RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436759.6

PLEC-208, Transcript of plectin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PLEC, Length 14,787 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLEC-208ENST00000436759 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
PLEC-208ENST00000436759 NOMO2Q5JPE7 1267 aa11.65□□□□□ -0.54
PLEC-208ENST00000436759 C9orf57Q5W0N0 161 aa11.65□□□□□ -0.54
PLEC-208ENST00000436759 SERPINA9Q86WD7 417 aa11.65□□□□□ -0.54
PLEC-208ENST00000436759 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
PLEC-208ENST00000436759 LRRC72A6NJI9 287 aa11.65□□□□□ -0.54
PLEC-208ENST00000436759 CYBRD1Q53TN4 286 aa11.65□□□□□ -0.54
PLEC-208ENST00000436759 TMEM69Q5SWH9 247 aa11.65□□□□□ -0.54
PLEC-208ENST00000436759 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
PLEC-208ENST00000436759 H0YGN5 161 aa11.65□□□□□ -0.54
PLEC-208ENST00000436759 RPS14P62263 151 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
PLEC-208ENST00000436759 FAM129CQ86XR2 697 aa11.65□□□□□ -0.54
PLEC-208ENST00000436759 FAM156AQ8NDB6 213 aa11.65□□□□□ -0.54
PLEC-208ENST00000436759 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
PLEC-208ENST00000436759 AKTIPQ9H8T0 292 aa11.65□□□□□ -0.54
PLEC-208ENST00000436759 TSTD2Q5T7W7 516 aa11.65□□□□□ -0.54
PLEC-208ENST00000436759 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa11.65□□□□□ -0.54
PLEC-208ENST00000436759 C12orf29Q8N999 325 aa11.65□□□□□ -0.54
PLEC-208ENST00000436759 GNG13Q9P2W3 67 aa11.65□□□□□ -0.54
PLEC-208ENST00000436759 STUB1Q9UNE7 303 aa11.65□□□□□ -0.54
PLEC-208ENST00000436759 NSG1P42857 185 aa11.65□□□□□ -0.54
PLEC-208ENST00000436759 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
PLEC-208ENST00000436759 RAB41Q5JT25 222 aa11.65□□□□□ -0.54
PLEC-208ENST00000436759 LRRC52Q8N7C0 313 aa11.65□□□□□ -0.54
PLEC-208ENST00000436759 SLC22A18Q96BI1 424 aa11.65□□□□□ -0.54
PLEC-208ENST00000436759 ADAM2Q99965 735 aa11.65□□□□□ -0.54
PLEC-208ENST00000436759 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
PLEC-208ENST00000436759 CYP8B1Q9UNU6 501 aa11.65□□□□□ -0.54
PLEC-208ENST00000436759 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa11.65□□□□□ -0.54
PLEC-208ENST00000436759 PROM1O43490 865 aa11.65□□□□□ -0.54
PLEC-208ENST00000436759 DEFA6Q01524 100 aa11.65□□□□□ -0.54
PLEC-208ENST00000436759 XYLT1Q86Y38 959 aa11.65□□□□□ -0.54
PLEC-208ENST00000436759 WDSUB1Q8N9V3 476 aa11.65□□□□□ -0.54
PLEC-208ENST00000436759 PCDHAC1Q9H158 963 aa11.65□□□□□ -0.54
PLEC-208ENST00000436759 OR6C74A6NCV1 312 aa11.65□□□□□ -0.54
PLEC-208ENST00000436759 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa11.65□□□□□ -0.54
PLEC-208ENST00000436759 TNFRSF10BO14763 440 aa11.65□□□□□ -0.54
PLEC-208ENST00000436759 PTTG1O95997 202 aa11.65□□□□□ -0.54
PLEC-208ENST00000436759 CHRNB2P17787 502 aa11.65□□□□□ -0.54
PLEC-208ENST00000436759 RPL35P42766 123 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
PLEC-208ENST00000436759 HSH2DQ96JZ2 352 aa11.65□□□□□ -0.54
PLEC-208ENST00000436759 SHOXO15266 292 aa11.65□□□□□ -0.54
PLEC-208ENST00000436759 ESX1Q8N693 406 aa11.65□□□□□ -0.54
PLEC-208ENST00000436759 SLC41A3Q96GZ6 507 aa11.65□□□□□ -0.54
PLEC-208ENST00000436759 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
PLEC-208ENST00000436759 ADAM7Q9H2U9 754 aa11.65□□□□□ -0.54
PLEC-208ENST00000436759 IL17RBQ9NRM6 502 aa11.65□□□□□ -0.54
PLEC-208ENST00000436759 NME7Q9Y5B8 376 aa11.65□□□□□ -0.54
PLEC-208ENST00000436759 ST14Q9Y5Y6 855 aa11.65□□□□□ -0.54
PLEC-208ENST00000436759 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa11.65□□□□□ -0.54
PLEC-208ENST00000436759 ZER1Q7Z7L7 766 aa11.65□□□□□ -0.54
PLEC-208ENST00000436759 LRRN4Q8WUT4 740 aa11.65□□□□□ -0.54
PLEC-208ENST00000436759 C14orf119Q9NWQ9 140 aa11.65□□□□□ -0.54
PLEC-208ENST00000436759 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa11.65□□□□□ -0.54
PLEC-208ENST00000436759 TFPTP0C1Z6 253 aa11.65□□□□□ -0.54
PLEC-208ENST00000436759 ART1P52961 327 aa11.65□□□□□ -0.54
PLEC-208ENST00000436759 DSC2Q02487 901 aa11.65□□□□□ -0.54
PLEC-208ENST00000436759 ZSWIM9Q86XI8 627 aa11.65□□□□□ -0.54
PLEC-208ENST00000436759 ZBTB26Q9HCK0 441 aa11.65□□□□□ -0.54
PLEC-208ENST00000436759 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa11.65□□□□□ -0.54
PLEC-208ENST00000436759 TMEM150BA6NC51 233 aa11.65□□□□□ -0.55
PLEC-208ENST00000436759 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.55
PLEC-208ENST00000436759 DSTNP60981 165 aa11.65□□□□□ -0.55
PLEC-208ENST00000436759 ANKRD22Q5VYY1 191 aa11.65□□□□□ -0.55
PLEC-208ENST00000436759 SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.55
PLEC-208ENST00000436759 KLF11O14901 512 aa11.65□□□□□ -0.55
PLEC-208ENST00000436759 PRNPP04156 253 aa11.65□□□□□ -0.55
PLEC-208ENST00000436759 SLC6A6P31641 620 aa11.65□□□□□ -0.55
PLEC-208ENST00000436759 TAS2R50P59544 299 aa11.65□□□□□ -0.55
PLEC-208ENST00000436759 C2orf76Q3KRA6 126 aa11.65□□□□□ -0.55
PLEC-208ENST00000436759 ZNF675Q8TD23 568 aa11.65□□□□□ -0.55
PLEC-208ENST00000436759 MAGEH1Q9H213 219 aa11.65□□□□□ -0.55
PLEC-208ENST00000436759 CENPMQ9NSP4 180 aa11.65□□□□□ -0.55
PLEC-208ENST00000436759 DSC3Q14574 896 aa11.64□□□□□ -0.55
PLEC-208ENST00000436759 F8W036 122 aa11.64□□□□□ -0.55
PLEC-208ENST00000436759 DNAJB6O75190 326 aa11.64□□□□□ -0.55
PLEC-208ENST00000436759 RAD51DO75771 328 aa11.64□□□□□ -0.55
PLEC-208ENST00000436759 ATE1O95260 518 aa11.64□□□□□ -0.55
PLEC-208ENST00000436759 MT-CO2P00403 227 aa11.64□□□□□ -0.55
PLEC-208ENST00000436759 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
PLEC-208ENST00000436759 BMP8BP34820 402 aa11.64□□□□□ -0.55
PLEC-208ENST00000436759 BLOC1S1P78537 153 aa11.64□□□□□ -0.55
PLEC-208ENST00000436759 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa11.64□□□□□ -0.55
PLEC-208ENST00000436759 GPR149Q86SP6 731 aa11.64□□□□□ -0.55
PLEC-208ENST00000436759 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa11.64□□□□□ -0.55
PLEC-208ENST00000436759 TAS2R8Q9NYW2 309 aa11.64□□□□□ -0.55
PLEC-208ENST00000436759 CHATP28329 748 aa11.64□□□□□ -0.55
PLEC-208ENST00000436759 GSG1LQ6UXU4 331 aa11.64□□□□□ -0.55
PLEC-208ENST00000436759 CPA6Q8N4T0 437 aa11.64□□□□□ -0.55
PLEC-208ENST00000436759 PLA2G15Q8NCC3 412 aa11.64□□□□□ -0.55
PLEC-208ENST00000436759 A8MXE2 369 aa11.64□□□□□ -0.55
PLEC-208ENST00000436759 MEN1O00255 615 aa11.64□□□□□ -0.55
PLEC-208ENST00000436759 CERS1P27544 350 aa11.64□□□□□ -0.55
PLEC-208ENST00000436759 ADORA2AP29274 412 aa11.64□□□□□ -0.55
PLEC-208ENST00000436759 MEP1AQ16819 746 aa11.64□□□□□ -0.55
PLEC-208ENST00000436759 BEST4Q8NFU0 473 aa11.64□□□□□ -0.55
PLEC-208ENST00000436759 NLGN2Q8NFZ4 835 aa11.64□□□□□ -0.55
PLEC-208ENST00000436759 PPA2Q9H2U2 334 aa11.64□□□□□ -0.55
PLEC-208ENST00000436759 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa11.64□□□□□ -0.55
PLEC-208ENST00000436759 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.4 ms