RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428963.6

CENPN-204, Transcript of centromere protein N, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CENPN, Length 971 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPN-204ENST00000428963 OR5H15A6NDH6 313 aa7□□□□□ -1.29
CENPN-204ENST00000428963 OR2W5A6NFC9 320 aa7□□□□□ -1.29
CENPN-204ENST00000428963 HACD1B0YJ81 288 aa7□□□□□ -1.29
CENPN-204ENST00000428963 IDSB3KWA1 339 aa7□□□□□ -1.29
CENPN-204ENST00000428963 NPIPA5E9PKD4 350 aa7□□□□□ -1.29
CENPN-204ENST00000428963 FAM227AF5H4B4 570 aa7□□□□□ -1.29
CENPN-204ENST00000428963 RASGRF2O14827 1237 aa7□□□□□ -1.29
CENPN-204ENST00000428963 AP2A2O94973 939 aa7□□□□□ -1.29
CENPN-204ENST00000428963 CRYABP02511 175 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
CENPN-204ENST00000428963 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
CENPN-204ENST00000428963 CD9P21926 228 aa7□□□□□ -1.29
CENPN-204ENST00000428963 FOXN2P32314 431 aa7□□□□□ -1.29
CENPN-204ENST00000428963 SMSP52788 366 aa7□□□□□ -1.29
CENPN-204ENST00000428963 UBASH3AP57075 661 aa7□□□□□ -1.29
CENPN-204ENST00000428963 OCA2Q04671 838 aa7□□□□□ -1.29
CENPN-204ENST00000428963 RBPJQ06330 500 aa7□□□□□ -1.29
CENPN-204ENST00000428963 CACNG1Q06432 222 aa7□□□□□ -1.29
CENPN-204ENST00000428963 SEMA3AQ14563 771 aa7□□□□□ -1.29
CENPN-204ENST00000428963 SF1Q15637 639 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
CENPN-204ENST00000428963 FAM214AQ32MH5 1076 aa7□□□□□ -1.29
CENPN-204ENST00000428963 ODF2Q5BJF6 829 aa7□□□□□ -1.29
CENPN-204ENST00000428963 ZNF766Q5HY98 468 aa7□□□□□ -1.29
CENPN-204ENST00000428963 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
CENPN-204ENST00000428963 TCTE1Q5JU00 501 aa7□□□□□ -1.29
CENPN-204ENST00000428963 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
CENPN-204ENST00000428963 KCTD11Q693B1 232 aa7□□□□□ -1.29
CENPN-204ENST00000428963 CNSTQ6PJW8 725 aa7□□□□□ -1.29
CENPN-204ENST00000428963 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
CENPN-204ENST00000428963 LCNL1Q6ZST4 164 aa7□□□□□ -1.29
CENPN-204ENST00000428963 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
CENPN-204ENST00000428963 NEK10Q6ZWH5 1172 aa7□□□□□ -1.29
CENPN-204ENST00000428963 LUZP1Q86V48 1076 aa7□□□□□ -1.29
CENPN-204ENST00000428963 SPPL2CQ8IUH8 684 aa7□□□□□ -1.29
CENPN-204ENST00000428963 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa7□□□□□ -1.29
CENPN-204ENST00000428963 KRT222Q8N1A0 295 aa7□□□□□ -1.29
CENPN-204ENST00000428963 OR2L8Q8NGY9 312 aa7□□□□□ -1.29
CENPN-204ENST00000428963 KRT35Q92764 455 aa7□□□□□ -1.29
CENPN-204ENST00000428963 IMMP1LQ96LU5 166 aa7□□□□□ -1.29
CENPN-204ENST00000428963 GPR137Q96N19 417 aa7□□□□□ -1.29
CENPN-204ENST00000428963 ZNF700Q9H0M5 742 aa7□□□□□ -1.29
CENPN-204ENST00000428963 VPS37BQ9H9H4 285 aa7□□□□□ -1.29
CENPN-204ENST00000428963 ARNT2Q9HBZ2 717 aa7□□□□□ -1.29
CENPN-204ENST00000428963 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
CENPN-204ENST00000428963 ANKRD10Q9NXR5 420 aa7□□□□□ -1.29
CENPN-204ENST00000428963 STMN3Q9NZ72 180 aa7□□□□□ -1.29
CENPN-204ENST00000428963 NPIPA1Q9UND3 350 aa7□□□□□ -1.29
CENPN-204ENST00000428963 TFR2Q9UP52 801 aa7□□□□□ -1.29
CENPN-204ENST00000428963 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa7□□□□□ -1.29
CENPN-204ENST00000428963 ALG6Q9Y672 507 aa7□□□□□ -1.29
CENPN-204ENST00000428963 NFS1Q9Y697 457 aa7□□□□□ -1.29
CENPN-204ENST00000428963 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
CENPN-204ENST00000428963 A0A1B0GTL3 188 aa6.99□□□□□ -1.29
CENPN-204ENST00000428963 A0A1W2PPV9 198 aa6.99□□□□□ -1.29
CENPN-204ENST00000428963 H0YGG7 62 aa6.99□□□□□ -1.29
CENPN-204ENST00000428963 FANCGO15287 622 aa6.99□□□□□ -1.29
CENPN-204ENST00000428963 FOXS1O43638 330 aa6.99□□□□□ -1.29
CENPN-204ENST00000428963 SPOPO43791 374 aa6.99□□□□□ -1.29
CENPN-204ENST00000428963 GPC4O75487 556 aa6.99□□□□□ -1.29
CENPN-204ENST00000428963 METTL18O95568 372 aa6.99□□□□□ -1.29
CENPN-204ENST00000428963 FTH1P02794 183 aa6.99□□□□□ -1.29
CENPN-204ENST00000428963 HEXBP07686 556 aa6.99□□□□□ -1.29
CENPN-204ENST00000428963 GSTM1P09488 218 aa6.99□□□□□ -1.29
CENPN-204ENST00000428963 FBLP22087 321 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
CENPN-204ENST00000428963 PSMA3P25788 255 aa6.99□□□□□ -1.29
CENPN-204ENST00000428963 SLC1A1P43005 524 aa6.99□□□□□ -1.29
CENPN-204ENST00000428963 BDKRB1P46663 353 aa6.99□□□□□ -1.29
CENPN-204ENST00000428963 ART1P52961 327 aa6.99□□□□□ -1.29
CENPN-204ENST00000428963 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
CENPN-204ENST00000428963 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
CENPN-204ENST00000428963 ZNF33BQ06732 778 aa6.99□□□□□ -1.29
CENPN-204ENST00000428963 HSPA14Q0VDF9 509 aa6.99□□□□□ -1.29
CENPN-204ENST00000428963 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
CENPN-204ENST00000428963 ITIH4Q14624 930 aa6.99□□□□□ -1.29
CENPN-204ENST00000428963 POU6F1Q14863 301 aa6.99□□□□□ -1.29
CENPN-204ENST00000428963 HKDC1Q2TB90 917 aa6.99□□□□□ -1.29
CENPN-204ENST00000428963 PRTGQ2VWP7 1150 aa6.99□□□□□ -1.29
CENPN-204ENST00000428963 SYTL3Q4VX76 610 aa6.99□□□□□ -1.29
CENPN-204ENST00000428963 CCDC38Q502W7 563 aa6.99□□□□□ -1.29
CENPN-204ENST00000428963 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
CENPN-204ENST00000428963 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa6.99□□□□□ -1.29
CENPN-204ENST00000428963 AADACL2Q6P093 401 aa6.99□□□□□ -1.29
CENPN-204ENST00000428963 TMEM205Q6UW68 189 aa6.99□□□□□ -1.29
CENPN-204ENST00000428963 PACS1Q6VY07 963 aa6.99□□□□□ -1.29
CENPN-204ENST00000428963 LANCL3Q6ZV70 420 aa6.99□□□□□ -1.29
CENPN-204ENST00000428963 BBS12Q6ZW61 710 aa6.99□□□□□ -1.29
CENPN-204ENST00000428963 RNF44Q7L0R7 432 aa6.99□□□□□ -1.29
CENPN-204ENST00000428963 DOLPP1Q86YN1 238 aa6.99□□□□□ -1.29
CENPN-204ENST00000428963 TMTC1Q8IUR5 882 aa6.99□□□□□ -1.29
CENPN-204ENST00000428963 SIAH3Q8IW03 269 aa6.99□□□□□ -1.29
CENPN-204ENST00000428963 SLC22A15Q8IZD6 547 aa6.99□□□□□ -1.29
CENPN-204ENST00000428963 BEST3Q8N1M1 668 aa6.99□□□□□ -1.29
CENPN-204ENST00000428963 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa6.99□□□□□ -1.29
CENPN-204ENST00000428963 AMER3Q8N944 861 aa6.99□□□□□ -1.29
CENPN-204ENST00000428963 KCT2Q8NC54 265 aa6.99□□□□□ -1.29
CENPN-204ENST00000428963 MDS2Q8NDY4 140 aa6.99□□□□□ -1.29
CENPN-204ENST00000428963 ACTL9Q8TC94 416 aa6.99□□□□□ -1.29
CENPN-204ENST00000428963 DENND1AQ8TEH3 1009 aa6.99□□□□□ -1.29
CENPN-204ENST00000428963 AGAP11Q8TF27 550 aa6.99□□□□□ -1.29
CENPN-204ENST00000428963 STYXQ8WUJ0 223 aa6.99□□□□□ -1.29
CENPN-204ENST00000428963 CHTF18Q8WVB6 975 aa6.99□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.9 ms