RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395788.3

C6orf48-208, Transcript of chromosome 6 open reading frame 48, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene C6orf48, Length 815 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf48-208ENST00000395788 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa5.8□□□□□ -1.48
C6orf48-208ENST00000395788 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa5.8□□□□□ -1.48
C6orf48-208ENST00000395788 A0A1W2PPV9 198 aa5.8□□□□□ -1.48
C6orf48-208ENST00000395788 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
C6orf48-208ENST00000395788 PRORSD1PA6NEY8 169 aa5.8□□□□□ -1.48
C6orf48-208ENST00000395788 TBC1D3LB9A6J9 549 aa5.8□□□□□ -1.48
C6orf48-208ENST00000395788 E7EQ34 232 aa5.8□□□□□ -1.48
C6orf48-208ENST00000395788 H3BNX3 289 aa5.8□□□□□ -1.48
C6orf48-208ENST00000395788 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
C6orf48-208ENST00000395788 NR5A2O00482 541 aa5.8□□□□□ -1.48
C6orf48-208ENST00000395788 CLGNO14967 610 aa5.8□□□□□ -1.48
C6orf48-208ENST00000395788 PI15O43692 258 aa5.8□□□□□ -1.48
C6orf48-208ENST00000395788 PRMT3O60678 531 aa5.8□□□□□ -1.48
C6orf48-208ENST00000395788 KRT36O76013 467 aa5.8□□□□□ -1.48
C6orf48-208ENST00000395788 PDE5AO76074 875 aa5.8□□□□□ -1.48
C6orf48-208ENST00000395788 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
C6orf48-208ENST00000395788 APBB3O95704 486 aa5.8□□□□□ -1.48
C6orf48-208ENST00000395788 CAPNS1P04632 268 aa5.8□□□□□ -1.48
C6orf48-208ENST00000395788 RPN2P04844 631 aa5.8□□□□□ -1.48
C6orf48-208ENST00000395788 ASGR2P07307 311 aa5.8□□□□□ -1.48
C6orf48-208ENST00000395788 TBC1D3HP0C7X1 549 aa5.8□□□□□ -1.48
C6orf48-208ENST00000395788 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa5.8□□□□□ -1.48
C6orf48-208ENST00000395788 BCKDHAP12694 445 aa5.8□□□□□ -1.48
C6orf48-208ENST00000395788 HSD17B1P14061 328 aa5.8□□□□□ -1.48
C6orf48-208ENST00000395788 SLC2A4P14672 509 aa5.8□□□□□ -1.48
C6orf48-208ENST00000395788 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
C6orf48-208ENST00000395788 AMD1P17707 334 aa5.8□□□□□ -1.48
C6orf48-208ENST00000395788 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
C6orf48-208ENST00000395788 ME2P23368 584 aa5.8□□□□□ -1.48
C6orf48-208ENST00000395788 SLC6A2P23975 617 aa5.8□□□□□ -1.48
C6orf48-208ENST00000395788 TPMTP51580 245 aa5.8□□□□□ -1.48
C6orf48-208ENST00000395788 CCR5P51681 352 aa5.8□□□□□ -1.48
C6orf48-208ENST00000395788 KCNK10P57789 538 aa5.8□□□□□ -1.48
C6orf48-208ENST00000395788 YPEL5P62699 121 aa5.8□□□□□ -1.48
C6orf48-208ENST00000395788 RPL38P63173 70 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
C6orf48-208ENST00000395788 MS4A2Q01362 244 aa5.8□□□□□ -1.48
C6orf48-208ENST00000395788 HMGCS1Q01581 520 aa5.8□□□□□ -1.48
C6orf48-208ENST00000395788 PRKCQQ04759 706 aa5.8□□□□□ -1.48
C6orf48-208ENST00000395788 SLC34A1Q06495 639 aa5.8□□□□□ -1.48
C6orf48-208ENST00000395788 KRTAP1-1Q07627 177 aa5.8□□□□□ -1.48
C6orf48-208ENST00000395788 MTAPQ13126 283 aa5.8□□□□□ -1.48
C6orf48-208ENST00000395788 LAPTM5Q13571 262 aa5.8□□□□□ -1.48
C6orf48-208ENST00000395788 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
C6orf48-208ENST00000395788 NFATC4Q14934 902 aa5.8□□□□□ -1.48
C6orf48-208ENST00000395788 RPS6KA2Q15349 733 aa5.8□□□□□ -1.48
C6orf48-208ENST00000395788 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
C6orf48-208ENST00000395788 SWI5Q1ZZU3 235 aa5.8□□□□□ -1.48
C6orf48-208ENST00000395788 MMEL1Q495T6 779 aa5.8□□□□□ -1.48
C6orf48-208ENST00000395788 VPS26BQ4G0F5 336 aa5.8□□□□□ -1.48
C6orf48-208ENST00000395788 PAGE3Q5JUK9 113 aa5.8□□□□□ -1.48
C6orf48-208ENST00000395788 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
C6orf48-208ENST00000395788 WLSQ5T9L3 541 aa5.8□□□□□ -1.48
C6orf48-208ENST00000395788 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa5.8□□□□□ -1.48
C6orf48-208ENST00000395788 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa5.8□□□□□ -1.48
C6orf48-208ENST00000395788 GALNT18Q6P9A2 607 aa5.8□□□□□ -1.48
C6orf48-208ENST00000395788 NXPE4Q6UWF7 544 aa5.8□□□□□ -1.48
C6orf48-208ENST00000395788 DLEU7Q6UYE1 221 aa5.8□□□□□ -1.48
C6orf48-208ENST00000395788 WASH2PQ6VEQ5 465 aa5.8□□□□□ -1.48
C6orf48-208ENST00000395788 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa5.8□□□□□ -1.48
C6orf48-208ENST00000395788 LPCAT2Q7L5N7 544 aa5.8□□□□□ -1.48
C6orf48-208ENST00000395788 SYT13Q7L8C5 426 aa5.8□□□□□ -1.48
C6orf48-208ENST00000395788 FAM129CQ86XR2 697 aa5.8□□□□□ -1.48
C6orf48-208ENST00000395788 CACUL1Q86Y37 369 aa5.8□□□□□ -1.48
C6orf48-208ENST00000395788 RIMKLAQ8IXN7 391 aa5.8□□□□□ -1.48
C6orf48-208ENST00000395788 SLC15A3Q8IY34 581 aa5.8□□□□□ -1.48
C6orf48-208ENST00000395788 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP5.8□□□□□ -1.48
C6orf48-208ENST00000395788 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
C6orf48-208ENST00000395788 TMEM145Q8NBT3 493 aa5.8□□□□□ -1.48
C6orf48-208ENST00000395788 PHC3Q8NDX5 983 aa5.8□□□□□ -1.48
C6orf48-208ENST00000395788 ABHD11Q8NFV4 315 aa5.8□□□□□ -1.48
C6orf48-208ENST00000395788 OR4K1Q8NGD4 311 aa5.8□□□□□ -1.48
C6orf48-208ENST00000395788 GANCQ8TET4 914 aa5.8□□□□□ -1.48
C6orf48-208ENST00000395788 SELENOMQ8WWX9 145 aa5.8□□□□□ -1.48
C6orf48-208ENST00000395788 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
C6orf48-208ENST00000395788 NEIL2Q969S2 332 aa5.8□□□□□ -1.48
C6orf48-208ENST00000395788 TESCQ96BS2 214 aa5.8□□□□□ -1.48
C6orf48-208ENST00000395788 LRRC58Q96CX6 371 aa5.8□□□□□ -1.48
C6orf48-208ENST00000395788 ASB9Q96DX5 294 aa5.8□□□□□ -1.48
C6orf48-208ENST00000395788 BMFQ96LC9 184 aa5.8□□□□□ -1.48
C6orf48-208ENST00000395788 ANKRD27Q96NW4 1050 aa5.8□□□□□ -1.48
C6orf48-208ENST00000395788 HBEGFQ99075 208 aa5.8□□□□□ -1.48
C6orf48-208ENST00000395788 HAUS8Q9BT25 410 aa5.8□□□□□ -1.48
C6orf48-208ENST00000395788 EFCAB11Q9BUY7 163 aa5.8□□□□□ -1.48
C6orf48-208ENST00000395788 C1orf50Q9BV19 199 aa5.8□□□□□ -1.48
C6orf48-208ENST00000395788 OSBPL6Q9BZF3 934 aa5.8□□□□□ -1.48
C6orf48-208ENST00000395788 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
C6orf48-208ENST00000395788 PCBD2Q9H0N5 130 aa5.8□□□□□ -1.48
C6orf48-208ENST00000395788 ELOVL6Q9H5J4 265 aa5.8□□□□□ -1.48
C6orf48-208ENST00000395788 NT5DC2Q9H857 520 aa5.8□□□□□ -1.48
C6orf48-208ENST00000395788 S100A14Q9HCY8 104 aa5.8□□□□□ -1.48
C6orf48-208ENST00000395788 SPAG4Q9NPE6 437 aa5.8□□□□□ -1.48
C6orf48-208ENST00000395788 WASH6PQ9NQA3 447 aa5.8□□□□□ -1.48
C6orf48-208ENST00000395788 GPR27Q9NS67 375 aa5.8□□□□□ -1.48
C6orf48-208ENST00000395788 TM7SF3Q9NS93 570 aa5.8□□□□□ -1.48
C6orf48-208ENST00000395788 GID8Q9NWU2 228 aa5.8□□□□□ -1.48
C6orf48-208ENST00000395788 EBF1Q9UH73 591 aa5.8□□□□□ -1.48
C6orf48-208ENST00000395788 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa5.8□□□□□ -1.48
C6orf48-208ENST00000395788 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
C6orf48-208ENST00000395788 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa5.8□□□□□ -1.48
C6orf48-208ENST00000395788 DUSP12Q9UNI6 340 aa5.8□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 80.1 ms