RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409985.5

PMS1-205, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

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Gene PMS1, Length 1,882 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-205ENST00000409985 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
PMS1-205ENST00000409985 BAG5Q9UL15 447 aa22.97■■□□□ 1.27
PMS1-205ENST00000409985 PSMD11O00231 422 aa22.96■■□□□ 1.27
PMS1-205ENST00000409985 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
PMS1-205ENST00000409985 JRKO75564 520 aa22.96■■□□□ 1.27
PMS1-205ENST00000409985 LRATO95237 230 aa22.96■■□□□ 1.27
PMS1-205ENST00000409985 FKBP9O95302 570 aa22.96■■□□□ 1.27
PMS1-205ENST00000409985 BCL10O95999 233 aa22.96■■□□□ 1.27
PMS1-205ENST00000409985 TYRP14679 529 aa22.96■■□□□ 1.27
PMS1-205ENST00000409985 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
PMS1-205ENST00000409985 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa22.96■■□□□ 1.27
PMS1-205ENST00000409985 Q6ZVL8 140 aa22.96■■□□□ 1.27
PMS1-205ENST00000409985 PTOV1Q86YD1 416 aa22.96■■□□□ 1.27
PMS1-205ENST00000409985 SYNPOQ8N3V7 929 aa22.96■■□□□ 1.27
PMS1-205ENST00000409985 OR7A2PQ8NGA2 310 aa22.96■■□□□ 1.27
PMS1-205ENST00000409985 COQ8BQ96D53 544 aa22.96■■□□□ 1.27
PMS1-205ENST00000409985 CCM2Q9BSQ5 444 aa22.96■■□□□ 1.27
PMS1-205ENST00000409985 TDP1Q9NUW8 608 aa22.96■■□□□ 1.27
PMS1-205ENST00000409985 CCL26Q9Y258 94 aa22.96■■□□□ 1.27
PMS1-205ENST00000409985 PCMT1P22061 227 aa22.96■■□□□ 1.27
PMS1-205ENST00000409985 PRKACGP22612 351 aa22.96■■□□□ 1.27
PMS1-205ENST00000409985 GALK1P51570 392 aa22.96■■□□□ 1.27
PMS1-205ENST00000409985 SLC14A1Q13336 389 aa22.96■■□□□ 1.27
PMS1-205ENST00000409985 SYTL3Q4VX76 610 aa22.96■■□□□ 1.27
PMS1-205ENST00000409985 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
PMS1-205ENST00000409985 Q6ZNX1 250 aa22.96■■□□□ 1.27
PMS1-205ENST00000409985 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa22.96■■□□□ 1.27
PMS1-205ENST00000409985 CHTF18Q8WVB6 975 aa22.96■■□□□ 1.27
PMS1-205ENST00000409985 GLYATL1Q969I3 302 aa22.96■■□□□ 1.27
PMS1-205ENST00000409985 FKBP10Q96AY3 582 aa22.96■■□□□ 1.27
PMS1-205ENST00000409985 REPS1Q96D71 796 aa22.96■■□□□ 1.27
PMS1-205ENST00000409985 MRGPRX3Q96LB0 322 aa22.96■■□□□ 1.27
PMS1-205ENST00000409985 DUSP26Q9BV47 211 aa22.96■■□□□ 1.27
PMS1-205ENST00000409985 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
PMS1-205ENST00000409985 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
PMS1-205ENST00000409985 IGFLR1Q9H665 355 aa22.96■■□□□ 1.27
PMS1-205ENST00000409985 TPRKBQ9Y3C4 175 aa22.96■■□□□ 1.27
PMS1-205ENST00000409985 BRWD1Q9NSI6 2320 aa22.96■■□□□ 1.27
PMS1-205ENST00000409985 LEFTY1O75610 366 aa22.95■■□□□ 1.26
PMS1-205ENST00000409985 ZNF682O95780 498 aa22.95■■□□□ 1.26
PMS1-205ENST00000409985 CCR2P41597 374 aa22.95■■□□□ 1.26
PMS1-205ENST00000409985 ZNF805Q5CZA5 627 aa22.95■■□□□ 1.26
PMS1-205ENST00000409985 GALNT18Q6P9A2 607 aa22.95■■□□□ 1.26
PMS1-205ENST00000409985 ZNF621Q6ZSS3 439 aa22.95■■□□□ 1.26
PMS1-205ENST00000409985 CYP4Z1Q86W10 505 aa22.95■■□□□ 1.26
PMS1-205ENST00000409985 SLC22A15Q8IZD6 547 aa22.95■■□□□ 1.26
PMS1-205ENST00000409985 FOPNLQ96NB1 174 aa22.95■■□□□ 1.26
PMS1-205ENST00000409985 APOL4Q9BPW4 351 aa22.95■■□□□ 1.26
PMS1-205ENST00000409985 DUSP21Q9H596 190 aa22.95■■□□□ 1.26
PMS1-205ENST00000409985 VNN3Q9NY84 501 aa22.95■■□□□ 1.26
PMS1-205ENST00000409985 FADS2P1A8MWK0 482 aa22.94■■□□□ 1.26
PMS1-205ENST00000409985 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
PMS1-205ENST00000409985 ITGA1P56199 1179 aa22.94■■□□□ 1.26
PMS1-205ENST00000409985 C16orf72Q14CZ0 275 aa22.94■■□□□ 1.26
PMS1-205ENST00000409985 SLC44A4Q53GD3 710 aa22.94■■□□□ 1.26
PMS1-205ENST00000409985 WDR34Q96EX3 536 aa22.94■■□□□ 1.26
PMS1-205ENST00000409985 CHST8Q9H2A9 424 aa22.94■■□□□ 1.26
PMS1-205ENST00000409985 IL36AQ9UHA7 158 aa22.94■■□□□ 1.26
PMS1-205ENST00000409985 E7EQ34 232 aa22.94■■□□□ 1.26
PMS1-205ENST00000409985 E9PQ18 207 aa22.94■■□□□ 1.26
PMS1-205ENST00000409985 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
PMS1-205ENST00000409985 ZNF12P17014 697 aa22.94■■□□□ 1.26
PMS1-205ENST00000409985 HPCAL1P37235 193 aa22.94■■□□□ 1.26
PMS1-205ENST00000409985 ETV3P41162 512 aa22.94■■□□□ 1.26
PMS1-205ENST00000409985 CSNK2BP67870 215 aa22.94■■□□□ 1.26
PMS1-205ENST00000409985 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
PMS1-205ENST00000409985 TEAD4Q15561 434 aa22.94■■□□□ 1.26
PMS1-205ENST00000409985 CPTPQ5TA50 214 aa22.94■■□□□ 1.26
PMS1-205ENST00000409985 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
PMS1-205ENST00000409985 NLRP8Q86W28 1048 aa22.94■■□□□ 1.26
PMS1-205ENST00000409985 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
PMS1-205ENST00000409985 EBPLQ9BY08 206 aa22.94■■□□□ 1.26
PMS1-205ENST00000409985 TPT1P8Q9HAU6 139 aa22.94■■□□□ 1.26
PMS1-205ENST00000409985 SGK2Q9HBY8 427 aa22.94■■□□□ 1.26
PMS1-205ENST00000409985 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa22.94■■□□□ 1.26
PMS1-205ENST00000409985 ENPP5Q9UJA9 477 aa22.94■■□□□ 1.26
PMS1-205ENST00000409985 ABCG2Q9UNQ0 655 aa22.94■■□□□ 1.26
PMS1-205ENST00000409985 C1orf226A1L170 272 aa22.93■■□□□ 1.26
PMS1-205ENST00000409985 NPC1O15118 1278 aa22.93■■□□□ 1.26
PMS1-205ENST00000409985 PFDN1O60925 122 aa22.93■■□□□ 1.26
PMS1-205ENST00000409985 MTX2O75431 263 aa22.93■■□□□ 1.26
PMS1-205ENST00000409985 PTPN2P17706 415 aa22.93■■□□□ 1.26
PMS1-205ENST00000409985 DAPP51397 102 aa22.93■■□□□ 1.26
PMS1-205ENST00000409985 NAE1Q13564 534 aa22.93■■□□□ 1.26
PMS1-205ENST00000409985 ZNF77Q15935 545 aa22.93■■□□□ 1.26
PMS1-205ENST00000409985 ARSIQ5FYB1 569 aa22.93■■□□□ 1.26
PMS1-205ENST00000409985 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
PMS1-205ENST00000409985 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa22.93■■□□□ 1.26
PMS1-205ENST00000409985 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
PMS1-205ENST00000409985 TANKQ92844 425 aa22.93■■□□□ 1.26
PMS1-205ENST00000409985 GUCD1Q96NT3 240 aa22.93■■□□□ 1.26
PMS1-205ENST00000409985 SCN3BQ9NY72 215 aa22.93■■□□□ 1.26
PMS1-205ENST00000409985 LMCD1Q9NZU5 365 aa22.93■■□□□ 1.26
PMS1-205ENST00000409985 FBXO10Q9UK96 956 aa22.93■■□□□ 1.26
PMS1-205ENST00000409985 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
PMS1-205ENST00000409985 KCNE2Q9Y6J6 123 aa22.93■■□□□ 1.26
PMS1-205ENST00000409985 NOTCH4Q99466 2003 aa22.93■■□□□ 1.26
PMS1-205ENST00000409985 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
PMS1-205ENST00000409985 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
PMS1-205ENST00000409985 CCL16O15467 120 aa22.92■■□□□ 1.26
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