RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459758.5

TTLL3-222, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 4

Gene TTLL3, Length 555 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-222	ENST00000459758	TBX19	O60806	448 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TTLL3-222	ENST00000459758	SNAP29	O95721	258 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TTLL3-222	ENST00000459758	CCDC159	P0C7I6	412 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TTLL3-222	ENST00000459758	JUNB	P17275	347 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
TTLL3-222	ENST00000459758	PTPN6	P29350	595 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TTLL3-222	ENST00000459758	PBLD	P30039	288 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
TTLL3-222	ENST00000459758	KDELR2	P33947	212 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TTLL3-222	ENST00000459758	BDKRB1	P46663	353 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TTLL3-222	ENST00000459758	PREP	P48147	710 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TTLL3-222	ENST00000459758	ARFIP1	P53367	373 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TTLL3-222	ENST00000459758	CXCR4	P61073	352 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TTLL3-222	ENST00000459758	NTHL1	P78549	312 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TTLL3-222	ENST00000459758	DDX39B	Q13838	428 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
TTLL3-222	ENST00000459758	KEAP1	Q14145	624 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TTLL3-222	ENST00000459758	ZNF234	Q14588	700 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TTLL3-222	ENST00000459758	DUSP6	Q16828	381 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TTLL3-222	ENST00000459758	UGT8	Q16880	541 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TTLL3-222	ENST00000459758	ZNF658B	Q4V348	819 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
TTLL3-222	ENST00000459758	PRAMEF14	Q5SWL7	426 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TTLL3-222	ENST00000459758	THEMIS2	Q5TEJ8	643 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TTLL3-222	ENST00000459758	PRAMEF13	Q5VWM6	474 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TTLL3-222	ENST00000459758	TMEM214	Q6NUQ4	689 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
TTLL3-222	ENST00000459758	ZCCHC8	Q6NZY4	707 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
TTLL3-222	ENST00000459758	FAM92B	Q6ZTR7	304 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TTLL3-222	ENST00000459758	CROCCP3	Q8IVE0	287 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TTLL3-222	ENST00000459758	C1orf52	Q8N6N3	182 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
TTLL3-222	ENST00000459758	CLHC1	Q8NHS4	586 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TTLL3-222	ENST00000459758	ZNF480	Q8WV37	535 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TTLL3-222	ENST00000459758	SORCS1	Q8WY21	1168 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TTLL3-222	ENST00000459758	ARRDC3	Q96B67	414 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TTLL3-222	ENST00000459758	PPCDC	Q96CD2	204 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TTLL3-222	ENST00000459758	NMD3	Q96D46	503 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
TTLL3-222	ENST00000459758	COX14	Q96I36	57 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TTLL3-222	ENST00000459758	MPP4	Q96JB8	637 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TTLL3-222	ENST00000459758	MTERF1	Q99551	399 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
TTLL3-222	ENST00000459758	TRIT1	Q9H3H1	467 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
TTLL3-222	ENST00000459758	REEP1	Q9H902	201 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TTLL3-222	ENST00000459758	TPT1P8	Q9HAU6	139 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TTLL3-222	ENST00000459758	NTN4	Q9HB63	628 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TTLL3-222	ENST00000459758	GMPR2	Q9P2T1	348 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
TTLL3-222	ENST00000459758	CEPT1	Q9Y6K0	416 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TTLL3-222	ENST00000459758	CENPF	P49454	3210 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TTLL3-222	ENST00000459758	PIPSL	A2A3N6	862 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TTLL3-222	ENST00000459758	ANKDD1B	A6NHY2	528 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TTLL3-222	ENST00000459758	HEPACAM2	A8MVW5	462 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TTLL3-222	ENST00000459758	UPK1A	O00322	258 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TTLL3-222	ENST00000459758	SUV39H1	O43463	412 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TTLL3-222	ENST00000459758	LILRB5	O75023	590 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TTLL3-222	ENST00000459758	ABCB7	O75027	752 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TTLL3-222	ENST00000459758	POP7	O75817	140 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
TTLL3-222	ENST00000459758	CPSF4	O95639	269 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
TTLL3-222	ENST00000459758	NPPB	P16860	134 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TTLL3-222	ENST00000459758	C5AR1	P21730	350 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TTLL3-222	ENST00000459758	EEF1B2	P24534	225 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
TTLL3-222	ENST00000459758	ANXA11	P50995	505 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
TTLL3-222	ENST00000459758	TMBIM6	P55061	237 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TTLL3-222	ENST00000459758	TRA2B	P62995	288 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
TTLL3-222	ENST00000459758	PLIN5	Q00G26	463 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TTLL3-222	ENST00000459758	RUNX3	Q13761	415 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TTLL3-222	ENST00000459758	STARD3	Q14849	445 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TTLL3-222	ENST00000459758	ZNF630	Q2M218	657 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
TTLL3-222	ENST00000459758	FAM78A	Q5JUQ0	283 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TTLL3-222	ENST00000459758	CES5A	Q6NT32	575 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TTLL3-222	ENST00000459758	SPESP1	Q6UW49	350 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TTLL3-222	ENST00000459758	TMIGD1	Q6UXZ0	262 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TTLL3-222	ENST00000459758	EP400NL	Q6ZTU2	488 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TTLL3-222	ENST00000459758	C17orf64	Q86WR6	236 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TTLL3-222	ENST00000459758	METTL4	Q8N3J2	472 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TTLL3-222	ENST00000459758	SYNPO	Q8N3V7	929 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TTLL3-222	ENST00000459758	METTL25	Q8N6Q8	603 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TTLL3-222	ENST00000459758	OR4A15	Q8NGL6	344 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TTLL3-222	ENST00000459758	SMPDL3A	Q92484	453 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TTLL3-222	ENST00000459758	NEIL2	Q969S2	332 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TTLL3-222	ENST00000459758	ZNF566	Q969W8	418 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TTLL3-222	ENST00000459758	EPYC	Q99645	322 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TTLL3-222	ENST00000459758	TRIM8	Q9BZR9	551 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TTLL3-222	ENST00000459758	TMEM38A	Q9H6F2	299 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TTLL3-222	ENST00000459758	SLC24A3	Q9HC58	644 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TTLL3-222	ENST00000459758	DMRT3	Q9NQL9	472 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TTLL3-222	ENST00000459758	PHPT1	Q9NRX4	125 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
TTLL3-222	ENST00000459758	FAM118A	Q9NWS6	357 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TTLL3-222	ENST00000459758	ZSCAN32	Q9NX65	697 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TTLL3-222	ENST00000459758	SCN3B	Q9NY72	215 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TTLL3-222	ENST00000459758	KIF17	Q9P2E2	1029 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TTLL3-222	ENST00000459758	ATXN10	Q9UBB4	475 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TTLL3-222	ENST00000459758	ADAM29	Q9UKF5	820 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TTLL3-222	ENST00000459758	SCML1	Q9UN30	329 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TTLL3-222	ENST00000459758	FAF1	Q9UNN5	650 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
TTLL3-222	ENST00000459758	ASF1A	Q9Y294	204 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TTLL3-222	ENST00000459758	TPRKB	Q9Y3C4	175 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TTLL3-222	ENST00000459758		V9GYQ6	96 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TTLL3-222	ENST00000459758	NUP214	P35658	2090 aa	Predicted RBP	11.08	□□□□□ -0.63
TTLL3-222	ENST00000459758	KIAA0100	Q14667	2235 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.64
TTLL3-222	ENST00000459758	LOC100130705	A0A1B0GUX0	176 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TTLL3-222	ENST00000459758	TMEM247	A6NEH6	219 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TTLL3-222	ENST00000459758	CACNB4	O00305	520 aa	Predicted RBP	11.08	□□□□□ -0.64
TTLL3-222	ENST00000459758	NRG2	O14511	850 aa	Predicted RBP	11.08	□□□□□ -0.64
TTLL3-222	ENST00000459758	HS6ST1	O60243	411 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TTLL3-222	ENST00000459758	GPR37L1	O60883	481 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TTLL3-222	ENST00000459758	SCN2B	O60939	215 aa		11.08	□□□□□ -0.64

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.5 ms