RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421004.3

SCAMP1-AS1-201, SCAMP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SCAMP1-AS1, Length 1,479 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TUBA3EQ6PEY2 450 aa12.44□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMEM139Q8IV31 216 aa12.44□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 REXO1L1PQ8IX06 675 aa12.44□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP12.44□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MDS2Q8NDY4 140 aa12.44□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP12.44□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CYTH2Q99418 400 aa12.44□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP12.44□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SOX13Q9UN79 622 aa12.44□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF835Q9Y2P0 537 aa12.44□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CACNA1CQ13936 2221 aa12.43□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM227AF5H4B4 570 aa12.43□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C19orf84I3L1E1 186 aa12.43□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MLYCDO95822 493 aa12.43□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SYF2O95926 243 aaKnown RBP12.43□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 XCR1P46094 333 aa12.43□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CLCN7P51798 805 aa12.43□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PTK6Q13882 451 aa12.43□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP12.43□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TTLL9Q3SXZ7 439 aa12.43□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa12.43□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C4orf22Q6V702 233 aa12.43□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP12.43□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CENPUQ71F23 418 aa12.43□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PRSS41Q7RTY9 318 aa12.43□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 VN1R4Q7Z5H5 301 aa12.43□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CRLF3Q8IUI8 442 aa12.43□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CILP2Q8IUL8 1156 aa12.43□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP12.43□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa12.43□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SHISA5Q8N114 240 aa12.43□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR51Q1Q8NH59 317 aa12.43□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GIMAP7Q8NHV1 300 aa12.43□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MCOLN3Q8TDD5 553 aa12.43□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SCMH1Q96GD3 660 aa12.43□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa12.43□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC30A3Q99726 388 aa12.43□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HES7Q9BYE0 225 aa12.43□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KCNK13Q9HB14 408 aa12.43□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HCN3Q9P1Z3 774 aa12.43□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa12.43□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZFHX3Q15911 3703 aa12.43□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CCDC168Q8NDH2 2452 aa12.42□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ASPDHA6ND91 283 aa12.42□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 H7BY64 318 aa12.42□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KIF5CO60282 957 aa12.42□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CLDN14O95500 239 aa12.42□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IL1RNP18510 177 aa12.42□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TPSB2P20231 275 aa12.42□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IMPA1P29218 277 aa12.42□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP12.42□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 AGTR2P50052 363 aa12.42□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP12.42□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CUL1Q13616 776 aa12.42□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CDSNQ15517 529 aa12.42□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR1C1Q15619 314 aa12.42□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TPSAB1Q15661 275 aa12.42□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EXT1Q16394 746 aa12.42□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CCNG2Q16589 344 aa12.42□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MEP1AQ16819 746 aa12.42□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KRTCAP3Q53RY4 240 aa12.42□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP12.42□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ANKRD37Q7Z713 158 aa12.42□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SPPL2CQ8IUH8 684 aa12.42□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP12.42□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP12.42□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP12.42□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FRMD6Q96NE9 622 aa12.42□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PRAP1Q96NZ9 151 aa12.42□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NPAS2Q99743 824 aa12.42□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP12.42□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP12.42□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KLHL1Q9NR64 748 aa12.42□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP12.42□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ANKRD10Q9NXR5 420 aa12.42□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa12.42□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MEMO1Q9Y316 297 aa12.42□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa12.41□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MPC1LP0DKB6 136 aa12.41□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CD46P15529 392 aa12.41□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PAMP19021 973 aa12.41□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SSTR2P30874 369 aa12.41□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BCL6P41182 706 aa12.41□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP12.41□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP12.41□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MEI1Q5TIA1 1274 aa12.41□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP12.41□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GSTA5Q7RTV2 222 aa12.41□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PCGF5Q86SE9 256 aa12.41□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PRELID2Q8N945 189 aa12.41□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMEM178AQ8NBL3 297 aa12.41□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa12.41□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 M1APQ8TC57 530 aa12.41□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa12.41□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ASB11Q8WXH4 323 aa12.41□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TSGA10Q9BZW7 698 aa12.41□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RBSNQ9H1K0 784 aa12.41□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MMP25Q9NPA2 562 aa12.41□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP12.41□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMEM184CQ9NVA4 438 aa12.41□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.9 ms