RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424082.6

RALGPS1-208, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RALGPS1, Length 2,362 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-208ENST00000424082 TBKBP1A7MCY6 615 aa17.73■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 A8MX80 341 aa17.73■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa17.73■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP17.73■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP17.73■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 RHOAP61586 193 aa17.73■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 GPR17Q13304 367 aa17.73■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 NXNL2Q5VZ03 156 aa17.73■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 TAS1R1Q7RTX1 841 aa17.73■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 CCDC190Q86UF4 302 aa17.73■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 DNAJC22Q8N4W6 341 aa17.73■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 UBTD2Q8WUN7 234 aa17.73■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 PIK3R3Q92569 461 aa17.73■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 WBP2Q969T9 261 aa17.73■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 AMBNQ9NP70 447 aa17.73■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 FKBP14Q9NWM8 211 aa17.73■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 C14orf119Q9NWQ9 140 aa17.73■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP17.73■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 RPS6KA6Q9UK32 745 aa17.73■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 VPS4AQ9UN37 437 aa17.73■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa17.73■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 UPK3BL1B0FP48 263 aa17.72■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 UPK3BL2E5RIL1 263 aa17.72■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 CDK10Q15131 360 aa17.72■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 BCL7AQ4VC05 210 aa17.72■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP17.72■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 APIPQ96GX9 242 aa17.72■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 HSH2DQ96JZ2 352 aa17.72■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa17.72■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 GABARAPL3Q9BY60 117 aa17.72■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 K7ERQ8 282 aa17.72■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 AP3D1O14617 1153 aa17.72■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 COCHO43405 550 aa17.72■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 STC2O76061 302 aa17.72■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP17.72■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 ITGA1P56199 1179 aa17.72■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP17.72■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 ZFP69Q49AA0 526 aa17.72■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 RTP2Q5QGT7 225 aa17.72■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 MLIPQ5VWP3 458 aa17.72■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 GPR153Q6NV75 609 aa17.72■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 TTC23LQ6PF05 361 aa17.72■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 SERPINA11Q86U17 422 aa17.72■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 PGBD3Q8N328 593 aa17.72■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 RNF175Q8N4F7 328 aa17.72■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 KCNC2Q96PR1 638 aa17.72■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 EBPLQ9BY08 206 aa17.72■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 SLC29A3Q9BZD2 475 aa17.72■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 ELOVL6Q9H5J4 265 aa17.72■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 LRFN2Q9ULH4 789 aa17.72■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 CLCA1A8K7I4 914 aa17.71■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 H3BQ06 376 aaPredicted RBP17.71■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 KCNK5O95279 499 aa17.71■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 C9P02748 559 aa17.71■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 CHRNB1P11230 501 aa17.71■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP17.71■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 VMACQ2NL98 169 aa17.71■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 FBXO43Q4G163 708 aa17.71■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 ARMCX4Q5H9R4 360 aa17.71■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 PRR23CQ6ZRP0 262 aa17.71■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 CRIPAKQ8N1N5 446 aa17.71■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 PSD4Q8NDX1 1056 aa17.71■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 TESCQ96BS2 214 aa17.71■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 MYO19Q96H55 970 aa17.71■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 ST6GAL2Q96JF0 529 aa17.71■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 APOLD1Q96LR9 279 aa17.71■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP17.71■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa17.71■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 ERVK13-1Q9NX77 482 aa17.71■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 ARL15Q9NXU5 204 aa17.71■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 TBC1D24Q9ULP9 559 aa17.71■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 KRT87PA6NCN2 255 aa17.71■□□□□ 0.42
RALGPS1-208ENST00000424082 EVPLLA8MZ36 301 aa17.71■□□□□ 0.42
RALGPS1-208ENST00000424082 CLIC1O00299 241 aa17.71■□□□□ 0.42
RALGPS1-208ENST00000424082 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP17.71■□□□□ 0.42
RALGPS1-208ENST00000424082 CLDN7O95471 211 aa17.71■□□□□ 0.42
RALGPS1-208ENST00000424082 ENGP17813 658 aa17.71■□□□□ 0.42
RALGPS1-208ENST00000424082 ACRV1P26436 265 aa17.71■□□□□ 0.42
RALGPS1-208ENST00000424082 GKP32189 559 aa17.71■□□□□ 0.42
RALGPS1-208ENST00000424082 KDELR2P33947 212 aa17.71■□□□□ 0.42
RALGPS1-208ENST00000424082 PIK3CBP42338 1070 aa17.71■□□□□ 0.42
RALGPS1-208ENST00000424082 SLC15A1P46059 708 aa17.71■□□□□ 0.42
RALGPS1-208ENST00000424082 RGS6P49758 472 aa17.71■□□□□ 0.42
RALGPS1-208ENST00000424082 LRRC26Q2I0M4 334 aa17.71■□□□□ 0.42
RALGPS1-208ENST00000424082 ARMC12Q5T9G4 340 aa17.71■□□□□ 0.42
RALGPS1-208ENST00000424082 DEFB128Q7Z7B8 93 aa17.71■□□□□ 0.42
RALGPS1-208ENST00000424082 ZZZ3Q8IYH5 903 aa17.71■□□□□ 0.42
RALGPS1-208ENST00000424082 TCAIMQ8N3R3 496 aa17.71■□□□□ 0.42
RALGPS1-208ENST00000424082 PIH1D2Q8WWB5 315 aa17.71■□□□□ 0.42
RALGPS1-208ENST00000424082 PANX1Q96RD7 426 aa17.71■□□□□ 0.42
RALGPS1-208ENST00000424082 CCDC32Q9BV29 185 aa17.71■□□□□ 0.42
RALGPS1-208ENST00000424082 ADPRHL2Q9NX46 363 aa17.71■□□□□ 0.42
RALGPS1-208ENST00000424082 SPASTQ9UBP0 616 aa17.71■□□□□ 0.42
RALGPS1-208ENST00000424082 CRLS1Q9UJA2 301 aa17.71■□□□□ 0.42
RALGPS1-208ENST00000424082 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa17.71■□□□□ 0.42
RALGPS1-208ENST00000424082 CENPXA8MT69 81 aa17.7■□□□□ 0.42
RALGPS1-208ENST00000424082 SEMA3DO95025 777 aa17.7■□□□□ 0.42
RALGPS1-208ENST00000424082 STSP08842 583 aa17.7■□□□□ 0.42
RALGPS1-208ENST00000424082 ADORA3P0DMS8 318 aa17.7■□□□□ 0.42
RALGPS1-208ENST00000424082 ITGALP20701 1170 aa17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.8 ms