RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000441222.7

USP46-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 46, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP46, Length 7,954 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46-201ENST00000441222 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 SLC15A3Q8IY34 581 aa6.5□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 FAM110BQ8TC76 370 aa6.5□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 SLC25A36Q96CQ1 311 aa6.5□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 PYURFQ96I23 114 aa6.5□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa6.5□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 KLRF1Q9NZS2 232 aa6.5□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 GHRLQ9UBU3 117 aa6.5□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
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USP46-201ENST00000441222 SHROOM3Q8TF72 1996 aa6.5□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa6.5□□□□□ -1.37
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USP46-201ENST00000441222 MT-ND2P03891 347 aa6.5□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 FAM163BP0C2L3 166 aa6.5□□□□□ -1.37
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USP46-201ENST00000441222 ZNF84P51523 738 aa6.5□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
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USP46-201ENST00000441222 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa6.5□□□□□ -1.37
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USP46-201ENST00000441222 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
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USP46-201ENST00000441222 GPR152Q8TDT2 470 aa6.5□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 TNFRSF25Q93038 417 aa6.5□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 PTPN18Q99952 460 aa6.5□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 B3GNT5Q9BYG0 378 aa6.5□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 FXYD6Q9H0Q3 95 aa6.5□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 GRHPRQ9UBQ7 328 aa6.5□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 FZD4Q9ULV1 537 aa6.5□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 CLCA1A8K7I4 914 aa6.5□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 SLC19A2O60779 497 aa6.5□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 IL33O95760 270 aa6.5□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 OAS1P00973 400 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
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USP46-201ENST00000441222 HTR2AP28223 471 aa6.5□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 HSD11B2P80365 405 aa6.5□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 ZNF33AQ06730 810 aa6.5□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 RIN1Q13671 783 aa6.5□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 HSD17B12Q53GQ0 312 aa6.5□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 GLT8D1Q68CQ7 371 aa6.5□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 GKN2Q86XP6 184 aa6.5□□□□□ -1.37
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USP46-201ENST00000441222 SUV39H2Q9H5I1 410 aa6.5□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 ACP6Q9NPH0 428 aa6.5□□□□□ -1.37
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USP46-201ENST00000441222 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 S1PR1P21453 382 aa6.49□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 PEX2P28328 305 aa6.49□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 BRCC3P46736 316 aa6.49□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 ACTC1P68032 377 aa6.49□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 ACTA1P68133 377 aa6.49□□□□□ -1.37
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USP46-201ENST00000441222 TMED4Q7Z7H5 227 aa6.49□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa6.49□□□□□ -1.37
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USP46-201ENST00000441222 MFSD8Q8NHS3 518 aa6.49□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 JOSD2Q8TAC2 188 aa6.49□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 ALG3Q92685 438 aa6.49□□□□□ -1.37
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USP46-201ENST00000441222 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa6.49□□□□□ -1.37
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USP46-201ENST00000441222 TM9SF2Q99805 663 aa6.49□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
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