RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459159.1

SNORD54-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 54, humanhuman

BASIC

Gene SNORD54, Length 67 nt, Biotype snoRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD54-201ENST00000459159 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa-2.14□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 MYO5BQ9ULV0 1848 aa-2.14□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP-2.15□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 GBF1Q92538 1859 aa-2.15□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 DEPDC5O75140 1603 aa-2.15□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP-2.15□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 NPIPB5A8MRT5 1133 aa-2.15□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 ZBBXA8MT70 800 aa-2.15□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 FADS2P1A8MWK0 482 aa-2.15□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP-2.15□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 NPIPB4C9JG80 1138 aa-2.15□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 hCG_1984214I3L0E3 225 aa-2.15□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 K7ESM1 405 aa-2.15□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 M0R3E3 92 aa-2.15□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 MANBAO00462 879 aa-2.15□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 PSMA7O14818 248 aa-2.15□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 AREL1O15033 823 aa-2.15□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 FANCGO15287 622 aa-2.15□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP-2.15□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP-2.15□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 OPHN1O60890 802 aa-2.15□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 SIN3BO75182 1162 aa-2.15□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 ENTPD6O75354 484 aa-2.15□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 LARGE1O95461 756 aa-2.15□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 NAPSAO96009 420 aa-2.15□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 IFNA21P01568 189 aa-2.15□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 IFNA17P01571 189 aa-2.15□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 IGLV3-25P01717 112 aa-2.15□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP-2.15□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP-2.15□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 HCKP08631 526 aa-2.15□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP-2.15□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP-2.15□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 GLB1P16278 677 aa-2.15□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 IGFBP2P18065 325 aa-2.15□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 CYP2A7P20853 494 aa-2.15□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 FUT3P21217 361 aa-2.15□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 BCKDHBP21953 392 aa-2.15□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 LMO2P25791 158 aa-2.15□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 HOXA6P31267 233 aa-2.15□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 MCM4P33991 863 aa-2.15□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 SLC16A2P36021 539 aa-2.15□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 DLSTP36957 453 aa-2.15□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 P2RY1P47900 373 aa-2.15□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 REG1BP48304 166 aa-2.15□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 IDH2P48735 452 aaKnown RBP-2.15□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 NUMBP49757 651 aa-2.15□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP-2.15□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP-2.15□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 SLC12A3P55017 1021 aa-2.15□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 MARSP56192 900 aaKnown RBP-2.15□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 OR1D5P58170 312 aa-2.15□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 OCRLQ01968 901 aa-2.15□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 PRKCZQ05513 592 aa-2.15□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 ARHGAP1Q07960 439 aa-2.15□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 GALNT2Q10471 571 aa-2.15□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 ASAH1Q13510 395 aa-2.15□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP-2.15□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 CDH18Q13634 790 aa-2.15□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 GTF2H3Q13889 308 aa-2.15□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 MYBPC2Q14324 1141 aa-2.15□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP-2.15□□□□□ -2.753e-7■■□□□ 11.9
SNORD54-201ENST00000459159 BATFQ16520 125 aa-2.15□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP-2.15□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 LRRC36Q1X8D7 754 aa-2.15□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 HYAL4Q2M3T9 481 aa-2.15□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 PRTGQ2VWP7 1150 aa-2.15□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 GRAMD1BQ3KR37 738 aa-2.15□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 C3orf38Q5JPI3 329 aa-2.15□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 GCNT6Q5T4J0 391 aa-2.15□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP-2.15□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 PLA2G4FQ68DD2 849 aa-2.15□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 TMEM81Q6P7N7 255 aa-2.15□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 CD300LGQ6UXG3 332 aa-2.15□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 BICDL1Q6ZP65 573 aa-2.15□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 Q6ZVL8 140 aa-2.15□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 SEM1Q6ZVN7 128 aa-2.15□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 MOB3CQ70IA8 216 aa-2.15□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP-2.15□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 SYT13Q7L8C5 426 aa-2.15□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP-2.15□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 MDGA2Q7Z553 956 aa-2.15□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 DOLPP1Q86YN1 238 aa-2.15□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 RIOX2Q8IUF8 465 aa-2.15□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP-2.15□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 TEX2Q8IWB9 1127 aa-2.15□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 CNTN4Q8IWV2 1026 aa-2.15□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 RHOT2Q8IXI1 618 aa-2.15□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 PEX5LQ8IYB4 626 aa-2.15□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 THNSL1Q8IYQ7 743 aa-2.15□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 ATOH7Q8N100 152 aa-2.15□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 STK40Q8N2I9 435 aa-2.15□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 GPR137CQ8N3F9 429 aa-2.15□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 C11orf44Q8N8P7 122 aa-2.15□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa-2.15□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP-2.15□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 DEFB124Q8NES8 71 aa-2.15□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 OR10G7Q8NGN6 311 aa-2.15□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP-2.15□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 HDAC7Q8WUI4 952 aa-2.15□□□□□ -2.75
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