RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000405546.7

ATG4B-206, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene ATG4B, Length 3,294 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-206ENST00000405546 EHD3Q9NZN3 535 aa14.55□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 INSL5Q9Y5Q6 135 aa14.55□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa14.55□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 PER2O15055 1255 aa14.55□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 PPP2R2BQ00005 443 aa14.55□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 CHIT1Q13231 466 aa14.55□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 PLEKHG6Q3KR16 790 aa14.55□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 TBRG1Q3YBR2 411 aa14.55□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 USP45Q70EL2 814 aa14.55□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 ADHFE1Q8IWW8 467 aa14.55□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 LEMD2Q8NC56 503 aa14.55□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 FOXJ1Q92949 421 aa14.55□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 ACPTQ9BZG2 426 aa14.55□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 SCN3BQ9NY72 215 aa14.55□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa14.55□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 ARHGDIAP52565 204 aa14.54□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 NOGQ13253 232 aa14.54□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa14.54□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 NECAB2Q7Z6G3 386 aa14.54□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 DPP10Q8N608 796 aa14.54□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 MINDY2Q8NBR6 621 aa14.54□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 PIK3C3Q8NEB9 887 aa14.54□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 APIPQ96GX9 242 aa14.54□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 CWH43Q9H720 699 aa14.54□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 CPNE5Q9HCH3 593 aa14.54□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 GPRC5BQ9NZH0 403 aa14.54□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 DNAJB9Q9UBS3 223 aa14.54□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 AGAP5A6NIR3 686 aa14.54□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 ZW10O43264 779 aa14.54□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 RGS10O43665 173 aa14.54□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 FZD6O60353 706 aa14.54□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 TSC22D2O75157 780 aa14.54□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 IFNA8P32881 189 aa14.54□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 TGM4P49221 684 aa14.54□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 PON2Q15165 354 aa14.54□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 Q5BKY6 102 aa14.54□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 GPRC6AQ5T6X5 926 aa14.54□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 ZNF691Q5VV52 312 aa14.54□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 GPR153Q6NV75 609 aa14.54□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 ELMOD2Q8IZ81 293 aa14.54□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 ATG16L2Q8NAA4 619 aa14.54□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 HTATIP2Q9BUP3 242 aa14.54□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 MTG2Q9H4K7 406 aa14.54□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 SLC32A1Q9H598 525 aa14.54□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 SUV39H2Q9H5I1 410 aa14.54□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 NPPAP01160 153 aa14.54□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 APOA1P02647 267 aa14.54□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 SOD2P04179 222 aa14.54□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 EBLN1P0CF75 366 aa14.54□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 SLAMF1Q13291 335 aa14.54□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 XKR6Q5GH73 641 aa14.54□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 ZMAT1Q5H9K5 638 aa14.54□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 SDE2Q6IQ49 451 aa14.54□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 VRK3Q8IV63 474 aa14.54□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 GOLM1Q8NBJ4 401 aa14.54□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 PAPD5Q8NDF8 572 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 SORCS1Q8WY21 1168 aa14.54□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 CAPNS2Q96L46 248 aa14.54□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 CEP19Q96LK0 163 aa14.54□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 RNF208Q9H0X6 261 aa14.54□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 ACOT13Q9NPJ3 140 aa14.54□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 SH3BP4Q9P0V3 963 aa14.54□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 KIF17Q9P2E2 1029 aa14.54□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 KMOO15229 486 aa14.53□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 CRYZL1O95825 349 aa14.53□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 COX7A2P14406 83 aa14.53□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 CDKN2CP42773 168 aa14.53□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 GPLD1P80108 840 aa14.53□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 CARD16Q5EG05 197 aa14.53□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa14.53□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 CHST14Q8NCH0 376 aa14.53□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 OVCA2Q8WZ82 227 aa14.53□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 YIPF6Q96EC8 236 aa14.53□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 BRD9Q9H8M2 597 aa14.53□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 CREBZFQ9NS37 354 aa14.53□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 BACE2Q9Y5Z0 518 aa14.53□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 ARNTLO00327 626 aa14.53□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 ANKRD28O15084 1053 aa14.53□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 TEX28O15482 410 aa14.53□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 FHP07954 510 aa14.53□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 PTPN2P17706 415 aa14.53□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 KRT20P35900 424 aa14.53□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 PPP3CCP48454 512 aa14.53□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 GALK2Q01415 458 aa14.53□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 TLE2Q04725 743 aa14.53□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa14.53□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.9 ms