRPRB-202ENST00000466636 SEMA3DO95025 777 aa9.14□□□□□ -0.95
SRPRB-202ENST00000466636 NPPAP01160 153 aa9.14□□□□□ -0.95
SRPRB-202ENST00000466636 VIPP01282 170 aa9.14□□□□□ -0.95
SRPRB-202ENST00000466636 PGRP06401 933 aa9.14□□□□□ -0.95
SRPRB-202ENST00000466636 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.4 ms